Тайная экспедиция, низведенная Павлом I до уровня почтовой конторы, была не в силах предотвратить цареубийства.
На пути реформ
2 апреля 1801 года в Сенате Александр I огласил манифест об упразднении Тайной экспедиции. В его решении имелся двоякий смысл: с одной стороны он распустил спецслужбу, которая не смогла предотвратить заговор против его отца, а с другой — то был знак для либеральной части общества, что с «наушничеством» покончено.
Подобное положение дел долго продолжаться не могло. Не желая повторять участь отца, 8 сентября 1802 года Александр I издал манифест «Об учреждении министерств». На его основе было создано Министерство внутренних дел. Первым его руководителем стал друг императора граф П. Кочубей. Спустя год, в 1803 году Указом императора «О средствах к исправлению полиции в городах» были учреждены в Петербурге — Тайная полицейская экспедиция, а в Москве — Особая секретная полиция.
Главное их предназначение, как было написано в Указе, заключалось в том, что
Обе структуры работали автономно и не входили в состав МВД. Этим решением Александр I создал систему, которая позволяла ему получать информацию по двум независимым каналам и обеспечивала действенный контроль за работой каждой из структур.
Угроза предстоящей войны с Францией вынудила императора создать еще один специальный орган. В начале января 1807 года он учредил Особый комитет. В его функции входила координация деятельности Тайной полицейской экспедиции, Особой секретной полиции, а также МВД в сфере внешней и внутренней безопасности России. На рассмотрение Особого комитета выносились дела по преступлениям «клонящимся к нарушению общественного спокойствия». Возглавил Комитет министр юстиции князь П. Лопухин. В его состав вошли министр внутренних дел князь В. Кочубей, сенаторы Н. Новосельцев и А. Макаров.
25 июля 1811 года было образовано министерство полиции, а в его недрах создана Особая канцелярия. Первым ее начальником стал опытный контрразведчик, прошедший хорошую школу в Тайной экспедиции Я. де Санглен. На нее возлагались функции: «ведать делами по ведомству иностранцев и заграничными паспортами, цензурной ревизией», позже политического сыска. Глава Особой канцелярии был наделен правом непосредственного доклада императору без согласования с министром и исполнял его личные указания по надзору за высшими государственными чиновниками.
Одно из таких указаний касалось статс-секретаря М. Сперанского — большого поклонника Наполеона и сторонника французской системы государственного устройства. В результате контрразведывательной работы в марте 1812 года Сперанский был освобожден от должности, отправлен в отставку и сослан в Нижний Новгород.
Угроза надвигающейся войны с Наполеоном подтолкнула Александра I и его окружение к созданию в армии специального централизованного органа, который бы осуществлял разведку неприятеля. 27 января 1812 года император утвердил «Образование Высшей воинской полиции при армии». В ее Положении было определено: