Что касается других модификаций БТР-80, то в первую очередь стоит упомянуть командирский бронетранспортер БТР-80К, предназначенный для командира мотострелкового батальона. Для работы офицеров оборудовано три рабочих места. На машине установлены две радиостанции Р-163-50У, 11-метровая телескопическая мачта, навигационная аппаратура ТНА-4-6 с индикаторным планшетом. Две выносные УКВ-радиостанции Р-159.
Заслуживает упоминания бронированная медицинская машина БММ-80 (ГАЗ-59039) «Симфония». Кроме экипажа, в ней возможна перевозка семи раненых в медицинском отделении и двух на крыше на носилках. В зависимости от состава медицинского и санитарно-хозяйственного имущества БММ может использоваться для эвакуации раненых с поля боя (БММ-1), как медпункт батальона (БММ-2) и подвижная перевязочная с врачебной бригадой и комплексом автоперевязочной АП-2 (БММ-3).
Кроме того, на шасси БТР-80 создана командно-штабная машина БТР-80КШ (ГАЗ-59032), бронированная ремонтно-эвакуационная машина БРЭМ-К (ГАЗ-59033), машины радиационной и химической разведки РХМ-4 (РХМ-4-01) и РХМ-6, бронированная машина для разведывательно-поисковой деятельности (предназначена для поиска, обнаружения и определения места локальных и радиоактивных и химически опасных аномалий) РПМ-2, унифицированное шасси К1Ш1, коротковолновая радиостанция оперативно-тактического звена управления Р-165Б, подвижной пункт управления ПУ-12М7 батареи ЗРК, подвижной пункт управления ПУ-12М6 батареи ЗРК, подвижной командно-наблюдательный пункт ПКНП «Кушетка-Б», станция спутниковой связи, звуковещательная станция и другие.
Следует отметить, что процесс создания новых модификаций на базе БТР-80 продолжается. Так, например, на форуме «Армия-2015» был представлен ПТРК «Квартет-М» с пусковой установкой 9П163-2М на шасси бронетранспортера БТР-80. Он разработан в Тульском конструкторском бюро приборостроения (КБП). В состав комплекса входят четыре ПУ ПТУР «Корнет», пулемет ПКТМ и автоматический гранатомет АГ-30.
Бронетранспортеры БТР-80 начали поступать на вооружение мотострелковых частей Советской Армии, морской пехоты ВМФ, пограничных и внутренних войск в середине 1980-х годов. Впервые на военном параде в Москве они были показаны 7 ноября 1987 года.
БТР-80 применялись советскими войсками в Афганистане, использовались практически во всех «горячих» точках на территории СССР и СНГ Бронетранспортеры БТР-80 различных модификаций использовались Российской Армией, внутренними войсками МВД и милицией в ходе боевых действий на Северном Кавказе. Они состояли на вооружении российских контингентов сил ООН в Боснии и Косово.
Следует отметить, что во всех этих случаях бронетранспортеры использовались не по назначению. БТР-80 — это армейский бронетранспортер, а не бронированная патрульная машина. Он в принципе не предназначен для ведения противопартизанских (полицейских) операций, борьбе с терроризмом и преступностью. Наличие этой машины на вооружении внутренних войск и милиции, а ныне Росгвардии и полиции, можно объяснить только отсутствием специально предназначенных для этих видов деятельности бронированных боевых машин.
Избыточна эта машина и для пограничных войск.
В настоящее время БТР-80 — самый массовый колесный бронетранспортер Российской Армии. В составе российских воинских частей БТР-80 принимали участие в операции по принуждении Грузии к миру в августе 2008 года. Они находятся на вооружении подразделений, обеспечивающих безопасность российских военных объектов в Сирии.
По состоянию на 2016 год бронетранспортеры БТР-80 состояли на вооружении в Азербайджане (БТР-80 и 70 БТР-80А), Алжире (150), Анголе, Армении (110), Бангладеш (155 БТР-80А), Белоруссии (153), Бурунди (10), Венгрии (328 БТР-80 и 120 БТР-80А), Венесуэле (114 БТР-80А), Грузии (16), Джибути (8 БТР-80А), Ираке (100 БТР-80А), Йемене, Казахстане (190 БТР-80 и 107 БТР-80А), Киргизии (10), КНДР (32 БТР-80А), Кот-д’Ивуаре (6), Республике Абхазия, Республике Корея (20), Македонии (12), Молдавии (11), Монголии (20), Нигерии (5), Пакистане, Сирии (30 ед. поставлено из России в период с декабря 2013 по март 2014 года), Судане (30 БТР-80 и 7 БТР-80А), Таджикистане, Туркмении (450 БТР-80 и 4 БТР-80А), Турции (в 1993 году поставлено из России 239 ед.), Узбекистане (210), Украине (свыше 230), Чаде (24), Шри-Ланке (25 БТР-80 и БТР-80А), Эстонии (15) и Южной Осетии. Состоят они на вооружении и армий самопровозглашенных Донецкой и Луганской народных республик.