В течение последних месяцев лета 1936 года S. 79 В, получив регистрационный код «I-AYRE», был отправлен в Аргентину с делегацией компании «SIAI», чтобы принять участие в конкурсе по выбору нового бомбардировщика для ВВС Аргентины. Бомбардировщик S. 79 В принял участие в программе летных испытаний, где его соперниками были германский Junkers Ju-86 и американский Martin I39W. Осенью 1937 года было объявлено, что победу в конкурсе одержал американский бомбардировщик и «I-AYRE» был отправлен назад в Италию.
Второй экземпляр S. 79B был оснащен двигателями Fiat A 80, мощностью 1000 л.с. каждый, которые устанавливались и на бомбардировщиках Fiat B.R. 20. Первый полет этой машины состоялся и ноябре 1936 года, самолет имел измененный «горб» с боковыми каплевидными обтекателями. Этот самолет был подготовлен для Ирака, который также разместил в Италии заказ на штурмовики Breda 65 с двигателями Fiat A 80.
Самолет, получивший серийный номер 100, был окончен в июле 1937 года, затем в начале 1938 года было собрано еще четыре (серийные номера 101-104). Самолеты 101-104 имели дополнительные застекленные окна в верхней секции носовой части, «горбы» схожие с теми, которые устанавливались на стандартных трехмоторных машинах, с большими двойными окнами и без каплевидных обтекателей. Самолет S. 79 В. номер 100 потерпел аварию летом 1937 года, после чего оставался в Италии для ремонта еще в течение почти двух лет, и был отправлен обратно в Ирак только в 1939 году. Королевские военно-воздушные силы Ирака быстро освоили этот довольно сложный для своего времени бомбардировщик, и они приняли участие в боевых действиях во время столкновений между иракскими вооруженными силами и британцами в мае 1941 года, однако S. 79 В были быстро выведены из строя истребителями RAF. Единственный оставшийся исправным самолет использовался в качестве транспортника, летая на Ближнем Востоке еще в течение нескольких дет.
Наиболее крупным импортером S. 79 стали Fortelor Arericnc Regal ale Romania - сокращенно FARR (ВВС королевской Румынии), заказавшие двадцать четыре S. 79 В. которые оснащались парой двигателей IAR К.. 14 мощностью 900 л.с. Эти двигатели строились в Румынии, и являлись лицензионной версией французского Gnome & Rhone 14K «Mistral Major». С незначительными изменениями, как, например, установка 7,92 мм пулемета в носовой части, они были поставлены в Румынию в период времени с весны 1938 года до весны 1939 года. Один перегоночный рейс, закончился трагически - погиб пилот-испытатель Бакула (Bacula) и бортинженер Мериззи (Merizzi). S. 79B находились па вооружении FARR к моменту нападения гитлеровской Германии на СССР, и довольно успешно применялись на Восточном фронте в течение 1941 года.
S.79 JR
В 1939 году Румыния заказала компании «SIAI» модификацию S. 79 В, с целью установки на него немецкого двигателя водяного охлаждения Junkers Jumo 211 Da, мощностью 1220 л.с., в соответствии с планами его лицензионного производства компанией «industria Aeronautica Romana» («IAR») в Брашове (Brasov), Румыния. Первый итальянский S. 79 JR (Junkers-romania) прилетел марте 1941 года, а партия из еще восьми самолетов, была поставлена в течение года. Максимальная скорость этой модификации составляла 444 км/час, а дальность с максимальным бомбовым грузом -1352 км. Иногда обозначаемый как J.R.S. 79В, этот бомбардировщик имел заново разработанные увеличенные стабилизаторы и руль направления. На нем, наконец, также отказались от гондолы на брюхе фюзеляжа, вместо этого округлая стрелковая точка, в которой был установлен пулемет* выпускалась через люк в брюхе фюзеляжа. Самолеты, построенные компанией «IAR», имели дополнительную пару больших окон в задней части фюзеляжа. В 1941 году постройка этих самолетов в РУМЫНИИ шла довольно быстро и к началу военных действий, румынские ВВС располагали более чем сотней этих машин, которыми вооружили три Squadron из Grupul 2. они эксплуатировались до 1944 гола. В 1948 году один из румынских S. 79 перелетел в Италию - на нем сбежал от коммунистического режима румынский пилот. Этот самолет был передан в испытательное подразделение на аэродром в Гуидони. в 1950 году он был сдан на слом.