Менее состоятельные пассажиры предпочли купить уценённые билеты. Среди них был, например, 17-летний Генри О'Коннер, печатник, и его овдовевшая мать. Джордж Досон, свободный афроамериканец, который работал швейцаром в гостинице и направлялся на восточное побережье. Оливер Пери Маунлов, ветеран золотоискатель, проведший на приисках три года. В его багаже находилась целя кипа поэм, которые он написал в ходе своих приключений.
Плата за проезд во всех классах судна была достаточно умеренной. В 1857 году билет первого класса на панамском маршруте стоил 300 долларов, второго — 250 долларов. Третий класс обходился пассажирам в 150 долларов, что было эквивалентно месячному заработку золотоискателя, который зарабатывал в среднем 5 долларов в день.
3 сентября «Сеньора» достигла Панамы. Пассажиры немедленно пересели на поезд Панамской железной дороги и через четыре часа были уже на атлантическом побережье в Аспинвиле, где их ждала «Центральная Америка». Этот пароход уже успел совершить 43 рейса в течение четырёх лет и считался вполне надёжным судном
Сорокатрехлетний капитан Уильям Льюис Херндон был офицером военно-морского флота Соединённых Штатов, как того требовали правила, принятые в американском почтовом пароходстве. Херндон был известен тем, что в 1851 году возглавил первую научную экспедицию по исследованию Амазонки от истока до устья. Многие пассажиры с нетерпением ожидали того момента, когда можно будет послушать рассказ о его приключениях в американских джунглях.
Помимо пассажиров на борт были приняты и ценности в виде 5200 золотых двадцатидолларовых монет, только что отчеканенных на монетном дворе в Сан-Франциско, и золотые слитки с калифорнийских приисков. Всего золото, доставленное на борт, оценивалось в астрономическую по тому времени сумму — более полутора миллионов долларов.
Вечером 3 сентября «Центральная Америка» покинула Аспинвиль, имея на борту 476 пассажиров, 102 члена команды и почти три тонны золота.
Переход до Кубы оказался успешным. Попутный ветер и спокойное море позволили пассажирам с удовольствием наслаждаться видами моря. После небольшой остановки в Гаване «Центральная Америка» 8 сентября вышла в море.
Однако погода уже на следующий день начала портиться. Поднялся сильный ветер.
К четвергу, 10 сентября, капитан Томас Бадджер, оказавшийся на «Центральной Америке» пассажиром, был вынужден признать, что судно попало в настоящий шторм Большинство пассажиров укрылись внутри судна, мучимые морской болезнью, вызванной сильной качкой. Судья Алонзо Касл Монсон позже писал: «Вечерние игры в карты и другие времяпрепровождения в каюте оказались совершенно невозможными». Это вызывало большое разочарование у судьи, большого любителя карточных игр. В этот день капитану Херндону, постоянному партнёру Монсона, было не до игры.
Если кто-то из пассажиров и спал той ночью, то утро они застали столь же бурным, что и в предыдущий день, а возможно, и хуже. В девять часов утра главный инженер Джордж Ашбай сообщил, что судно дало течь и быстро набирает воду. Возникла неразрешимая ситуация: вода прибывала и увлажняла уголь, а он был необходим, чтобы разжечь котлы, которые, в свою очередь, приведут в действие насосы для выкачивания воды. Сухого угля, однако не осталось, и поддерживать огонь в котлах было нечем
Остановка двигателя в условиях жесточайшего шторма грозила привести к тому, что судно станет совершенно неуправляемым. Усилия кочегаров оказались безнадежными. Вода постепенно заливала угольные бункеры, а вскоре заставила погасить огни в топках.
Буря усиливалась. Пароход с большим трудом держался на курсе. В 10 часов утра третий помощник капитана попытался поставить штормовой парус, но он вскоре был сорван ураганным ветром.
В полдень огонь в котлах погас. Сначала остановились колёса правого борта, затем левого. Корабль потерял возможность держать курс и стал игрушкой в руках стихии. Если и были к тому времени пассажиры, испытывавшие оптимизм, то после остановки двигателей иллюзий ни у кого не осталось.
Капитан Херндон призвал всех мужчин и пассажиров и членов команды помочь в спасении судна. Ведрами начали вычерпывать воду. Женщины в это время были размещены в салоне главной надстройки.
12 сентября принесло смешанные чувства и надежды и страха. Облака немного рассеялись, и пассажиры ободрились. Однако капитан лучше знал положение дел и стремился избежать паники на борту.
Судно всё больше и больше погружалось в воду. Лучом надежды стало появление на горизонте парусного судна, которое медленно дрейфовало в сторону «Центральной Америки». Этим судном оказался бриг «Марин» из Бостона под командованием капитана Хирама Берта.