Василий Иванович Кубарев занимался в аэроклубе и учился на врача. Но пилоты пользовались большим спросом, и он в 1939 году окончил авиашколу. В июне 1941 года он просился добровольцем на фронт, но руководство Армавирского лётного училища не отпустили своего инструктора. Лишь в ноябре на базе училища был сформирован 653 ИАП, укомплектованный инструкторами. Кубарев был назначен командиром 3-й эскадрильи, но полк вооружили устаревшими бипланами И-15 бис. 653 ИАП защищал Крым, и поскольку его машины были непригодны для ведения воздушного боя, их использовали в качестве штурмовиков, подвешивая под крыло пару 100-кг бомб или РС-82.
Несмотря на это, в начале 1942 года Кубарев сумел сбить Bf 109 – это была первая воздушная победа полка. Утром 8 мая 1942 года у аэродрома полка неожиданно появились немецкие танки, и пилотам пришлось срочно эвакуировать свои самолёты на Тамань. Вскоре потрёпанный полк отвели в Саратов, где он получил пополнение и перевооружился на Як-1.
В начале октября 1942 года 653 ИАП (с марта 1943 года – 65 ГИАП) вернулся к боевым действиям, войдя в состав 274 ИАД, действующей на Калининском фронте. Базировавшийся в Старой Торопе и участвовавший в боях в районе Холма и Великих Лук полк вначале «играл от обороны», пока его пилоты не освоились с новыми для себя самолётами. Но уже к декабрю они начали одерживать победы и одним из первых был Кубарев – 15-го он сбил самолёт противника.
Он возвращался с сопровождения разведчика Пе-2, но лишь колёса его самолёта коснулись земли, был получен приказ на взлёт. Была обнаружена группа Ju 88, направлявшихся к аэродрому. 11а полных оборотах Кубарев начал набирать высоту. У него было достаточно боеприпасов, но мало горючего. Он пошёл в лобовую атаку на ведущий самолет в группе, ведя огонь по правому двигателю бомбардировщика. После удачного попадания Ju 88 вспыхнул и полетел вниз. Строй немцев нарушился, и налёт был сорван. Кубарев приземлил свой истребитель на последних каплях горючего.
Несколько недель спустя Кубарев был тяжело ранен в ногу в результате несчастного случая с пистолетом, и в течение трёх месяцев ему пришлось лечиться. Но уже 8 июня 1943 года он сбил Fw 190, пытавшийся атаковать аэродром полка под Орлом, а 11 июня его жертвой стал другой истребитель.
Поскольку Брянский фронт, где служил Кубарев, был достаточно далеко от основных боёв под Курском, будущий ас сбил два самолёта до 12 июля 1943 года, когда началось Орловское контрнаступление. В 5:10 утра полк был построен в полном составе, при знамени, и был зачитан приказ о начале наступления. Затем последовали выступления командира полка и замполита, которые подчеркнули важность предс тоящей операции. В 6:00 полк поднялся в воздух. В этот день пилоты провели десять воздушных боёв и сбили пять самолётов, два из которых пришлись на счёт Кубарева.
На следующий день Кубарев вел шестёрку Яков, когда он увидел ниже своего самолёта небольшую группу из двух Ju 87 и четырёх истребителей сопровождения. Это не напоминало обычную немецкую тактику, поэтому Кубарев проявил осторожность. Он оставил пару Попова прикрывать сверху, а сам вместе со своим ведомым Хитровым, атаковал противника слева, в то время, как пара Гуськова атаковала его справа. Очередь Кубарева отправили на землю одну «Штуку», а другая исчезла в облаках. Именно тогда он увидел выше себя большую группу – 27 Ju 87 и 20 Fw 190 эскорта.
Он приказал Попову и Гуськову заняться бомбардировщиками, а его пара взялась за сопровождающие истребители. В завязавшемся бою Гуськов уничтожил два бомбардировщика, а Кубарев с Хитровым, используя вертикальный маневр, сбили два Fw 190. Паре Попова не удалось прорваться к бомбардировщикам, им пришлось довольствоваться победой над третьим Fw 190. Когда у советских пилотов стало заканчиваться горючее, Кубарев вывел свою группу из боя и без потерь вернулся на базу. Многие годы спустя он вспомнил об этом событии, как о самом ярком из своих боёв.
В ходе сражения за Орёл 65 ГИ АП одержал 68 побед, 32 из которых приходились на долю 2-ой эскадрильи Кубарева. К августу 1943 года он был уже майором, выполнил 114 боевых вылетов и провел 53 воздушных боя, в которых одержал десять побед. 28 сентября 1943 года Кубареву присвоили звание Героя Советского Союза, а несколько месяцев спустя он был назначен заместителем командира полка.