Арабской грамоте Сакен научился в ауле у муллы. Затем учился в русско-казахской школе при Спасском медеплавильном заводе, в которую поступил в 1905 г. Позже учился в Акмолинской начальной приходской школе и Акмолинском трёхклассном городском училище.
В 1912 г., ещё не закончив учиться, Сакен начал преподавать русский язык ученикам медресе.
21 августа 1913 г. Сейфуллин поступил в Омскую учительскую семинарию, где учился с Магжаном Жумабаевым (писатель, публицист, педагог, выходец из знатной семьи подрода Құдайберды рода атыгай племени Аргын).
В 1914 г. началась творческая и политическая деятельность Сейфуллина. Он издал в Казани свой первый сборник стихов «Өткен күндер» («Минувшие дни»). В сборник вошло около двадцати стихотворений о любви, родине, степной природе. Сакен участвовал в создании культурно-просветительского общества казахской молодежи «Бірлік» («Единство») в Омске и стал одним из его руководителей.
В 1916 г. Сакен работал в комиссии по переписке имущества 12 волостей Акмолинского уезда. Тогда же он написал стихотворение «Волнение», посвященное волнениям казахского народа в 1916 г.
С 1 сентября 1916 г. Сейфуллин преподавал в Бугулинской школе, в основании которой принимал самое непосредственное участие.
9 марта 1917 г. переехал в Акмолинск, где написал стихотворение приветствие Февральской революции «Спешно собрались мы в поход».
В апреле 1917 г. Сакен Сейфуллин создал общественно-политическое и культурное общество «Жас қазақ» («Молодой казах»). В июле 1917 г. Сакен участвовал в издании газеты «Тіршілік» («Жизнь»). На страницах этой газеты он критиковал алашордынцев с позиции партии большевиков.
С сентября 1917 г. Сейфуллин преподавал в новой русской-казахской школе Акмолинска трёхмесячные педагогические курсы.
После октябрьского переворота С. Сейфуллин написал стихотворение «Ану-ка, джигиты!», которое считается первым произведением казахской советской литературы.
27 декабря 1917 г. установилась Советская власть в Акмолинске. Сейфуллин избран членом Президиума Акмолинского Совета и уездной комиссии по образованию. В феврале 1918 г. он был принят в РКП (б). 1 мая 1918 г. состоялась премьера спектакля по пьесе С. Сейфуллина «Бақыт жолына» («На пути к счастью»).
4 июня 1918 г. власть в Акмолинске захватили белогвардейцы., Сейфуллин был арестован и 5 января 1919 г. отправлен с этапом из акмолинской тюрьмы в Петропавловск (одним из конвоиров был родственник Сакена). Провел в «вагоне смерти» атамана Анненкова 47 суток (24 января — 12 марта). В Омске, при помощи пленных австрийцев, он смог сбежать из колчаковской тюрьмы (3 апреля) и к июлю добрался до родного аула. Через два месяца был вынужден бежать в Аулие-Ата.
7 мая 1920 г., после захвата Акмолинска Красной Армией, он возвратился в город и его назначили помощником заведующего административным отделом Революционного комитета (ревкома).
На съезде Советов 26 июля был избран членом исполнительного комитета и назначен заместителем председателя Акмолинского исполнительного комитета Совета народных депутатов, заведовал административным отделом, а 12 октября избран членом президиума Центрального Исполнительного Комитета Киргизской АССР.
В ноябре присутствовал на VIII съезде Советов и слушал доклад В. И. Ленина о плане ГОЭЛРО. В 1921 г. член чрезвычайной комиссии по присоединению Акмолинской и Семипалатинской областей к Киргизской АССР.
13 июня 1922 г. был назначен заместителем народного комиссара просвещения республики и редактором республиканской газеты «Еңбекші қазақ» («Трудовой казах») (позже называлась «Социалистік Қазақстан», «Егемен Казахстан»).
В декабре 1922 г. III съездом Киргизской (Казахской) АССР РСФСР избран председателем Совета Народных Комиссаров республики (главой правительства Казахстана).
Несмотря на свою занятость Сейфуллин продолжал писать стихи и в 1922 г. вышел сборник стихов «Асау тұлпар» («Неукротимый скакун»), драмы «Қызыл сұңқарлар» («Красные соколы»).
23–30 декабря 1922 г. С. Сейфуллин делегат Х съезда Советов РСФСР и Всесоюзного учредительного съезда Советов СССР, провозгласившего создание Союза Советских Социалистических Республик, избран членом ЦИК. В апреле 1923 г. — делегат XII съезда РКП (б).
С. Сейфуллин, исполняющий обязанности ответственного редактора журнала «Қызыл Қазақстан» («Красный Казахстан», позднее «Ауыл коммуниси», «Казахстан коммуниси», «Акикат»). Издал в нем отрывки историко-мемуарного романа «Тернистый путь» и стихотворение «Ленин».
15 февраля 1923 г. в газете «Енбекшил казах» была опубликована статья Сакена Сейфуллина «Давайте называть казахов казахами, исправим ошибки», в которой он выступил за возвращение казахам исторического названия. После этой статьи советское руководство стало считать Сакена Сейфуллина националистом.