Несмотря на то что в ведомствах, отнесенных к первой группе, были созданы специальные подразделения, основным субъектом, осуществлявшим и продолжающим вести работу в данном направлении, являются органы внутренних дел, в частности их оперативно-розыскные службы. Специализация в этих подразделениях, по сути дела, началась с 1985 года, в то время, когда в структурах уголовного розыска на всех уровнях первоначально стали создаваться отделения, а с ноября 1985 года в некоторых регионах появились отделы по борьбе с групповой преступностью. Несмотря на неточность названия этого явления, работа, в сущности, велась против организованных преступных формирований общеуголовного профиля.
Только спустя три года в МВД СССР создается Шестое управление по борьбе с организованной преступностью, в территориальных управлениях формируются отделы. Образование специализированных подразделений было обусловлено необходимостью концентрации усилий целого корпуса оперативных сотрудников на данном направлении работы. В том числе для координации их деятельности.
За период с 1989 по 1990 год органами внутренних дел было выявлено и разоблачено на территории бывшего Советского Союза в пределах 3 тысяч организованных формирований. Из них в 1989 году — более 1,3 тысячи и в 1990 году — около 1,7 тысячи. Для сравнения: органами государственной безопасности за 1989 год было выявлено всего около 300 таких сообществ. При этом необходимо иметь в виду, что в их разоблачении принимали участие и сотрудники милиции.
Продолжавшийся рост наиболее опасных преступлений межрегионального характера обусловил необходимость принятия соответствующих мер. Когда в 1991 году создалось Главное управление по борьбе с наиболее опасными преступлениями, организованной преступностью, коррупцией и наркобизнесом, его возглавил известный борец с мафией Гуров, официальный оппонент по докторской диссертации Нещадимова. К этому времени наибольший опыт противодействия данному явлению уже был накоплен в органах внутренних дел Узбекистана и России, так как начиная с 1980-х годов оперативными сотрудниками милиции совместно с работниками государственной безопасности велась активная борьба с организованными группировками, совершавшими преступления в сфере экономики.
В связи с образованием МВД РСФСР в его структуре создается оперативно-розыскное бюро по борьбе с организованной преступностью. На местах формируются специализированные подразделения, включающие десять региональных и 67 местных оперативно-розыскных бюро. Подотделы, отделения и группы, кроме республиканских, краевых и областных центров, были образованы в 144 городах со сложной оперативной обстановкой. Стали создаваться специализированные следственные подразделения. Штатная численность ОРБ к этому времени возросла более чем в три раза и составила около 3,5 тысячи сотрудников, в том числе более 500 следователей.
В результате принятых организационных мер только за 1991 год сотрудниками оперативно-розыскных бюро в России было выявлено более 2,6 тысячи организованных преступных формирований. Почти такое же количество, какое разоблачено органами внутренних дел на территории бывшего СССР за 1989–1990 годы. По преступной направленности они имели следующую характеристику: 62 % составляли общеуголовные формирования; 22 % группировок совершали преступления в сфере экономики; более 16 % имели комбинированную структуру. Общая численность участников сообществ составила 15 тысяч человек. Можно считать, полнокровная дивизия. Приведенные цифры наглядно свидетельствуют о том, что организованная преступность стала набирать силу в период распада Советского Союза, а не в его бытность.
В это время принимаются меры по активизации работы по борьбе с организованными формированиями, действовавшими в сфере экономики, поскольку данное направление в криминальной среде стало постепенно приобретать приоритетный характер. В 1991 году было выявлено на 45 % больше организованных преступлений, совершаемых в сфере экономической деятельности, чем в предыдущем году. Разоблачено около 500 преступных сообществ, имевших коррумпированные связи с работниками органов власти и управления.
Спустя год начала создаваться система подразделений ОВД по борьбе с организованной преступностью и коррупцией, в которую вошли: Главное управление по организованной преступности; региональные управления при МВД, УВД; территориальные управления, а также ОРБ органов внутренних дел на транспорте; специализированные подразделения аппаратов Восьмого главного управления, следствия, исполнения наказания, оперативного поиска; лаборатория НИИ. В 1993 году специальный факультет Академии МВД России преобразовывается в Московский институт по подготовке сотрудников для борьбы с организованной преступностью. В Следственном комитете МВД России создается управление по расследованию организованных форм преступлений, в составе следственных подразделений формируются специализированные отделы.