Одним из самых важных арестов, состоявшихся в ноябре 1937 г., был арест архимандрита Кронида. Дело на него было открыто 11 ноября 1937 г., а через десять дней ноября бывший наместник Троице- Сергиевой Лавры был арестован и заключен в Таганскую тюрьму в Москве. Дело по обвинению архимандрита Кронида носило название «Ипполит». Это было связано с тем, что в доме, где на момент ареста жил наместник, более десяти лет проживал девяностотрехлетний старец, лаврский духовник и библиотекарь, много лет стоявший у святых мощей преподобного Сергия, «гробовой монах», игумен Ипполит, почитаемый, как человек высокой духовной жизни. Хотя старец и не был арестован, но связь с ним вменялась в вину всем проходившим по делу архимандрита Кронида. В дни, когда шло следствие, игумен Ипполит скончался. Из материалов дела следует, что в Загорске возникла «община монархически настроенных монахов бывшей Троице-Сергиевой Лавры», в том числе и вернувшихся из ссылки после первой волны арестов против представителей РПЦ в 1930-х гг. Крониду было поставлено в вину идейное руководство этой «контрреволюционной группировкой». Следствие считало, что он фактически оставался наместником Троице-Сергиевой Лавры, владел и пользовался печатью наместника. По его благословению благочинный округа назначал вернувшихся из ссылок и заключений монахов Лавры на приходы округа (им были устроены на приходы более пятидесяти иеромонахов). Пожертвования, которые приносили верующие архимандриту Крониду и игумену Ипполиту, посылались священнослужителям, находящимся в ссылках и тюрьмах. Дом, где нашел приют отец Кронид, в следственном деле называется «домашним монастырем» и «продолжением Лавры». В этом доме богослужения совершались по монастырскому чину, проходили тайные монашеские постриги. К архимандриту Крониду приезжала братия монастыря, вернувшаяся из ссылок и тюрем. Вдень ареста следователь Булыжников допросил отца Кронида.
Известны некоторые детали допроса, архимандрит отрицал, что продолжает руководить монахами бывшей Лавры, и объяснял посещение его монахами как бывшего руководителя и за советом. Он признавал себя монархистом, а советскую власть считал испытанием веры народа. От обвинения в участии в контрреволюционной деятельности архимандрит Кронид отказался и не назвал своих единомышленников и почитателей, ссылаясь на плохую память. Кажется, что эти протоколы относительно адекватно отражают реальное поведение его на следствии.
Вместе с архимандритом были осуждены по 1-й категории еще 10 человек из среды духовенства — Д. Ф. Баянов, Н. И. Монин, К. А. Бондаренко, Г. Н. Потапов, Л. П. Насонов, А. Б. Павлов, Г. Н. Черкалов, С. А. Крестьянинов, Г. С. Смирнов, И. П. Марочкин. Их обвинили в том, что они во главе с Кронидом и протоиереем Баяновым нелегально продолжали традиции монастырского общежития, оказывали помощь монахам, вернувшимся из ссылки после первой волны арестов против представителей РПЦ в 1933-х гг. и, более того, вели контрреволюционную агитацию. 7 декабря 1937 года тройкой НКВД СССР по Московской области им был вынесен приговор по ст. 58–10—11 УК РСФСР «активное участие в контрреволюционной монархической группе под руководством бывшего наместника лавры архимандрита Кронида» к расстрелу. Расстрел произошел 10 декабря 1937 г на Бутовском полигоне, где они и были захоронены.
Анализ хода массовых репрессий в Московской области, проведенный выше, показывает, что все эти аресты были, в известном смысле, «ноябрьской импровизацией» чекистов. Еще летом 1937 года расстрел этой группы священников не планировался. В самом деле, согласно букве приказа N 00447, арест тех, кто будет осужден по 1 — й категории, должен был пройти на первом этапе операции (в августе 1937 года). Иными словами, либо арест этих людей вообще не планировался, либо планировалось осуждение по 2-й категории. Скорее, первое, потому что аресты во второй половине ноября уже не планировались: только следствие и «тройка». Однако осенью, как мы помним, нарком указал московским чекистам, что борьба с верующими идет плохо. Одновременно они получили новые «лимиты Ежова», которые не прошли через письменную санкцию Политбюро. Именно так и была арестована «монархическая контрреволюционная организация церковников».