Меркулов в приказе от 7 июля 1945 года, объясняя, как заниматься церковными делами, обрушился на полковника Карина:
«В соответствии с решением правительства при Совнаркоме Союза ССР были образованы: 4 сентября 1943 года — Совет по делам русской православной церкви и 19 мая 1944 года — Совет по делам религиозных культов. Вышеназванные Советы имеют в республиках, краях и областях своих уполномоченных, утверждаемых бюро ЦК нацком-партий, крайкомов и обкомов ВКП(б).
НКГБ СССР известны случаи, когда некоторые местные органы используют институт уполномоченных в качестве прикрытия для проведения оперативных мероприятий по церковникам; берут под свой контроль работу уполномоченных и иногда выполняют их функции; без особых оснований вмешиваются в их распоряжения.
Сотрудник НКГБ УССР тов. Карин в церковных кругах Львовской области известен как исполняющий должность уполномоченного Совета по делам религиозных культов и в этом амплуа принимал неоднократно в облисполкоме представителей униатской церкви.
Открытое и прямое использование органами НКГБ института уполномоченных в своих целях может привести также и к утверждению среди церковников нежелательного мнения, что Совет по делам русской православной церкви и Совет по делам религиозных культов при СНК СССР являются «филиалами» органов НКГБ».
Сергей Савченко воспринял неожиданный выговор Москвы как личную обиду. Его подчиненные провели такую успешную комбинацию! Только что добились полного успеха — униатская церковь разрушена! За что же их подвергать публичной порке?
23 июля 1945 года Савченко отправил личное обращение Меркулову:
«Всеволод Николаевич!
Карин ни с кем из униатов ни одного раза не выступал как сотрудник НКГБ и, как это проверено, совершенно не известен им как сотрудник НКГБ. Прошу Вас оградить нас от повторения фактов извращения действительного положения вещей со стороны безответственно претенциозных, но мало компетентных ревизоров вроде тов. Бартошевича, которые не помогают в работе, а усложняют ее.
И без них тяжело работать.
С чекистским приветом,
Савченко».
Нарком защищал своего сотрудника, потому что тот работал под его непосредственным руководством, лично от него получал указания и ему же докладывал о каждом своем шаге. Сергей Тарасович Карин реализовывал продуманную наркомом комбинацию.
Но приказ Меркулова уже был доведен до сведения всего чекистского аппарата страны. Даже республиканский нарком оказался бессилен что-либо изменить. На карьере полковника Карина можно было ставить крест. Работу по окончательной ликвидации униатской церкви проводили другие. Они же и пожинали лавры.
Письмо Молотову осталось без ответа
16 июля 1945 года во Львове Хрущев проводил совещание с секретарями обкомов и чекистских управлений западных областей.
Глава Украины радовался:
— Об униатах. С ними получилось замечательно. Удар, который мы нанесли по Слипому, явился очень удачным. Нам нужно поддержать инициативную группу по переходу в православную веру. Из двух зол выбирают меньшее. Нам выгодно, чтобы униаты перешли в православную веру. Это позволит оторвать их от Рима…
Но униаты, которые не смогли примириться с уничтожением церкви, обратились к высшей власти. Священники — самым заметным из них был архимандрит Климентий Шептицкий — подписали письмо, адресованное заместителю председателя Совнаркома СССР Вячеславу Михайловичу Молотову:
«В результате ареста всего епископата греко-католической церкви в Западной Украине, как и целого ряда других священников, и вследствие запрещения взять на себя управление нашей церковью кому-нибудь из греко-католического духовенства, наши церкви оказались в очень ненормальном положении.
Мы не верим тому, чтобы правительство хотело нас преследовать за нашу веру, а все имеющиеся до сих пор факты «обращения в православие» считаем недоразумением своего рода, безответственными действиями. Поэтому во имя справедливости, во имя блестящей победы Советского Союза просим оставить нам, нашему народу и Западной Украине, ту свободу в церковных делах, которой мы пользовались сотни лет и на которую на основе советских законов мы имеем полное право».
Письмо было воспринято как враждебный акт недобитых противников советской власти. Заместитель начальника опергруппы наркомата госбезопасности Украины подполковник Погребной обратился к начальнику Львовского областного управления генерал-лейтенанту Воронину:
«Направляем копию заявления униатского духовенства в адрес заместителя председателя Совнаркома т. В.М. Молотова. Просим произвести установку и обеспечить серьезную разработку лиц, подписавших это заявление».
7 августа 1945 года Савченко доложил союзному начальству, что его подчиненные завели агентурное дело «Ватиканцы» на группу униатских священников, проводящих активную работу против воссоединения греко-католической церкви с православной. Завели дело на одиннадцать священников во главе с Климентом Шептицким.