Но Камар ад-Дин не был уничтожен. Как только тимуридская армия вернулась в Трансоксиану, он напал на Фергану, провинцию, принадлежащую Тамерлану, и разграбил город Андижан. Тамерлан в ярости помчался в Фергану и преследовал его через Узкенд и Яссийские горы до долины Атбаши, южного притока Верхнего Нарина. Углубившись в самое сердце Тянь-Шаня, Тамерлан попал в засаду, где его поджидал Камар ад-Дин, и вырвался из нее лишь благодаря личной храбрости, «копьем, боевой палицей, саблей и арканом», как пишет «Зафар-наме». Он снова обратил врага в бегство, после чего вернулся в Самарканд, где только что умер его сын Джахангир (1375–1376).
В следующие годы (1376–1377) Тамерлан совершил пятый поход против Камар ад-Дина. Он дал ему бой в ущельях к западу от Иссык-Куля и гнал до Кочкара на западной оконечности острова. Однако 1383 г. «Зафар-наме» датирует шестой поход Тамерлана против Камар ад-Дина, но и в этот раз хан остался неуловимым.
В 1389–1390 гг. Тамерлан сделал решающее усилие, чтобы покончить с моголистанскими кочевниками. В 1389 г. он во всех направлениях прошел район Или и Эмеля, к югу и востоку от озера Балхаш (Артек-Кул, как его называет «Зафар-наме») и вокруг Ала-Куля – местности, где позднее будут образованы российская Семиреченская область и китайский протекторат Тарбагатай, а в те времена составлявшей сердце Моголистана. Он обосновался там победителем и разослал свои летучие отряды по историческим степям, в которых прежде держали свой кочевой двор чагатайские и угэдэидские ханы, в нынешние району Кульджи и Чугучака, тогда как его авангарды гнались за монголами вплоть до Черного Иртыша, к югу от Большого Алтая. Затем его армия, двигаясь отдельными колоннами через горный массив Тянь-Шаня, прошла из бассейна Балхаша в бассейн Баграшкёля. Они соединились в долине Юлдуса, куда Тамерлан пришел по долине Кунгеса. По свидетельству «Зафар-наме», тимуридские авангарды зашли на восток еще дальше, до Кара-Ходжи, практически до Турфана.
Среди монгольских вождей, которых Тамерлан победил в этом районе, «Зафар-наме» называет Хизр-Ходжу, наследника династии Чагатаидов, свергнутого с трона узурпатором Камар ад-Дином и бежавшего, как мы знаем из «Тарих-и Рашиди», в самую восточную часть Туркестана (сначала в район Хотана, затем Лобнора), где пытался выкроить себе новое царство, одновременно обращая в ислам последних уйгуров Турфана. Хотя Камар ад-Дин был главным врагом Тамерлана, он без колебаний напал на Хизр-Ходжу, очевидно, из опасения, что дом Чагатая восстановит в Уйгуристане свои силы. Хизр-Ходжа был разбит и бежал в Гоби. Победитель Тамерлан собрал военный съезд в Чалихе, или Джалихе, нынешнем Карашаре, и раздал своим воинам добычу, захваченную у кочевников. «Зафарнаме» четко передает впечатление, что, обосновавшись в сердце Центральной Азии, он казался преемником Чингисхана. В действительности же он разрушил монгольское владычество над Восточным Туркестаном в тот самый момент, когда оно было уничтожено в Китае восшествием на трон династии Мин.
Перед тем как вернуться в Самарканд, Тамерлан послал с Юлдуса вперед своего сына Умар-шейха по дороге из Уч-Фермана (Уч-Турфана) и Кашгара. Нам неизвестно, последовал ли позже он с основной армией тем же маршрутом или вернулся с Юлдуса через Или, Чу и Талас.
Но и в этот раз, несмотря на то что Тамерлан принес разрушения вплоть до сердца Гоби, его главный враг, хан Камар ад-Дин, не был уничтожен. Едва тимуридская армия вернулась в Трансоксиану, Камар ад-Дин восстановил свою власть над Илийской долиной. Тогда, в 1390 г., Тамерлан послал против него армию, которая, выступив из Ташкента, прошла через Иссык-Куль, пересекла Или в Алмалыке, миновала Каратал и по пятам преследовала Камар ад-Дина вплоть до Черного Иртыша, где потеряла его след. Камар ад-Дин исчез на Алтае, «в краю куниц и соболей», и с тех пор о нем ничего не было слышно. Воины Тамерлана развлекались, выжигая каленым железом имя своего повелителя на алтайских соснах, а затем, следуя вдоль берегов Артек-Куля, то есть озера Балхаш, вернулись в Трансоксиану.
Исчезновение узурпатора Камар ад-Дина позволило Чагатаиду Хизр-Ходже получить трон Моголистана. Новый глава дома Дуглат, эмир Худайдад, племянник Камар ад-Дина, всегда бывший «легитимистом», первым призвал Хизр-Ходжу и обеспечил его реставрацию. Новый хан был непоколебимым в вере мусульманином. Мы видели, что, покорив Кара-Ходжу, нынешний Турфан, он силой заставил последних уйгуров перейти в ислам. Эти чувства сближали его с Тамерланом. Между двумя правителями был заключен мир, в результате которого Хизр-Ходжа, около 1397 г., отдал свою дочь в жены Тамерлану – этот брачный союз был ценен тем, что вводил славного выскочку в семью Чингизидов.