Вскоре ее могилка стала постоянным объектом многочисленного паломничества. Ехали к ней и верующие, и не верующие, страждущие, больные, обреченные, обиженные, отчаявшиеся, но всегда с надеждой на помощь и заступничество. Ехали со всех концов нашей страны, а также и других городов и стран, ближнего и дальнего зарубежья. На протяжении всего года, каждое тридцатое число месяца стало днем праздника памяти матушки Алипии, о чем она предсказывала при жизни.
И вот в связи с распространением почитания матушки Алипии в народе, появились группы людей, которые были заинтересованы, чтобы Матушка была как бы их собственностью.
Вспоминается такое событие. Приходим мы вместе с чадами к Матушке, а на ее могиле установлена железная клеть с дверями, на которых висит замок. К могиле не подойти и не прикоснуться. Что делать? Пришлось пролазить по земле под решеткой по-пластунски, чтобы проникнуть внутрь и приложиться к кресту. Снять эту решетку-склеп оказалось не так просто, для этого были созданы заинтересованными лицами всяческие препятствия, но стараниями духовных чад она была все-таки удалена.
Как и всякая святыня, могила Матушки стала привлекать внимание разных экстрасенсов, оккультистов, лжецелителей, которые приводили с собой своих клиентов и последователей. С ними также пришлось сильно побороться, убеждать людей опомниться и защитить могилу Матушки от осквернения.
Наряду с этим были случаи явного вандализма, так что даже пришлось снять верхний слой земли и насыпать новый.
Но самым громким стало дело, когда ночью группа людей была задержана правоохранительными органами при раскапывании могилы Матушки с целью извлечь ее гроб из могилы. Было открыто уголовное дело.
После этого чада решили охранять могилу днем, а для ночных дежурств привлекли специальную службу охраны, которую предоставила Татьяна Романовна Антонюк, заведующая сектором по вопросам религий и межнациональных отношений Секретариата Кабинета Министров Украины.
Посоветовавшись, духовные чада приняли решение добиваться перенести останки матушки Алипии в Голосеевский монастырь и написали ходатайство на имя наместника монастыря, а архимандрит Исаакий подал ходатайство на имя Блаженнейшего Митрополита Владимира, которое было утверждено положительно.
Начался очень сложный процесс сбора документов для эксгумации, который длился более полгода. Пришлось приложить немало усилий для этого. Часто сбор всех необходимых справок находился на грани срыва, так как документы были либо утеряны, либо уничтожены по причине давности. Восстановление требовало помощи многих учреждений, где нам шли навстречу.
И вот необходимые документы были собраны, и торжественный перенос останков матушки Алипии состоялся.
Я, Скидан Мария Александровна, бывшая 26 лет келейницей блаженной старицы, монахини Алипии, проживающая по адресу: г. Киев, улица Бурмистренко 6, корпус 2, кв. 21, заявляю, что в присутствии свидетелей Заброды Николая Александровича, Удовиченко Веры Федоровны, Ефименко Людмилы Петровны, Еременко Анны Романовны, Костюченко Лидии Васильевны матушка Апипия, незадолго до своей кончины, сказала нам такие слова: «Берегите гроб, как бы кости не украли,потом сделала паузу и добавила, и смотрите, как бы их не растащили».
Тогда ее слова мы не восприняли буквально и думали, что беречь гроб нужно в духовном смысле. Теперь мы поняли, что именно имела в виду матушка Алипия, когда совершился акт вандализма на месте ее упокоения на Лесном кладбище в октябре 2005 года.