Пушки
Хотя главным оружием подводной лодки были торпеды, субмарины времен Второй Мировой войны было принято дополнительно вооружать пушками. Пушки были двух типов: палубные и зенитные. Палубные пушки применяли для стрельбы по целям, недостойным пуска торпеды. Назначение зенитных пушек понятно из их названия.
Палубные пушки
У лодок класса Gato на палубе перед и позади рубки имелись усиленные площадки, предназначенные для установки пушек. Лишь немногие лодки несли сразу две пушки. На лодках могли стоять следующие орудия:
76,2-ммпушка (длина 50 калибров). Это была стандартная палубная пушка американских субмарин времен Второй Мировой войны. Она выпускалась во множестве модификаций, под разными обозначениями. Модификации различались между собой главным образом типом нарезки. Хотя пушка была проста в эксплуатации, она стреляла слишком легкими снарядами (13 фунтов — 5,9 кг), чтобы быть эффективной даже против небольших кораблей. Опыт заставил оснастить подводные лодки более мощной артсистемой.
102-ммпушка (длина 50 калибров). Первоначально устанавливалась на нескольких лодках класса S, позднее появилась и на лодках класса Gato. 102-мм пушка стреляла уже 33-фунтовыми (15-кг) снарядами. Главным недостатком пушки была высокая начальная скорость снаряда (884 м/с), из-за чего снаряд часто прошивал легкие цели навылет, не причиняя им серьезного вреда.
127-ммпушка (длина 25 калибров). Эта пушка имела ствол из нержавеющей стали, поэтому ей не требовалась заглушка на дульном срезе, что упрощало перевод пушки из походного в боевое положение. Пушка стреляла 54-фунтовыми (24,4 кг) фугасными снарядами с фугасным зарядом массой 2,55 кг. Начальная скорость снаряда 808 м/с. Эту пушку считали идеально соответствующей требованиям, предъявляемым к палубной артиллерии подводных лодок.
Зенитные пушки
Первоначально зенитную артиллерию ставили на надстройку, но некоторые лодки несли зенитную артиллерию на месте снятых палубных пушек.
7,62-ммпулемет Browning. Вездесущий «Браунинг» стал первым зенитным оружием, установленным на лодки класса Gato. Поначалу использовался пулемет со стволом водяного охлаждения, позднее появился вариант, охлаждаемый воздухом. Как правило, подводная лодка оснащалась несколькими пулеметами, которые ставили на станки по периметру рубки. Крупнокалиберный 12,7-мм «Браунинг» популярности не получил. Хотя он и был более эффективен при стрельбе по воздушным целям, он был и гораздо тяжелее и больше, что затрудняло его уборку в случае экстренного погружения.