Белецкий проложил Малиновскому путь к успеху на выборах. Он устроил так, что документы, связанные с судимостью Малиновского, были уничтожены и тот получил новый паспорт. Закон требовал незапятнанной репутации; кроме того, кандидат в депутаты обязан был иметь по меньшей мере полугодовой стаж работы у одного нанимателя. Когда у Малиновского испортились отношения с мастером на текстильной фабрике, где он работал, и он сказал Белецкому, что ему грозит увольнение, по приказу из охранки мастера арестовали и четыре месяца продержали за решеткой — пока Малиновского не выбрали в Государственную думу. К тому времени Белецкий лично руководил деятельностью Малиновского и встречался с ним в отдельных кабинетах роскошных ресторанов. Нередко Белецкий редактировал выступления Малиновского, включая и те, что были написаны Лениным; Белецкий и Малиновский вместе составляли заявления от имени большевиков, агент снабжал своего шефа партийными документами, с которых охранка снимала копии. Джунковский назвал Малиновского «личным секретным агентом» Белецкого и писал, что тот дал ему кличку Икс.
Изъяв компрометирующие документы из личного дела Малиновского, Белецкий и его сотрудник нарушили закон о выборах. Они допустили произвол, когда арестовали и упрятали в тюрьму фабричного мастера, который мог уволить Малиновского с работы. По словам Васильева, операция с Малиновским была в высшей мере необычной: никакому другому агенту не уделялось столько внимания. Когда Джунковского впоследствии спросили, знал ли он, что Малиновский не имел права участвовать в выборах, бывший товарищ министра внутренних дел ответил: «Если бы у меня были данные относительно Малиновского, то, конечно, он не прошел бы».
В течение 1913 г. подтвердились первые сомнения относительно благоприятного развития операции. Нет, Малиновскому не грозило разоблачение со стороны революционеров. Напротив, сотрудники охранки — правда, Белецкий к ним не принадлежал — начали подозревать, что Малиновский действует скорее в интересах большевиков, а не охранки. Такие же подозрения вызывала у них большевистская газета «Правда», редактором которой состоял другой агент охранки — Мирон Черномазов. Виссарионов писал, что считал Малиновского перебежчиком: «…когда я стал читать его выступления в Думе, я пришел к заключению, что нельзя более продолжать работать с ним»».
25 апреля 1913 г. В.Ф. Джунковский вступил в должность товарища министра внутренних дел и тотчас взялся за сокращение непомерно разросшейся сети секретных агентов, которая, с его точки зрения, уже не укладывалась в рамки целесообразности и законности. По его словам, директор Департамента полиции Белецкий отнесся к этому начинанию без всякого сочувствия, однако столь прочно обосновался в департаменте, что Джунковскому лишь в январе следующего года удалось добиться его отставки.
Джунковский принял общее руководство органами полиции, хорошо представляя себе методы работы и взгляды Белецкого, так как перед этим он семь с половиной лет занимал пост губернатора Москвы, и впоследствии, говоря о принципиальных разногласиях с Белецким по поводу секретных операций, он категорически отрицал, что правда о Малиновском была известна ему до смещения Белецкого.
Поскольку Белецкий, по словам его шефа, также признавал, что они придерживаются разных точек зрения, докучливый директор Департамента полиции, вспоминал Джунковский, намеренно «переутомлял меня всякой мелочью, испрашивая моего согласия на разные пустяки, стараясь этим отвлечь меня от главного, существенного». А когда Джунковский воспротивился «преступному» и «развращающему» использованию учащихся в роли осведомителей, которых заставляли доносить на своих товарищей (по этим доносам производились аресты в Петербурге после апрельских демонстраций 1913 г.), то, писал он, «как мне Белецкий ни доказывал необходимость этого, я не мог с ним согласиться». И Джунковский издал приказ, запрещающий вербовать осведомителей из числа учащихся; однако выяснилось, что не все приняли его к исполнению. По мнению Джунковского, «это было не без участия Белецкого. Я решил прибегнуть к крайней мере — виновные в неисполнении моего распоряжения были отчислены от своих должностей без всяких объяснений».
Джунковский утверждает также, что избавил от полицейских осведомителей армию. Особенно его огорчала причастность к агентуре командного состава, причем некоторые офицеры требовали, чтобы секретные агенты распространяли листовки и провоцировали волнения, дабы оправдывать аресты предполагаемых смутьянов. Военный министр В.А. Сухомлинов, по всей видимости, относился благосклонно к этим «ужасам», тем не менее Джунковский издал еще один приказ, запрещающий подобную деятельность, хотя и сомневался, что его станут выполнять.