Уже через короткое время благодаря ценности своих донесений Малиновский оказался агентом на особом положении. Ему было позволено передавать информацию по телефону, а не являться для бесед с курирующим его офицером на конспиративную квартиру. В охранке так безусловно доверяли Малиновскому, что даже освободили от психологической обработки, которой периодически подвергались ее агенты, когда отчитывались о выполнении заданий. Охранка тщательно оберегала Малиновского, и аресты тех, кого он выдавал, производились со всяческими предосторожностями, чтобы не скомпрометировать его. В один прекрасный день, опасаясь разоблачения связей Малиновского с петербургской охранкой, полиция «выслала» его из столицы.
Малиновский преспокойно перебрался в Москву и там продолжил свою агентурную деятельность. Его «арестовали» на улице, и, пока он содержался под стражей, у него состоялась личная встреча с П.П. Заварзиным — шефом Московского охранного отделения, после чего Малиновский стал его штатным агентом.
Заинтересованность тайной полиции в услугах Малиновского еще более возросла в связи с укреплением его положения в РСДРП. Две враждующие партийные фракции — большевики и меньшевики — соперничали за влияние среди рабочих. Малиновскому были хорошо знакомы все тонкости этой борьбы, так как еще в Петербурге ему пришлось отражать попытку большевиков захватить руководство профсоюзом металлистов. Белецкий высоко ценил осведомленность Малиновского во внутрипартийных делах, а особенно его способность точно анализировать сведения о партии, поступающие от заграничной агентуры. Теперь, однако, пришло время иначе использовать информацию Малиновского. Со стороны Белецкого «Малиновскому были даны указания, чтобы он по возможности способствовал разделению партии».
У руководителей охранки родился необычный план — ускорить этот процесс. Малиновскому предстояло участвовать в выборах в Государственную думу в качестве кандидата от московских рабочих. И охранка решила помочь ему добиться победы на выборах.
Белецкий сообщает, что первым эту идею подал в разговоре с ним новый начальник Московского охранного отделения А.П. Мартынов и случилось это в 1912 г., незадолго до выборов в IV Государственную думу. По словам же А.Т. Васильева, который был последним шефом охранки, замысел этого «пустячного дела» целиком принадлежал Белецкому.
Как бы то ни было, Белецкому идея понравилась, но, прежде чем приступить к ее осуществлению, он испросил согласия начальства: «…ввиду серьезности дела я переговорил по телефону с Золотаревым (И.И. Золотарев — товарищ министра внутренних дел. —
По заданию охранки Малиновский переметнулся от меньшевиков к большевикам, за короткое время стал заметной фигурой в более радикальной, ленинской фракции и был избран членом Московского комитета партии. От Малиновского больше не требовали доносить на своих товарищей, он лишь ставил Белецкого в известность о последних партийных решениях. А доносами на большевиков в московской организации занимались теперь другие агенты охранки.
В январе 1912 г. Малиновский в качестве делегата от Москвы отправился на большевистский съезд в Прагу (билет на поезд предоставила ему охранка), заранее зная, что Ленин собирается провести выборы Центрального Комитета своей фракции — вместо того, что был избран из числа членов обеих фракций на предыдущем съезде РСДРП. Взяв в Праге сторону Ленина, Малиновский добился своего избрания в члены большевистского ЦК и выдвижения своей кандидатуры на участие в следующих выборах в Государственную думу. Малиновский не только вошел в руководство партии большевиков, но и стал как бы главным представителем Ленина в России как раз в то время, когда рабочее движение вступило в новую фазу.
После революции 1905 г. правительство существенно ограничило рабочих в выборе форм организованной борьбы. Однако с 1910 г. вновь началось бурное развитие промышленности, к рабочим вернулась прежняя уверенность в своих силах, и они начали предъявлять требования хозяевам предприятий. Затем произошло событие, в результате которого рабочее движение приобрело угрожающий размах. В апреле 1912 г. войска открыли огонь по бастующим рабочим Ленских золотых приисков. По центральным промышленным районам России прокатилась волна протестов и демонстраций. В 1912 г. в стачках участвовали три четверти миллиона рабочих, а в 1913 г. бастующих было еще больше. Почуяв опасность, руководители охранки решили во что бы то ни стало предотвратить объединение большевиков и меньшевиков в общую рабочую партию.