Особое внимание при проектировании уделили броневой защите машины, поскольку главным недостатком современных схем броневых конструкций являлась их однотипность, заключавшаяся в применении одного лишь типа стальной гомогенной брони. Металлургические возможности ее усиления уже давно себя исчерпали, а конструктивные возможности ограничивались лишь применением углов наклона отдельных броневых деталей. Поэтому корпус новой машины должен был иметь ряд особенностей по сравнению с существующими танковыми корпусами. Ограниченная масса и небывало высокие требования к броневой защите делали задачу создания танка «Объект 279» исключительно трудной.
Полигонные испытания экспериментального бронекорпуса среднего танка «Объект 907», проведенные в 1954 г., показали, что дифференциальное бронирование при переменных углах и толщинах позволяло сохранить достаточные внутренний объемы корпуса при его высокой сопротивляемости к действию бронебойных и кумулятивных снарядов.
Были проведены исследования нового конструктивного типа бронирования из литой брони криволинейной формы и переменного сечения с применением максимально-возможных (по условиям компоновки) углов наклона брони к предполагаемому направлению обстрела. Результаты полигонных испытаний бронекорпуса среднего танка «Объект 907» подтвердили целесообразность и перспективность выбранного направления, а дальнейшие работы при проектировании броневой защиты тяжелого танка «Объект 279» из криволинейной («чечевицеобразной») брони переменного сечения подтвердили эти выводы.
Этим не исчерпывались перспективы развития конструктивной брони. В броневой лаборатории ЛФТИ АН исследовали возможность использования в броневой защите танков не только стальных, но и неметаллических материалов. Установили, что из нескольких пластичных металлических преград наименьшей массой (при одинаковой стойкости) обладала броневая защита из алюминиевых сплавов. Так, например, по отношению к преграде из стальной гомогенной брони высокой твердости выигрыш по массе брони из алюминиевого сплава В-95 составлял около 35%. Значительно большую способность к сопротивлению внедрения кумулятивной струи имели хрупкие материалы, особенно стекло и кварц. Наилучшие результаты показало стекло, которое в лабораторных опытах продемонстрировало выигрыш по массе по сравнению со стальной броней порядка 70%. Однако преимущества хрупких материалов, выявленные в лабораторных опытах, уменьшались по мере увеличения зарядов и, соответственно, толщин преграды. Это было связано с раздроблением и разбрасыванием материала хрупкой преграды впереди фронта действия кумулятивной струи.
Во ВНИИ-100 развернули НИР по определению поражаемости литой брони новой конструктивной формы танка «Объект 279», в которой использовали результаты обстрела на НИИБТ полигоне цельно-литого броневого корпуса среднего танка «Объект 907», произведенного в марте-апреле 1956 г.
Техническое совещание по обсуждению эскизного проекта броневой защиты танка «Объект 279» состоялось 25 июля 1956 г. Конструкция броневой защиты в целом получила одобрение (при условии устранения некоторых замечаний). Для испытаний обстрелом изготовили элемент корпуса машины, а совместно с Мариупольским заводом им. Ильича – экспериментальный образец корпуса и башни.
Что касается моторной установки, то провели исследования второй ступени очистки воздухоочистителя и выбор оптимальных параметров его инерционных аппаратов с целью снижения их габаритов и массы.
В связи с тем, что система охлаждения нового танка должна была отводить тепла в 1,8 раза больше, чем в танке Т-10 (до того эжекционные системы охлаждения не применялись для отвода столь больших количеств тепла), на двигателе В12-5 испытали выпускную систему эжекторной установки. Изготовили и испытали также затылочный эжектор, модель эжектора с изгибом диффузоров, а также топливо-маслоподкачивающие агрегаты, включая маслонасосы ГМТ.
Особенность действия эжекторов, рассчитанных на работу с двигателем мощностью 735,3 кВт (1000 л.с.), заключалась в больших расходах газа и необходимости применения высокого противодавления. При этом одной из задач являлось предварительное исследование работы эжектора на повышенных противодавлениях.
Для возможности пуска двигателя в условиях низких температур окружающего воздуха предусматривалось использовать обогреватель в виде комплексной установки, состоявшей из газовой турбины, электрогенератора и теплообменного устройства (при этом должен был обеспечиваться нагрев охлаждающей жидкости в двигателе до +80-85"С за 30-40 мин работы обогревателя в условиях окружающей температуры до -40'С). Одновременно намечалось осуществить кондиционирование воздуха в боевом отделении.