Внеплановая подготовка Д-1 в Мотовском заливе английскими разведчиками могла быть воспринята как подготовка в «Basis Nord» новой «нацистской» подводной лодки, готовящейся для действий на тихоокеанских коммуникациях стран Британского союза. К этому времени о местонахождении «Базис Норд» британская разведка знала с высокой достоверностью — от захваченных в плен моряков из экипажей судов снабжения и метеосудов. Тем более что и сам район Мотовского залива английские разведчики знали неплохо: еще в 1930-е годы боевые корабли Королевских ВМС, охранявшие в Баренцевом море британских рыбаков, пополняли здесь запасы пресной воды и отстаивались в непогоду. Только в марте-апреле 1930 года, по сводкам Главного управления погранохраны и войск ОГПУ, английский легкий крейсер «Katedio» заходил в Мотовский залив более пяти раз, «исчезая» здесь почти на двенадцать часов. Более того, в августе 1937 года иностранная подводная лодка всплыла в надводное положение в Екатерининской гавани, прямо на глазах у краснофлотцев, строивших береговую казарму будущей Главной базы Северного флота. После обнаружения советским катером она погрузилась под перископ и ушла из Кольского залива. Позднее выяснилось, что ранее на мурманское побережье она высадила разведывательную группу, а затем незаметно для советских наблюдателей сняла разведчиков. Появление в районе Кольского или Мотовского заливов 13 ноября 1940 года британского подводного «охотника», который бы искал здесь подводные лодки Krigsmarine, совершенно реально. Как и то, что вполне реально могло произойти его случайное подводное столкновение с «Декабристом». О том, что тайная база нацистов в Западной Лице еще в сентябре официально закончила свою деятельность, на Британских островах не подозревали.
Как предполагаемые версии гибели Д-1 можно предположить:
— гибель Д-1 на минах, поставленных англичанами в советских территориальных водах (в Мотовском заливе или на входе в губу Большая Западная Лица). Правда, в зависимости от заинтересованности сторон эти мины могли быть как германскими из оборонительного заграждения «Базис Норд», так и английскими, установленными против кораблей, находившихся в секретной базе нацистов.
— командир неизвестной подводной лодки, чей перископ в 13.45 13 ноября 1940 года заметили наблюдатели поста Шарапов, возможную встречу в Мотовском заливе плавбазы «Умба» с подводной лодкой Д-1 посчитал подготовкой новой группы подводных лодок Krigsmarine для перехода на Дальний Восток или в Атлантику.
Сегодня есть все основания говорить о том, что Д-1, как «германская подводная лодка», могла быть торпедирована английской подводной лодкой — «охотником». Правда, приходится учитывать, что береговые наблюдатели или артиллеристы на ближайшем мысу Выев-Наволок при этом должны были не только услышать взрыв, но и увидеть почти двенадцатиметровый водяной султан или хотя бы яркую вспышку от взрыва. Однако они ничего не слышали и не видели и включились в поиски пропавшей подводной лодки только по команде от начальника штаба Северного флота.
— не исключено, что Д-1 погибла в результате ликвидационных мероприятий «Basis Nord». Для обеспечения скрытности эвакуация имущества базы должна была проводиться в период осенних штормов под покровом темноты. Особо способствовала этому наступающая полярная ночь, которая значительно сократила светлое время. Выход германских судов из Мотовского залива во время вечерних сумерек позволял немцам до рассвета выйти за пределы советских территориальных вод и надежно «оторваться» от побережья Кольского полуострова.
18 ноября в докладе командующего Северным флотом наркому ВМФ (по факту гибели подводной лодки) ничего не говорилось о выходящих судах, а также о судах или кораблях, которые, получив повреждения, могли вернуться в одну из бухт Мотовского залива (в том числе и в губу Большая Западная Лица). Для каждого из этих судов Д -1, после выполнения учебной задачи поднявшаяся в надводное положение перед германским транспортом, в темноте, благодаря заметному смещению к корме ограждения прочной рубки, могла легко сойти за британскую подводную лодку, а спутать гражданскому моряку советский «Декабрист» с английской подводной лодкой тип «Proteys», «U» или «Н», даже днем было совсем несложно. Скорее всего, если это был таран, то он был случайным. За то, что немцы не знали о потоплении Д-1, говорит следующее: 30 апреля 1941 года германский военно-морской атташе подготовил доклад в Генеральный штаб о наличии в составе Северного флота трех подводных лодок тип «Д».