Геополитическим результатом стало то, что правитель Египта утвердился на восточных берегах Красного моря, вступив в противоборство с великой державой - Великобританией, которая первоначально поддерживала его действия против непокорных ваххабитов. В 1839 г. англичане заняли порт Аден в Йемене и оказали давление на пашу с целью заставить его уйти из Аравии; этот период известен в дипломатической истории как Второй кризис Мухаммада Али. В 1840 г. паша был вынужден отступить. Его прямое нападение на Османскую империю в Сирии в 1831-32 гг. подтвердило его военную мощь (турецкая армия была разбита в декабре 1832 г. под Коньей), но также показало его политическую уязвимость. Когда наступил решающий момент, Великобритания, Австрия и Россия по своим собственным причинам предпочли сохранить Османскую империю, и только Франция поддержала Мухаммеда Али. В сентябре 1840 г. британский флот подверг бомбардировке египетские позиции на побережье Сирии и Ливана, а вскоре после этого австрийские и британские войска высадились в Сирии, когда турецкая армия наступала с севера. Столкнувшись с таким давлением, Мухаммед Али согласился на компромисс, по которому он признавался наследственным правителем Египта, но отказывался от претензий в Османской империи.
Это урегулирование никак не повлияло на политику и позиции Египта в Африке. При Мухаммеде Али и его преемниках власть "турецко-египетского" режима в Каире была распространена на весь Судан в ходе завоевательной кампании, в которой уникальным образом сочетались обученные в Европе военные подразделения с рабами, купленными на африканских рынках и обученными в качестве солдат. Однако через некоторое время паша понял, что призванные в армию египетские крестьяне воюют лучше, чем африканские рабы. Под египетским владычеством началась масштабная добыча минеральных богатств Судана, особенно золота. На суданцев стали распространяться необычные формы высокого налогообложения. Любое сопротивление суданцев безжалостно подавлялось. А на границе на рынках насилия появлялись новые военачальники, которые ложились дополнительным бременем на местное население.
В качестве предлога для дальнейшей экспансии хедив Исмаил использовал "политически корректную" цель - искоренение рабства, а для вытеснения египетской администрации на крайний юг Судана привлек легендарного генерала Чарльза Гордона (проявившего себя в 1860-х гг. в борьбе с китайскими тайпинами). Против этих двух целей в 1881 г. окончательно сформировалось мессианско-революционное движение с лидером Мухаммадом Ахмедом, которого оно считало долгожданным "Махди", или искупителем. Вскоре его силы установили контроль над большей частью Судана, а в 1883 г. уничтожили постоянную армию под британским командованием; Гордон, превысивший свои полномочия и сильно недооценивший противника, теперь оказался в полной изоляции в Хартуме. Сторонники Махди настигли его там в 1885 году. Его убийство подвело черту под египетской империей в Африке. Более слабая структура правления Махди опиралась на его харизматический авторитет и едва ли могла пережить его смерть. Сильнейшая засуха еще больше ослабила его власть, и лорд Китченер практически не встретил сопротивления, когда в 1898 г. вновь двинулся на завоевание Судана. Движение Махди возникло в результате противостояния египетско-европейским вторжениям и имело много характерных черт антиимперской реакции. В частности, захватчиков называли пришельцами - в данном случае "турками" - и нарушителями религиозных норм.