Действия фронтовой авиации и отдельного корпуса дальней авиации осуществлялись под единым руководством командующего ВВС Красной Армии маршала А. А. Новикова. Советская авиация безраздельно господствовала в воздухе. Она наносила массированные удары по объектам в глубине расположения противника, опорным пунктам и узлам сопротивления, мешавшим продвижению войск, поддерживала наступление наземных войск, нарушала управление и снабжение войск противника, вела воздушную разведку. Военнотранспортная авиация выполняла задачи по обеспечению войск горючесмазочными материалами и боеприпасами, по высадке воздушных десантов. Всего в кампанию на Дальнем Востоке советские ВВС, без учёта 5 тыс. самолётовылетов, не связанных с ведением боевых действий, осуществили 17 750 самолёто-вылетов: 10 100 боевых (в том числе 9 тыс. самолёто-вылетов совершили воздушные армии трёх фронтов) и 7650 небоевых. В боевых целях было совершено на разведку 25,7 % самолёто-вылетов, на удары по войскам, укрепрайонам и пунктам управления противника – 23,3 %, на удары по железнодорожным объектам – 13 %, на выполнение прочих задач – 32 % самолёто-вылетов. В небоевых целях 25 % самолёто-вылетов было осуществлено на перевозку горючего, 20 % на высадку десантов, 5 % на выброску боеприпасов, 16 % на перевозку других грузов, 34 % на выполнение прочих задач в интересах действующей армии и флота. На вражеские позиции и объекты было сброшено 3 тыс. т авиабомб (в том числе 2 тыс. т бомб сбросили воздушные армии фронтов), было перевезено 16 500 военнослужащих, 2777 т горючего, 563 т боеприпасов, 1500 т прочих грузов. В небе и на земле было уничтожено 64 японских самолёта. Кроме того, самолётами Дальневосточного управления Гражданского воздушного флота (ГВФ) в августе 1945 г. по заявкам действующей армии было совершено 439 самолёто-вылетов и перевезено 360 т военных грузов. Вместе с тем, на действия советской авиации оказало отрицательное влияние неудовлетворительное техническое состояние изрядной части авиапарка – большая часть имевшихся на Дальнем Востоке самолётов была «новых типов». Речь шла именно о самолётах «нового типа», а не о новых самолётах – на оснащение ВВС Дальнего Востока в 1941–1944 гг. зачастую поступали отнюдь не новые, а уже изрядно потрёпанные на фронтах войны с Германией истребители, бомбардировщики и штурмовики.
Воздушные десанты высаживались в завершающий период боевых действий. За исключением небольших парашютных десантов на Южный Сахалин и в Канко (Северная Корея), все они носили посадочный характер, причём в качестве десантных сил использовались отряды не воздушно-десантных, а моторизованных и инженерно-штурмовых войск (спецназ). Даже на Южный Сахалин на парашютах были сброшены морские пехотинцы. Для обеспечения высадки в сложных погодных условиях перед вылетом десанта к аэродрому посадки направлялся самолёт-разведчик, который передавал необходимые данные для перелёта и высадки десанта. После высадки десанты захватывали важные объекты до подхода сухопутных войск, а также участвовали в разоружении японских войсковых группировок. Высадка десантов в крупные города, административные и политические центры Маньчжурии и Северной Кореи ускорила капитуляцию Квантунской армии.
Дальневосточная кампания 1945 г. внесла значительный вклад в искусство операций военно-речных флотилий. Активные действия Краснознамённой Амурской военной флотилии выразились в захвате речных портов и прибрежных укреплённых пунктов противника, в обеспечении переправ через реки и высадке десантов, в содействии наступлению сухопутных войск 2-го Дальневосточного фронта. Взаимодействие сил Тихоокеанского флота и Северо-Тихоокеанской флотилии с сухопутными войсками 1-го и 2-го Дальневосточных фронтов заключалось в обеспечении южного фланга путём надёжной обороны побережья и действий на коммуникациях противника, в содействии войскам на материке осуществлением десантных операций на побережье Северной Кореи, Южном Сахалине и Курильских островах. Действия кораблей и авиации Тихоокеанского флота совместно с войсками 1-го Дальневосточного фронта и захват Северной Кореи лишили японское командование возможности маневрировать своими силами и средствами. В результате действий минно-торпедных сил и флотской авиации в портах Юки и Расин было потоплено 14 японских транспортов, танкер и буксир.