Украина – четверть века незалежности. Взгляд постороннего. Книга первая. 1991-1999 годы

15 мая 2001 года Леонид Кучма заявил, что знает имена убийц. На следующий день министр внутренних дел Юрий Смирнов объявил, что убийство не имеет политических мотивов и совершено «из хулиганских побуждений» двумя уголовниками, погибшими в декабре 2000 года.

23 ноября 2002 года Чрезвычайный и Полномочный Посол США на Украине заявляет, что у США нет сомнений в аутентичности записей, сделанных бывшим майором Государственной службы охраны Николаем Мельниченко в кабинете Президента Леонида Кучмы.

В 2002–2003 годах расследование гибели Гонгадзе возглавлял заместитель генпрокурора Украины Виктор Шокин, который заявил о причастности к убийству журналиста сотрудников МВД Украины.

22 октября 2003 года генеральный прокурор Святослав Пискун подписал ордер на арест генерала милиции Алексея Пукача и объявил, что расследование близится к завершению. Начальник департамента внешнего наблюдения МВД Украины генерал Пукач попал в поле зрения прокуратуры после того, как в ходе расследования выяснилось, что его подразделение вело слежку за журналистом. Генерала задержали в его рабочем кабинете и предъявили обвинение в злоупотреблении властью, что вызвало недовольство президента Кучмы;

29 октября 2003 года Кучма уволил генерального прокурора Святослава Пискуна и его заместителя Шокина; следственную группу переформировали, а Пукача выпустили на свободу, сняли с него все обвинения и отправили на пенсию. Генерал Пукач был выпущен из-под ареста в ноябре 2003 года и до 21 июля 2009 года находился в международном розыске.

04 ноября 2003 года в Киеве был взорван джип Toyota Land Cruiser, в котором находился В.К. Кисель, криминальный авторитет, которого считали причастным к пропаже Гонгадзе. Кисель выжил. СМИ классифицировали покушение на него как попытку уничтожить важного свидетеля по «делу Гонгадзе». Сам Владимир Карпович заявил: «К истории с Гонгадзе отношения не имею. Богом клянусь».

В июне 2004 года британская газета The Independent опубликовала материалы следствия, которые содержали показания заместителя главы Управления по борьбе с организованной преступностью Киевской области Игоря Гончарова, арестованного в 2003 году по обвинению в убийстве других лиц (банда оборотней), о том, что похищение и убийство Гонгадзе было осуществлено подконтрольными бандитами по указанию МВД, а именно, по приказу министра Юрия Кравченко от имени президента страны. Сам Гончаров долго после этого не прожил.