Прижизненное изображение другого сына Уайна Капака, Атауальпа, последнего императора инков, демонстрирует нам человека смешанной крови, что позволяет предположить, что он и Уаскара были сыновьями Уайна Капака от разных матерей. Уайна Капак наверняка имел несколько жен и зачал своих сыновей Уаскара и Атауальпа от разных. Разное происхождение двух братьев могло явиться причиной того, что между ними после смерти их отца, императора Уайна Капака, разгорелась смертельная вражда. До этого они оба вместе царствовали над империей инков в качестве соправителей. Сделанный в начале XVIII века портрет Корнилла Инка, проживавшего в Куско последнего дожившего до того времени потомка инкских правителей, показывает нам высокого мужчину с правильными чертами лица, глазами светлого оттенка, прямыми красновато-коричневыми волосами и длинным узким носом. Зарисовки, которые в начале XVII столетия сделал священник брат Мартин де Мурина, ясно показывают физические различия, которые разделяли представителей разных классов андского общества. Контраст между лицами и фигурами светлокожих аристократов и обладающих гораздо более темной кожей представителей низших, трудящихся классов настолько ярко выражен, что рисунки де Мурина кажутся изображениями двух совершенно чужих народов. Аристократы иностранного происхождения резко выделяются на фоне гораздо более многочисленного местного населения.
Наличие европейских черт лица, которые можно наблюдать на портретах правителей инков, подтверждается при изучении их сохранившихся физических останков, прежде всего мумий с кладбища Атакама. На головах этих мумий представителей правящей династии инков, умерших еще до испанского завоевания, сохранились густые, вьющиеся, светло-красновато-коричневые волосы. Волосы на головах мумий с полуострова Паракас, относящихся по крайней мере к четвертому тысячелетию до н. э. (поздний период культуры Сечин-Чавин) — рыжеватого красновато-коричневого цвета. В подземном музее Трухильо хранится неродившийся человеческий зародыш эпохи Чиму, на голове которого — волосы светлого цвета. Наиболее же впечатляющие примеры можно увидеть в Зале мумий Музея Эррера в Лиме Там в специальных герметично закрытых стеклянных контейнерах находятся прекрасно сохранившиеся мумии представителей правящей династии инков. Из дюжины мумий у четырех волосы — светло-коричневого оттенка, и у трех — светлые, как у блондинов, с примесью рыжего цвета. После смерти цвет и строение волос не меняются и не деградируют, а характерные для андской культуры методы мумификации также не могли привести ни к каким изменениям цвета волос умерших. Более того: изучение мумий с полуострова Паракас показывает, что это были люди гораздо более высокого роста, чем у аборигенов этих мест, и с черепами более узкого строения.
Педро Писарро, родной сын человека, покорившего в свое время империю инков, писал:
«Представители правящего класса индейцев, живших на территории Королевства Перу, были светлокожими, со светлыми волосами цвета спелой пшеницы. Большинство вельмож и их жен выглядели такими же белокожими, как и испанцы. В этой стране я встретил индейскую женщину с ребенком, которые оба обладали такой светлой кожей, что их едва ли можно было отличить от нас, белых людей. Их соотечественники называли таких людей «детьми богов»».
Тур Хейердал не мог не изумляться контрасту между теми людьми, которые когда-то возвели на территории Перу громадные пирамиды и храмы, и современными коренными жителями этой страны, чья культура и образ жизни казались происходящими из совсем другого источника. И действительно, индейцы Перу не заявляют, что ведут свое происхождение от инков, в легендах которых говорится, что сами они прибыли через много веков после того, как предки коренного индейского населения утвердились на территории Перу. Покоренные и истребленные испанцами великие зодчие Века Процветания андской цивилизации являются неразгаданной тайной Южной Америки. «Вопрос о том, откуда прибыл этот выдающийся народ, — пишет Уильям Прескотт, — и какой была его начальная история, относится к разряду тех загадок, с которыми мы столь часто сталкиваемся в истории Нового Света, и прошедшие годы и найденные за это время образцы древностей до сих пор сделали мало, чтобы ее прояснить».