Матросские отряды активно использовались для поддержания революционного порядка в городах, а также в только что сформированных советских учреждениях. В ряде случаев, при нехватке матросов, отряды формировались из солдат, но комиссарами в них назначались революционные матросы.
Кроме того, части и корабли, находившиеся в Петрограде и Кронштадте, постоянно выделяли отряды вооружённых матросов для выполнения заданий партийных и правительственных органов в столице. Так, 4 января 1918 года, по решению Кронштадтского Совета, для поддержания революционного порядка в Петрограде во время открытия Учредительного собрания был сформирован Кронштадтский сводный отряд. В него вошло около 600 моряков и солдат крепостных частей. Утром 5 января Кронштадтский сводный отряд под командованием комиссаров К.М. Каллиса, Л.К. Гримма и В.П. Громова убыл в Петроград в распоряжение секции Военно-морского революционного комитета Управления политической частью Морского министерства. До 10 января кронштадтцы участвовали в поддержании порядка в столице и ликвидации различных оппозиционных и контрреволюционных организаций, а 7 марта для нужд флота и гражданского населения доставили с юга 20 вагонов продовольствия и 18 вагонов угля. 18 декабря 1917 года директивой начальника Революционного полевого штаба по борьбе с контрреволюцией М.К. Тер-Арутюнянца, была создана Гомельская группа войск, объединившая все части, наступавшие на Киев и отрезавшие пути сообщения противнику. Особую ударную группу Гомельской группы войск, вместе с несколькими армейскими частями, отрядом красногвардейцев, бронепоездом и артиллерийской батареей составил и Сводный отряд матросов-балтийцев.
Ещё один Сводный морской отряд был сформирован в Петрограде в начале января 1918 года для поддержания порядка в Петрограде. В его состав вошло более 200 матросов флотских частей Петроградского гарнизона, а также прибывших из Гельсингфорса. Командиром отряда назначен член РСДРП (б) с 1905 года матрос Л.Я. Угрюмов. Отряд принимал участие в ликвидации антибольшевистского подполья и нёс патрульную службу в Петрограде. 16 января Сводный морской отряд был направлен на подавление мятежа 1-го польского корпуса. После прибытия в Могилев он вошёл в состав группы революционных войск под командованием И.И. Вацетиса. Вместе с другими частями этой группы матросы 30 и 31 января участвовали в разгроме 1-й польской дивизии и в освобождении города Рогачева. В феврале Сводный морской отряд стал основой для формирования Рогачевского отряда. Начальником был назначен матрос-большевик Л.Я. Угрюмов. Вскоре Сводный морской отряд вошёл в состав Западного революционного фронта по борьбе с контрреволюцией. А уже 6 января 1918 года командующий 1-м Минским революционным отрядом Р.И. Берзин обратился в Центробалт с просьбой о направлении в Гомель для усиления его войск дополнительно двух тысяч матросов. Выполняя эту просьбу, к середине января Управление политической частью Морского министерства сформировало 1-й Кронштадтский отряд матросов, численностью в 500 человек, который был направлен в Гомель.
В конце января 1918 года, по предписанию наркома по военным делам Н.И. Подвойского, Военно-морским революционным комитетом, был сформирован Сводный морской отряд, под командованием начальника управления политической частью Морского министерства матроса-большевика И.И. Вахрамеева. Перед отрядом была поставлена задача: навести революционный порядок в приволжском городе Рыбинске. Дело в том, что в Рыбинске находились значительные запасы различного снаряжения для Западного фронта, и возникла угроза их разграбления местным гарнизоном. В Сводный морской отряд вошли более ста матросов из флотских частей в Петрограде. Командиром был назначен начальник Управления политической частью Морского министерства И.И. Вахрамеев.
24 января 1918 года Центробалт по докладу члена комитета Д.Я. Пивена принял решение сформировать для поддержания революционного порядка в Петрограде ещё один отряд из 300 моряков из числа увольняемых в запас. Отряд был передан в распоряжение управляющего делами Совнаркома РСФСР В.Д. Бонч-Бруевича.
Для утверждения Советской власти и организации нового флота в 1918 году существенное значение сыграли, так называемые «отряды моряков особого назначения». К примеру, 28 февраля 1918 года в Петрограде при Военном отделе Наркомата по морским делам сформирован 1-й добровольческий Морской береговой отряд Красного флота (позже переименованный в 1-й Морской береговой отряд при Военном отделе Наркомата по морским делам). Командиром отряда назначен «человек Дыбенко» матрос-большевик Н.Т. Антропов. Отряд предназначался для выполнения специальных заданий военно-морского командования и первоначального строевого обучения добровольцев РККФ, т. е. сочетал в себе функции карательной организации и учебного отряда. К 10 марта 1918 года в четырёх ротах отряда насчитывалось более тысячи матросов.