Ваниль

Род Potyvirus (семейство Potyviridae) включает 129 признанных видов плюс около 15 предполагаемых (Carstens and Ball, 2009; Fauquet et al., 2005). Потивирусы обнаружены во всем мире и инфицируют более 30 семейств растений, хотя отдельные вирусы часто имеют ограниченный круг хозяев. Изогнутые, непокрытые, стержнеобразные частицы (длина 680–900 нм, диаметр 12–15 нм), содержащие одноцепочечную положительно-смысловую молекулу РНК (Hull, 2002). Геном имеет размер около 10 т.п.н. и содержит одну открытую рамку считывания, которая кодирует полипротеин из 3000–3300 аминокислот. Полипротеин ко- и посттрансляционно расщепляется тремя кодируемыми вирусом протеиназами на 10 зрелых белков, большинство из которых являются многофункциональными (Adams et al., 2005a; Revers et al., 1999; Urcuqui-Inchima et al., 2001). Обширное исследование разнообразия генов в семействе Potyviridae (Adams et al., 2005b) пришло к выводу, что ген белка цитоплазматического включения (CI) лучше подходит для идентификации потивируса при использовании только части генома. Хотя ген CP менее информативен, чем CI, он тоже может эффективно разделять виды, критерий разграничения определяется этими авторами как 76–77% идентичности.

Анализ гена CP из 36 образцов ванили, собранных в регионах Индийского и Тихого океана в период с 1997 по 2005 год, добавил пять видов потивирусов к двум ранее описанным вирусам, инфицирующим ваниль, а именно: вирус мозаики ванили (BCMV), вирус мозаики переносимый люцерновой тлей (CABMV), вирус мозаики жилок глицинии (WVMV), вирус желтой мозаики бобовых (BYMV) и вирус мозаики птицемлечника (OrMV) (Grisoni et al., 2006).

Примечательно, что среди семи видов, инфицирующих ваниль, пять (BCMV, CABMV, DsMV, WMV и WVMV) принадлежат к подгруппе BCMV, преимущественно поражающих зернобобовые культуры и сорняки. Они были обнаружены на острове Реюньон (BCMV и CABMV), на Мадагаскаре (BCMV), на Маврикии (CABMV), во ФП (BCMV, DsMV и WMV), на Тонге (WMV) и на Самоа (WVMV). Два других вида, BYMV и OrMV, были обнаружены только на острове Реюньон. Потивирус, вызывающий мозаику, о котором сообщалось в Индии (Bhai et al., 2003; Bhat et al., 2004; Thomas et al., 2002), не был идентифицирован, но может быть связан с BYMV, что предполагается двумя образцами (GenBank, AY845011 и AY845012), происходящими из материал ванили, собранного в Карнатаке (Индия). О потивирусоподобных симптомах также сообщалось в Папуа-Новой Гвинее (Kokoa, 2000) и в Пуэрто-Рико (Childers and Cibes, 1948).

Случай с DsMV-ваниль

Штаммы DsMV, инфицирующие ваниль, сначала были условно обозначены как VanMV, потому что они показали только отдаленную серологическую связь со штаммами DsMV, инфицирующими таро, и из-за невозможности перекрестной инокуляции между штаммами, происходящими от двух хозяев. Впоследствии нуклеотидный анализ 3′-конца генома двух изолятов VanMV (с Островов Кука [CI] и ФП [FP]) подтвердил, что их следует классифицировать как штаммы DsMV, поскольку они имеют более 78% идентичностей, в частности в коре CP (Farreyrol et al., 2006). Интересно, что DsMV-ваниль [CI] и DsMV-ваниль [FP] так же расходились как друг с другом, так и с опубликованными штаммами DsMV-таро (Colocasia esculenta) (Farreyrol et al., 2006). Однако, недавно полученные последовательности для изолятов таро с Островов Кука и ФП были очень похожи на изоляты ванили из той же страны (M. Pearson et al., неопубликованные данные). Поскольку таро выращивали на этих островах намного дольше, чем ваниль, это предполагает, что «скачок вируса» с таро на ваниль мог произойти независимо на двух островах Тихого океана. Кроме того, DsMV-ваниль [FP] продемонстрировал необычные особенности, которые делают его особым вирусом среди потивирусов (Farreyrol et al., 2006): мотив передачи DVG от тли (вместо более распространенного мотива DAG) выше несвойственный участок аминокислотных повторов (GTN) типичный для нативно развернутых белков, и необычный сайт протеолитического расщепления NIb/CP (Q//V).

Симптомы и диагностика