Ваниль

Передача вирусов с семенами имеет эпидемиологические последствия при наличии дополнительных культур и сорняков. В полевых условиях первичный инокулят потивируса может поступать из инфицированных черенков ванили, окружающих растений, многолетних или однолетних сорняков, в семенах которых вирус может перезимовать. Из этого первичного инокулята потивирус распространяется по участку тлями. Молекулярное сходство между изолятами, поражающими ваниль и сорняки, способствует передаче вирусов от одного вида к другому. Например, на Мадагаскаре изоляты BCMV были идентифицированы в ванили и прилегающем сорняке Senna sp. (Leguminosae), которые были на 100% идентичны по последовательностям генов CP (Grisoni et al., 2006). На острове Реюньон быстрая вспышка CABMV на недавно посаженном участке ванили с использованием безвирусных черенков взаимосвязана с межрядной Vigna unguiculata, у которой CABMV передается с семенами. Напротив, использование Gliricidia sepium, бобового дерева, часто используемого в качестве опор для участков ванили и которое из-за частой обрезки сильно заражено тлей Aphis craccivora (эффективный переносчик вирусов подгруппы BCMV), похоже, не увеличивает количество новых случаев потивируса на участках ванили, по сравнению с использованием поддерживающих деревьев без тлей, таких как Leucena glauca (Grisoni et al., 2004). Однако, при наличии других источников вируса высокие популяции тли могут стать проблемой.

Контроль

Эпидемиологические данные показали, что серьезные вспышки потивируса происходят в основном в системе интенсивного выращивания ванили и могут происходить из-за разнообразия видов вирусов, включая разнообразие видов-хозяев, резервуаров вируса и, возможно, видов тлей.

Таким образом, помимо универсальной рекомендации высаживать безвирусный материал, стратегию борьбы необходимо адаптировать к каждой местной ситуации. Как следствие, рекомендуется оценивать риск потивируса до начала любой программы развития на новом участке или при изменении системы выращивания. Кроме того, молекулярные инструменты, которые позволяют быстро идентифицировать потивирусы, помогают понять подходящую стратегию контроля, которую можно использовать в случае неожиданных вспышек потивируса.

Вирус огуречной мозаики (CMV)

CMV – широко распространенный вирус, поражающий очень широкий круг растений. Он был обнаружен в ванили в начале 2000-х годов, что было связано с серьезными деформациями лиан во ФП (Farreyrol et al., 2001). Позднее вирус был обнаружен в ванили на острове Реюньон и в Индии (Madhubala et al., 2005).

Вирусы и генетическое разнообразие Virus and Genetic Diversity

CMV является типичным представителем рода Cucumovirus в семействе Bromoviridae. Он имеет трехкомпонентный геном с позитивно-смысловой РНК, кодирующий пять белков (два компонента полимеразы на РНК1 и РНК2, белок 2b, участвующий в нарушении защиты растений и перемещении вируса в растении на РНК2, а также 30 К белок и CP на РНК3). Каждая РНК инкапсулирована в отдельную полиэдрическую частицу (диаметром 28 нм), поэтому для заражения растения требуется инокуляция трех типов вирионов. Некоторые изоляты также инкапсулируют субгеномную РНК или сателлитную (сат)РНК. Биология и экология этого вируса подробно рассмотрены (Palukaitis et al., 1992 и Gallitelli, 2000).

Штаммы CMV делятся на две серологически разные подгруппы, различающиеся примерно по 25% нуклеотидов и также различающиеся по биологическим признакам. Термоустойчивые штаммы подгруппы 1 далее делятся на две клады (1A и 1B) на основе геномных последовательностей их РНК (Roossinck et al., 1999). Подгруппа 1A возникла из подгруппы 1B, и (до недавнего времени) штаммы 1A были обнаружены только в Азии. Термочувствительные штаммы подгруппы 2 ограничены зонами с прохладным климатом. Три механизма были связаны с эволюцией CMV: перегруппировка РНК между компонентами РНК, рекомбинация в некодирующих областях и мутации в кодирующих областях. Было показано, что несколько аминокислотных положений на CP положительно отобраны в отношении передачи вируса (Moury, 2004).