Великая река была галереей живописных чудес и исторических воспоминаний, иногда закрепленных архитектурными памятниками. Но она также была живым благословением для экономики, орошая чуткую почву, связывая каждый город с дюжиной других, соперничающих с ним по культуре и торгующих его товарами. Феодализм здесь утратил свое применение и клыки, так как коммерция и промышленность заселили берега реки. Но внутри этого процветания гноились четыре проблемы: эпикурейская вялость правителей, коррупция в бюрократии, разрушительная концентрация богатства и военная раздробленность, приглашающая завоевателей.
Путь к новой организации Рейнских государств был открыт обещанием Франции и Австрии возместить новые владения тем немецким знатным особам, которые лишились своих земель в результате признания Австрией французского суверенитета над левым берегом Рейна. Требования лишенцев о реабилитации привели к созыву Францией и Австрией Растатского конгресса (16 декабря 1797 года). На нем некоторые непочтительные князья предложили «секуляризировать» церковные княжества, то есть, говоря простым языком, передать их от правящих епископов в руки жалующихся мирян. Не сумев прийти к согласию, конгресс передал этот вопрос на рассмотрение следующего сейма Священной Римской империи. Вопрос оставался в подвешенном состоянии до тех пор, пока Наполеон не вернулся из Египта, не захватил власть во Франции, не разбил Австрию при Маренго и не заключил соглашение с Австрией, Пруссией и Россией, по которому 25 февраля 1803 года депутация императорского сейма издала декрет под названием Reichsdeputationshauptschluss, окончательно перекроив карту и управление западной Германией. Почти все правящие епископы были лишены власти. Пруссия спокойно приняла сокращение епископальной власти; Австрия могла бы скорбеть, но она была бессильна.
Новые правители понимали, что Австрия не только не захочет, но и не сможет предоставить им военную защиту; не могли они (в основном католики) рассчитывать и на защиту со стороны протестантской Пруссии. Одно за другим переделанные государства обращались к Наполеону, который был верховным в военном отношении и официально католиком. В Мюнхене 30 декабря 1805 года Карл Теодор фон Дальберг, архиепископ-избиратель Майнца, встретив Наполеона, только что одержавшего победу при Аустерлице, предложил ему принять руководство реорганизованными княжествами. Занятому императору потребовалось полгода, чтобы принять решение. Он понимал, что для французской нации взять под протекторат треть Германии — значит навлечь на себя враждебность остальных, а также вновь обострить враждебность Англии и России. 12 июля 1806 года Бавария, Вюртемберг, Баден, Гессен-Дармштадт, Нассау, Берг и многие другие государства объединились в «Рейнский бунд», или Рейнскую конфедерацию; 1 августа Наполеон согласился взять ее под свой протекторат. Сохранив независимость во внутренних делах, основные составляющие конфедерации согласились подчинить свою внешнюю политику его суждению и предоставить под его командование значительные военные силы.4 Они уведомили Франциска II и императорский сейм о том, что больше не являются членами рейха. 6 августа Франциск официально объявил о распаде Священной Римской империи и отказался от императорского титула, оставшись императором Австрии. Слава Габсбургов померкла, и новый Карл Великий, правивший из Франции, взял на себя власть над западной Германией.
Конфедерация давала жизненно важные преимущества и требовала фатальной отдачи. Она принесла Кодекс Наполеона (с отменой феодальных повинностей и церковной десятины), свободу вероисповедания, равенство перед законом, французскую систему управления префектурами, централизованную, но компетентную, и подготовленную судебную власть, которую не так-то просто подкупить. Основной недостаток этой структуры заключался в том, что она опиралась на иностранную власть и могла существовать лишь до тех пор, пока эта иностранная защита перевешивала внутренние издержки. Когда Наполеон взял немецких сыновей для борьбы с австрийцами в 1809 году, протекторат был напряжен; когда он взял тысячи немецких сыновей для борьбы с Россией в 1812 году и потребовал значительной финансовой поддержки для своей кампании, протекторат казался бременем в брутто, превышающим его преимущества в розницу; когда немцы Конфедерации были призваны для борьбы с прусскими немцами в 1813 году, Конфедерация только ожидала значительного французского регресса, чтобы обрушить всю хрупкую структуру на голову измученного корсиканца.
Тем временем Наполеон с триумфом обеспечил двойную безопасность новой границы Франции. Территория к западу от Рейна была включена в состав Франции, а богатые земли на восточной стороне, доходящие до Эльбы, теперь были союзниками Франции и зависели от нее. И хотя Конфедерация распалась после поражения Наполеона под Лейпцигом в 1813 году, она оставила память о себе для Бисмарка, так же как объединение Италии Наполеоном стало источником вдохновения для Мадзини, Гарибальди и Кавура.