В 1764 году российские власти активно приступили к военным приготовлениям, так как все шло к открытому вооруженному столкновению с китайцами. В конце весны в Сенате еще раз прошли слушания по поводу нехватки военных подразделений на монгольской границе. У В.В. Якоби в распоряжении находилось около 2,5 тысячи человек личного состава, сведенного в два полка — один кавалерийский и один пехотный. Оба полка пребывали в неукомплектованном состоянии, и им недодавали положенных предметов снабжения. Численность казаков тоже считалась недостаточной. Сенаторы делегировали ему полномочия на призыв в военизированные формирования 2,4 тысячи человек из местных бурятов. Личный состав этих военизированных формирований предполагалось отдать на собственное обеспечение за счет освобождения его уплаты ясака, и В.В. Якоби поручили тщательно следить за тем, чтобы буряты не перешли на монгольскую сторону в силу своего тесного родства с народностью халха. В целях возмещения потери таможенных денежных поступлений, которые прежде шли на частичную выплату денежного содержания личному составу якутских пехотных и кавалерийских полков, сенаторы к тому же распорядились выделить средства из фондов Колывановоскресенских рудников. На этот раз пришлось повторить уже объявленный в императорском указе от 29 ноября 1763 года запрет на массовую продажу и покупку зерна в Иркутске и Енисейске. Поступил рапорт об особенно острой нехватке артиллерийских орудий и снарядов к ним на складах в Селенгинске; новый сибирский губернатор Денис Иванович Чичерин попросил прислать 19 трехфунтовых пушек и 1 бомбовую мортиру.
В октябре 1764 года царица Екатерина созвала пленарное заседание семи главных гражданских и военных сановников, на повестку дня которого вынесла обсуждение ухудшения торговых отношений с Китаем и выработку предположений по военным мерам рационального реагирования на обострение ситуации на границе. Участники того совещания предоставили императрице самое подробное описание положения дел, на какое они оказались способными на текущий момент. Сановники предложили варианты защиты государства в случае войны, а также меры по совершенствованию управления торговлей на тот случай, если вооруженного конфликта удастся избежать. Достойного внимания удостоились оба этих вопроса.
Подкрепление требовалось практически на всем протяжении государственной границы с доведением общей численности сибирской военной группировки до 11 полков. Усилению подлежали подразделения в Петропавловске на Ишиме; Омске, Ямышеве и Усть-Каменогорске на Иртыше; в Железинске; в Бийске на Оби; Кузнецке на Томи; в Иркутске и Селенгинске, то есть гарнизоны на всем протяжении Южной Сибири во всех важнейших городах. Два драгунских полка намечалось перевести из Казани в ключевые пункты размещения воинского резерва, Азовский полк — в Петропавловск, а Ревельский — в Омск. Дополнительные артиллерийские подразделения планировалось отправить в Омск и Селенгинск, но большинство полков предполагалось держать в резерве, а не распылять их по недосягаемым далеким заставам. Так как большая часть границы пролегала в гористой или по иной причине непроходимой местности, оперативная переброска войск из одной точки в другую представлялась задачей физически невыполнимой. Следовательно, русские сановники выбрали разумный вариант построения обороны своей территории от врага.
В Забайкалье достаточно казалось приложить весьма скромные усилия. Пригород Кударинска на реке Чикой намечалось укрепить за счет оборудования рвов, частоколов и земляных редутов, и для арсенала в Кяхте власти ассигновали тысячу рублей, чтобы всем жителям этого города в случае необходимости хватило оружия. В целях совершенствования укреплений укомплектованного казаками острога в Ачинске, расположенного между Кяхтой и Нерчинском на реке Онон, выслали две роты из состава гарнизона Селенгинска. Нерчинск, совершенно не оборудованный для ведения обороны, от нашествия врага защищал горный кряж. Поэтому дополнительного его инженерного обустройства на случай обороны даже не планировалось.
Надвигающийся перелом в ситуации послужил поводом для участников совещания выступить с предложением нескольких запоздалых корректив в административном аппарате. Сибирь предложили разделить на две равноценные административные единицы — Тобольскую и Иркутскую губернии. Замысел заключался в том, чтобы передать полномочия по принятию решений из столицы на восток для повышения оперативности общения между ответственными работниками бюрократического аппарата с командованием расположенных на обширной территории Восточной Сибири военных и таможенных застав. В Иркутске впервые за всю историю его существования должен был появиться губернатор. И на данный пост назначили генерал-майора К.Л. Фрауендорфа, до того служившего на Сибирском рубеже. Силу закона такое решение приобрело 19 октября через императорский указ о создании Иркутской губернии.