Нападение на Каликут имело место поздней осенью, то есть в период северо-восточных муссонов, попутных при плавании из Индии в Красное море. Следовательно, у Албукерки еще оставалось несколько месяцев, чтобы осуществить запланированную экспедицию в Красное море, но из-за ранения он не мог в ней участвовать до февраля. Если бы он знал о погоде и судовождении в этой части океана все то, что выяснил позже, то не сомневался бы, что уже тогда начинать экспедицию было поздно. Но арабские лоцманы не спешили делиться секретами, и потому португальцы находились в невыгодном положении по сравнению с их противниками. Они плавали в неизученных морях и ничего не знали о навигационных опасностях. В феврале вице-король отплыл из Кочина, идя вдоль Малабарского берега, чтобы присоединить к своей флотилии корабли из Каннанура и с острова Анджадип (Анджидив). Там он получил донесение, изменившее все его планы. Информацию принес индусский «солдат удачи» по имени Тимоджа, который, преследуя собственные цели, был чрезвычайно дружелюбен с португальцами и был полезным информатором относительно внутренних дел. Иногда он даже предоставлял своих наемников в распоряжение португальцев.
Сообщение Тимоджи касалось политического кризиса в крупном городе Гоа, который находился в дне пути от Анджадипа. В этом городе была великолепная гавань, и он имел лучшее географическое положение из всех городов западного побережья Индостана к югу от Бомбея, кроме Кочина, при этом был удобнее, чем Кочин, для торговли. Гавань Гоа образуется северным или главным ответвлением реки Мандави, на южном берегу которой в XVI веке и стоял город – в пяти километрах от устья, выходя на внутреннюю якорную стоянку. Немного ниже располагалась другая – внешняя стоянка, как раз на отмели, которая находилась между мысами по обе стороны от устья. Во времена Албукерки нижняя стоянка судов охранялась фортом на южном мысу, известном под названием Панджим. Форт построили в четырех или пяти милях от города. Город и его окрестности удачно защищал рукав реки, который ответвлялся от главного русла примерно в девяти милях от устья и тек к морю южнее. Город располагался в дельте, и дополнительный речной рукав образовывал естественный защитный ров, прикрывающий тыл. Он был недостаточно глубок, чтобы по нему плавали суда – только баржи и лодки, но и недостаточно мелок, чтобы его можно было перейти вброд. Брода имелось только два, да и те были проходимыми только при отливе. Поэтому в военном отношении порт был защищен со всех сторон. Отмель являлась препятствием для нападения с моря. Только очень опытные местные лоцманы, прекрасно знающие фарватер, могли провести здесь судно. А два рукава реки были естественными преградами для нападения с суши, если не считать бродов.
Во время летних муссонов Гоа недоступен для судов с большой осадкой извне из-за бурунов на отмели, но этот недостаток разделяют и остальные порты Малабарского берега, за исключением Кочина, который частично окружен лагунами. Однако ни один из них не было так легко защищать от сухопутной атаки во времена Албукерки. Правда, Кочин расположен слишком далеко на юге, чтобы стать идеальным торговым центром западного Индостана. И там меньше воды на отмели. Поэтому, оценивая все факторы в комплексе, можно сказать, что Гоа обладал большим числом преимуществ, чем любая другая гавань к югу от Бомбея, для португальцев, которым не принадлежали территории внутри Индии, но которые были необычайно сильны на море. В XV веке Гоа был столицей самого сильного мусульманского государства в Западной Индии, хотя и с большим индусским населением. Им управлял сахиб или хан, и его территория тянулась внутрь страны до границы плоскогорья Декан, а на север – до соседнего города Дабул. Являясь крупным мусульманским центром, Гоа привлекал многочисленных последователей этого вероучения со всей Южной Азии. Поэтому после уничтожения Алмейдой в сражении при Диу принадлежавшего султану Египта флота Красного моря члены команд, сумевшие добраться до берега и не имевшие возможности вернуться домой, потянулись из Гуджарата в Гоа. Здесь они осели, дав хану хорошо обученных, а потому в высшей степени полезных солдат. До тех пор его армия состояла по большей части из тюрок. Старый хан умер, а его наследник отсутствовал в городе, отправившись в экспедицию в глубь страны с большинством своих войск. Порядок поддерживался лишь небольшим отрядом. И это в центре мусульманского государства, где было большое, угнетаемое и потому готовое к бунту индусское население. Согласно донесению Тимоджи, недовольные индусы поддержат захват города португальцами, который он настойчиво предлагал провести Албукерки.