Диапазон деятельности Н. А. Душина был поистине огромен, на нём лежала громадная ответственность за обеспечение безопасности Вооружённых Сил страны в мирное время и правильное их использование в военные афганские годы.
Заместитель начальника 3 Главного управления КГБ СССР по кадрам контр-адмирал С. С. Качемцев вспоминает: «Важным в стиле руководства Николая Алексеевича являлось высокое доверие к своим заместителям и руководителям отделов Главка, вера в успех их труда. Этим Николай Алексеевич в какой-то мере освобождал себя лично от многообразия решаемых задач, обеспечивал более оперативное их разрешение и, как следствие, чёткость работы аппарата Главка».
Заместитель, а с 16 сентября 1981 года – первый заместитель начальника 3 Главного управления КГБ СССР генерал-лейтенант Борис Андреевич Еронин по указанию Н. А. Душина с 14 декабря 1979 года возглавлял оперативную группу Главка в Термезе. Лично руководил контрразведывательным обеспечением ввода частей и соединений Туркестанского военного округа в Афганистан, 25 декабря 1979 года находился на командном пункте Министерства обороны в районе дислокации 81 пограничного отряда Среднеазиатского погранокруга в Термезе при форсировании подразделениями Советской Армии реки Аму-Дарья. По деловому, без суеты и бумажной волокиты организовал координацию и взаимодействие Особых отделов КГБ СССР по Туркестанскому военному и Среднеазиатскому пограничному округам на подготовительном и начальном этапах войсковой операции в ДРА.
Для ветерана Управления контрразведки «Смерш» НК ВМФ, участника Великой Отечественной войны Б. А. Еронина не было никаких тайн и секретов в организации контрразведывательной работы в условиях боевых действий. Находясь непосредственно в Кабуле, проконтролировал и оказал практическую помощи в развёртывании особого отдела КГБ СССР по 40-й армии ТуркВО, создании системы контрразведывательных мер по ограждению советских и афганских войск от разведывательно-подрывной деятельности спецслужб НАТО, Пакистана и Ирана, вооружённых формирований непримиримой оппозиции, лично принимал участие в практической подготовке сотрудников особого отдела к ведению агентурно-оперативной работы в военное время, прививая навыки, полученные в годы службы в «Смерше».
Непосредственно курировал деятельность органов военной контрразведки в Афганистане до октября 1987 года.
Заместитель начальника 3 Главного управления КГБ СССР генерал-майор Ермолаев Иван Авраамович курировал деятельность 8 отдела Главка и особых отделов по пограничным округам, в том числе, – Среднеазиатскому и Восточному, с 16 сентября 1981 года по 15 января 1987 года.
Ветеран ОКР «Смерш» НКВД СССР, участник Великой Отечественной войны, И. А. Ермолаев в начале 1960-х годов входил в состав оперативной группы по разработке агента ЦРУ США и МИ-6 Великобритании Пеньковского, за проявленный высокий профессионализм награждён нагрудным знаком «Почётный сотрудник госбезопасности».
Неоднократно возглавлял комиссии Главка по проверке работы особых отделов КГБ СССР на советско-афганской границе с подготовкой соответствующих указаний и рекомендаций организационно-управленческого характера. Отличался крайней взвешенностью и осторожностью при принятии решений, оценках правовых перспектив дел оперативного учёта, уделяя неослабное внимание соблюдению принципа социалистической законности.
Обладая исключительными человеческими качествами, чуткостью, вниманием, умением разбираться в людях, Иван Авраамович считал обязанностью лично вести постоянную кадровую работу по отбору в центральный аппарат военной контрразведки наиболее профессионально подготовленных и перспективных руководителей и оперативных сотрудников из периферийных органов, непосредственно из особых отделов по пограничным округам и отрядам со сложной оперативной обстановкой.
Генерал-лейтенант Василий Степанович Сергеев сменил генерал-полковника Душина Н. А. в июле 1987 года, за полтора года до завершения боевой операции советских войск в Афганистане. Участник Великой Отечественной войны, многоопытный руководитель территориальных органов безопасности, он с 1983 года занимал должность первого заместителя начальника 3 Главного управления – начальника управления «В», занимавшегося контрразведывательным обеспечением МВД и внутренних войск.
Вникая в оперативную обстановку в Афганистане, В. С. Сергеев лично предельно тщательно изучал весь объём приходящих из Особых отделов по ТуркВО, САПО и ВПО информационных материалов; подолгу, иногда по несколько раз в сутки беседовал по ВЧ-связи с начальником Особого отдела по 40-й армии. Не стеснялся вызывать к себе сотрудников 2, 3 и 8 отделов для докладов и уточнения отдельных деталей операций. Общался с подчинёнными предельно вежливо и тактично, если не получал удовлетворившего его пояснения с первого раза, корректно просил вернуться к затронутой теме после более детальной её проработки.