При постановке задач пограничникам в полной мере учитывался опыт Великой Отечественной войны и современные требования разработанного Генеральным штабом Вооружённых Сил СССР плана стратегического развёртывания армейских и фронтовых соединений и объединений, согласно которым при передислокации сухопутных войск для выполнения боевых задач на сопредельную территорию на пограничные войска, помимо охраны государственной границы, дополнительно возлагалась функция охраны тыла действующей армии: контроль за территорией между тылом армии и государственной границей СССР; борьба со шпионажем, поиск и уничтожение диверсионно-разведывательных групп противника, розыск дезертиров, охрана особо важных транспортных и коммуникационных объектов, сбор оставленного в тылу войск военного имущества.
Сбором оставленного боевого оружия и боеприпасов, брошенного военного обмундирования и снаряжения пограничникам Термезского пограничного отряда и сотрудникам особого отдела пришлось заняться ещё до ввода войск Советской Армии на афганскую территорию, когда отдельные представители мобилизационного контингента из числа коренного населения среднеазиатских республик самовольно покидали места дислокации частей ТуркВО в районе г. Термеза.
Организацию служебно-оперативной деятельности пограничных войск на решение поставленных Коллегией КГБ СССР задач на Термезском направлении осуществлял лично начальник войск Среднеазиатского пограничного округа генерал-майор Карпов И. Г., находившийся в Термезе с начала декабря 1979 года. Он же взаимодействовал напрямую с заместителем начальника 3 управления КГБ СССР генерал-майором Ерониным Б. А. по вопросам совместного планирования оперативной работы особых отделов КГБ СССР по Туркестанскому военному округу и САПО, а с сотрудником 8 отдела 3 управления КГБ СССР Щёголевым Н. Г. – по вопросам согласования действий пограничников и органов военной контрразведки по пограничным войскам в период пропуска частей Советской Армии через государственную границу по единому замыслу, исключая параллелизм и дублирование, пересечение ведомственных интересов войск, пограничной разведки и военной контрразведки, а также исполнение несвойственных друг другу функций.
В ходе личного общения и обмена мнениями, консультаций на ранней стадии исключалось представление в Центр противоречивой и невнятной информации, могущей вызвать неоднозначное толкование у руководителей соответственно 3 управления и Главного управления пограничных войск КГБ СССР.
«Работать с Иваном Григорьевичем Карповым было искреннее удовольствие. Исключительно организованный, выдержанный, тактичный, подчёркнуто вежливый, он никогда и ни на кого не повышал голос. Внимательно выслушивал мнения и предложения абсолютно всех категорий военнослужащих – от рядового до полковника. Прост и доступен в общении. Решения принимал после тщательного обдумывания ситуации, неоднократно проигрывая со своим штабом различные варианты развития событий, предпочитал исходить из наиболее неблагоприятного, готовя заблаговременно дополнительные резервы пограничников.
Необходимо отметить, что ввод войск планировался одновременно на Термезском и Кушкинском направлении, поэтому И. Г. Карпов держал под ежедневным контролем и меры командования Тахта-Базарского пограничного отряда.
Не было случая, чтобы он отказал в какой-либо просьбе представителям военной контрразведки – от выделения оперативного прикрытия при проведении закордонной операции до ремонта и приведения в порядок выделенного в распоряжение оперативной группы 3 управления КГБ совершенно «убитого» по прежнему месту эксплуатации УАЗика.
Доклады по линии погранвойск руководству ГУПВ КГБ СССР тщательно сверял с информацией особого отдела по САПО и опергруппы 3 управления КГБ, в случае выявления нестыковок и расхождений в информации давал команду на её перепроверку и не подписывал итоговую докладную до тех пор, пока лично не был убеждён в том, что все противоречия – случайные или неслучайные, устранены».
По завершению подготовительных мероприятий: организационно-мобилизационных, войсковых, партийно-политических, разведывательных, контрразведывательных, инженерных, тыловых, материально-технических и других, включая управление и связь, 25 декабря 1979 года начался ввод частей 108 мотострелковой дивизии ТуркВО в Афганистан.
Руководил операцией первый заместитель министра обороны СССР маршал Советского Союза Соколов С. Л., специально прибывший в Термез. По линии военной контрразведки его сопровождал и непосредственно постоянно находился рядом заместитель начальника 3 управления КГБ СССР генерал-майор Еронин Б. А.