ДНР, в соответствии с полномочиями, определенными в законе, интегрирует деятельность всех членов Разведывательного сообщества, руководствуясь при этом принципом «централизованный контроль, децентрализованное исполнение», а его аппарат осуществляет координацию деятельности спецслужб и подготовку конечных информационно-разведывательных документов, при том что основные функции (определение задействуемых возможностей, организация и ведение разведки, руководство добывающими силами и средствами, сбор и анализ разведывательных сведений и т. д.) остаются в ведении руководителей ведомств. Отныне работу с входящими в сообщество организациями ДНР осуществляет через специально сформированный Комитет начальников разведывательных структур (КНРС), заседания которого осуществляются раз в два месяца, и через специальные координационные встречи, проводящиеся еженедельно только руководителями ЦРУ, ФБР, РУМО, УНБ, НУВКР и НУГР.
В марте 2002 года в качестве одного из первых мероприятий администрации по противодействию терроризму был создан Совет по внутренней безопасности (СВБ), в который помимо президента вошли вице-президент, помощник президента по внутренней безопасности, министры обороны, финансов, транспорта, здравоохранения, директоры ЦРУ, ФБР и Федерального агентства по чрезвычайным ситуациям. Главной задачей нового органа являлась координация действий различных ведомств в случае возникновения соответствующей ситуации внутри страны.
В 2005 году был создан еще один контрольный орган — Объединенный совет по разведке (ОСР) при президенте, в который вошли ДНР, госсекретарь, министры финансов, обороны, энергетики и внутренней безопасности. Данный политический орган, судя по возложенным на него функциям, во многом дублировал задачи СНБ и Совета по внутренней безопасности. К тому же продолжал действовать и Национальный разведывательный совет в составе Управления директора национальной разведки — орган анализа и оперативной координации. Объективно все это не могло не усложнить решение проблем взаимодействия различных ведомств, входивших в Разведывательное сообщество США.
Весьма существенным шагом в направлении повышения эффективности деятельности спецслужб страны, как считают американские специалисты, явилось образование в соответствии с законом «О внутренней безопасности» от 2002 года еще одного члена Разведывательного сообщества — Министерства внутренней безопасности (МВБ), поставившего под свой контроль соответствующие подразделения 22 организаций, ранее не находившиеся под единым контролем какого-либо ведомства, профессионально занимавшегося решением различных проблем из области борьбы с терроризмом и частично криминалом. Учреждение с функциями обеспечения внутренней безопасности, созданное сразу после терактов в сентябре 2001 года, сначала представляло собой управление в составе президентской администрации и оставалось бы таковым, если бы не давление Конгресса, требовавшего придания этому ведомству общефедеральных полномочий. Президент Дж. Буш-младший был вынужден согласиться с мнением законодателей и сформировать самостоятельное министерство.
Данное ведомство, облеченное беспрецедентными полномочиями, уже к 2009 году разрослось до 225 тыс. человек при бюджете в 52 млрд долларов — третьем по величине среди всех федеральных ведомств [75]. Между тем формально МВБ само по себе не является разведывательной организацией: в его составе множество разнообразных подразделений, деятельность которых охватывает различные направления: пограничная и пожарная охрана, таможенная и иммиграционная служба и др. Но решение вопросов информационной безопасности, защиты «критической инфраструктуры» и «чувствительных технологий» объективно потребовало усиления координации действий этого ведомства с другими членами Разведывательного сообщества США. Созданное в рамках министерства Управление разведки и анализа (УРА), возглавляемое заместителем министра, самым тесным образом взаимодействует с аналогичными органами других членов сообщества, в том числе военной разведкой. В интересах обмена важной информацией, а также проведения специальных мероприятий по пресечению деятельности иностранных разведок, национальных и международных террористических и преступных группировок нашла широкое применение практика формирования совместных рабочих групп. При этом выбор ведомств (включая военную разведку) для совместной работы, масштабы и формы их координации зависят от степени потенциальной угрозы национальной безопасности Соединенных Штатов и способности тех или иных спецслужб эффективно использовать переданную информацию в оперативных целях.
Таким образом, к концу второго, заключительного срока пребывания республиканской администрации в Белом доме в состав Разведывательного сообщества США входило 17 организаций [73] (количество которых, кстати, остается неизменным и по настоящее время — более подробно см. далее).