В следующем, 1836 году Енохин защитил диссертацию на степень доктора медицины и хирургии. Этому предшествовали следующие события. Вообще говоря, Енохин отличался завидным здоровьем и почти никогда не болел. Но, находясь в Турецком походе, он простудился и заболел пояснично-крестцовым радикулитом («Почувствовал боль в правой ноге, которая начиналась от вертлуга бедра и простиралась позади седалищного нерва»). Эти боли, сначала появлявшиеся изредка, после бивуачной жизни в Польскую кампанию, во время сырого и холодного лета, усилились и стали обнаруживаться чаще. Как писал известный врач того времени П.А. Чаруковский, «все возможные средства, предлагаемые в подобных случаях медициной, были употреблены без пользы. Наконец по совету лучших врачей нашей столицы больной решил испытать действие минерального магнита и удостоил меня выбором для производства сего магнитного лечения, которое было начато 28 октября 1833 г. в 12 часов пополуночи и продолжалось 25 мин. Всего было проведено 5 сеансов. 3 ноября магнетизирование было прекращено. С этого времени и до сих пор (июль 1834 г. —
«Мы, русские, нередко основываем свои мнения об отечественных минеральных источниках на неверных данных, почерпнутых у иностранных или неточных наблюдателей по неимению для этого своих собственных аккредитованных (достоверных. —
Пребывание на Кавказских Минеральных Водах И.В. Енохин использовал для написания диссертации на тему «Анатомия, физиология и острое воспаление спинного мозга». (Экземпляры докторской диссертации И.В. Енохина — на латинском языке — хранятся в Фундаментальной научной библиотеке Военно-медицинской академии в Санкт-Петербурге и в Библиотеке медицинского факультета Йельского университета в Нью-Хевене — США.)
87-страничная диссертация И.В. Енохина представляет собой, строго говоря, не научное исследование, а обзор (компиляцию) соответствующих работ конца XVIII – начала XIX в. Сам Енохин достаточно критически оценивал научное значение своей диссертации, определив её в предисловии, обращённом к Я.В. Виллие, как «сочиненьице» (opusculum). Определённая новизна его диссертации состояла в том, что в ней практически впервые было объединено описание анатомических данных с полученными к тому времени сведениями по физиологии спинного мозга, включая двигательную и чувствительную его функции, участие в регуляции дыхания, кровообращения и деятельности некоторых других внутренних органов. Оригинальность диссертации также состояла в том, что в качестве методического подхода к изучению функций спинного мозга он использовал описание их нарушений при одном из острых заболеваний спинного мозга — миелите, положив, таким образом, начало патологической физиологии спинного мозга.