Хотя первоначальным планом Морганьи, возможно, было просто отредактировать Sepulchretum, в конце концов, он создал совершенно новую работу, основанную на подробных описаниях клинических наблюдений, бо́льшая часть которых включала отчеты об аутопсии пациентов, выполненной им самим или Вальсальвой. Он привел очень точные данные, не загромождая их незначительными подробностями, которые менее квалифицированные врачи не могли отличить от важных деталей процесса эволюции болезни. Он рационально интерпретировал факты, используя время от времени физиологические эксперименты для доказательства некоторых из своих выводов, при этом все его рассуждения опирались на хорошее знание исторического наследия древних медиков. В эту огромную работу он привнес свой выдающийся талант практикующего врача, неоспоримое превосходство опытного анатома, изобретательность физиолога-экспериментатора и бесконечное терпение. Способность Морганьи интегрировать и синтезировать информацию, а также его целеустремленность позволили ему справиться с задачей и создать труд, в котором остро нуждалась медицинская наука для дальнейшего развития. Независимо от того, осознавали современные врачи существующее положение вещей или нет, но без этого шага ни о каком прогрессе в диагностической и терапевтической методологии не могло быть и речи.
Книга De Sedibus et Causis Morborum per Anatomen Indagatis («О местонахождении и причинах болезней, открываемых посредством рассечения») написана в форме семидесяти писем к молодому человеку, с которым Морганьи встретился в процессе своей работы. Своего адресата ученый описал как «одаренного в изучении наук и, особенно, медицины». Юноша обратился к Морганьи с просьбой присылать ему для коллекции описания историй болезни и наблюдений, подобные тем, что составляют Sepulchretum. По-видимому, тогда пятидесятидевятилетний профессор начал в 1741 году посылать своему анонимному (или, возможно, вымышленному) другу одно за другим письма с тщательным анализом историй пациентов, до тех пор, пока не завершил создание пяти книг, озаглавленных в соответствии с категориями: (1) «Заболевания головы», (2) «Заболевания груди», (3) «Заболевания живота», (4) «Хирургические и универсальные расстройства» и (5) «Дополнение», к которому прилагалась серия указателей для удобства поиска нужного материала.
Каждая из пяти книг посвящена выдающимся зарубежным врачам: две – медикам из Германии и остальные – докторам из Франции, Англии и России. В семидесяти письмах содержатся истории болезни, согласованные с результатами аутопсии, соответствующими ссылками на других авторов, историческими справками, а в некоторых случаях с описаниями экспериментов, проведенных автором с целью уточнения деталей течения болезни. Создавая De Sedibus, Морганьи стремился составить руководство, с помощью которого практикующий врач мог бы установить взаимосвязь каждого симптома с пораженным органом, ставшим причиной его появления.
Книги написаны простым доступным языком, вызывающим у читателя чувство, словно он слушает наставника, который делится с ним своим опытом и пониманием жизни по мере того, как история каждого пациента постепенно разворачивается перед его глазами. Автор приводит исторические справки, прослеживая эволюцию современных суждений, цитируя признанных авторитетов, обсуждая их теории, шаг за шагом, проясняя логику развития своих выводов. Комментаторов оригинального латинского текста поражали литературные достоинства описаний историй болезни, настолько скрупулезных, что они позволяли реконструировать каждый симптом, начиная от ощущений больного и заканчивая клиническими проявлениями, фиксируемыми лечащими врачами.
Морганьи делает своего читателя свидетелем каждого этапа вскрытия и отправляется вместе с ним в библиотеку ссылок. Вся книга написана от первого лица в форме обращения к читателю, который рассматривается не как ученик, а как уважаемый коллега, коими являлись и молодой адресат-аноним, и профессора-иностранцы, которым посвящены отдельные тома. Таким образом, молодой человек становится медиумом, через которого каждый читатель получает персональные инструкции.