Увы, Муса оказался похож на отца даже больше, чем того хотелось бы его сторонникам: жестокая и амбициозная, но не слишком дальновидная политика нового султана быстро свела на нет его недолгую популярность. Свое правление Муса начал с карательной экспедиции против неверных сербских союзников. При этом он запретил владетелям приграничных областей самостоятельно проводить рейды, тем самым лишив их привычного источника доходов. Армия роптала. Несмотря на это, целью следующего удара Муса избрал ни много ни мало сам Константинополь, под стенами которого турки появились в 1411 году. Впрочем, осада длилась недолго – по просьбе императора Мануила в игру наконец включился прибывший из Бурсы Мехмед.
И вновь Мехмед использовал приемы врага против него же самого. Не добившись особого успеха на поле брани – в одном из сражений он даже получил ранение, – Мехмед наводнил Эдирне своими агентами, чьей целью было распространение слухов о процветании Бурсы и ее правителя. К лету 1413 года умелая пропаганда изрядно расшатала трон под Мусой, и 15 июня войска Мехмеда беспрепятственно высадились во Фракии. Раздираемая соперничеством между командирами, армия Мусы была совершенно деморализована. Еще до начала битвы глава анатолийских янычар Хасан Ага принялся убеждать телохранителей Мусы покинуть того ради службы действительно справедливому господину. Столичные янычары колебались, и, опасаясь повального дезертирства, султан лично повел своих людей в атаку. Наступление захлебнулось – первое же копье пронзило плечо Мусы, и он вынужден был повернуть коня назад. Вид окровавленного султана поверг его воинов в уныние. Вассалы Мусы один за другим переходили в лагерь его брата. Поле битвы осталось за Мехмедом. 5 июля 1413 года Муса был настигнут янычарами врага в Болгарии и после отчаянного сопротивления убит. Чтобы не проливать кровь экс-султана, янычары его задушили.
На этом завершилось османское междуцарствие и десятилетняя гражданская война, едва не сгубившая молодую империю. Последним всплеском смуты стало появление некоего человека, называвшего себя спасшимся из самаркандского плена принцем Мустафой. При поддержке венецианцев лже-Мустафа, как называют его турецкие историки, попытался поднять восстание в приграничных землях османов, но вскоре был обезврежен османскими войсками. По сообщению арабского писателя и историка ибн Арабшаха, «Мустафа исчез бесследно, из-за него около тридцати человек с таким именем были казнены». По другой версии, Мустафа попал в руки византийцев, которые использовали его как инструмент политического давления на нового султана. По соглашению с Константинополем Мехмед ежегодно выплачивал империи крупную сумму золотом в обмен на обещание, что Мустафа – подлинный или самозваный – никогда не покинет темницы на острове Лемнос.
Мехмед I, имевший титул Челеби, что означает «господин», воссоздал централизованное османское государство, за что его нередко называют «второй основатель империи». Другой немаловажной его заслугой было восстановление пошатнувшегося в глазах подданных престижа династии. Тела своих братьев Мехмед отправил в Бурсу, где их со всеми полагающимися почестями похоронили в семейной усыпальнице Османов, рядом с могилами их сиятельных предков.
Воцарение в Эдирне нового султана правители соседних европейских государств восприняли с явным облегчением. Несмотря на славу искусного воина – Мехмед лично участвовал в десятках кровавых схваток и за жизнь, проведенную преимущественно на войне, получил сорок два ранения, – османский владыка начал свое правление непривычно миролюбиво. За помощь в противостоянии с Мусой он обещал греческой знати безопасность и защиту. С Константинополем нового султана и вовсе связывали давние дружеские отношения. В разговоре с императорским послом Мехмед почтительно величал Мануила II «мой отец» и подтвердил свое расположение богатыми дарами, главным из которых стал возврат к некоторым пунктам договора 1403 года. Империя получила обратно завоеванные Мусой Фессалоники и контроль над небольшими прибрежными участками в юго-восточной Фракии.