Воинская часть, в которой служил капитан Снэ, в сентябре 1939-го отступила на советскую территорию. Один из пунктов секретного приложения к пакту Риббентропа-Молотова гласил, что «обе стороны не допустят на своих территориях никакой польской агитации». Скрупулезно выполняя советско-германский договор, Политбюро отдало распоряжение о расстреле польских военнопленных. 25 700 поляков, включая всех офицеров из подразделения, в котором служил капитан Снэ, стали жертвами расстрела в Катыни. Но Снэ удалось избежать казни. При перевозке пленных к месту экзекуции он бежал, добрался до Каунаса (Литва не была еще оккупирована Красной Армией), а оттуда кружным путем — через Швецию, Францию, Швейцарию и Италию — в марте 1941-го достиг Палестины.
Официально Хагана подчинялась Национальному комитету и Еврейскому агентству. Снэ был кадровым офицером, хоть и военврачом — и, за неимением опытных кадров, Национальный комитет назначил его начальником штаба Хаганы. Этому назначению способствовали его близкие отношения с Бен-Гурионом и, главное, идеологические убеждения — Снэ придерживался марксистско-ленинской идеологии, просоветской и просталинской политики (в Кнесете 1 -7-го созывов он будет представлять МАПАМ и коммунистическую партию Израиля). Снэ участвовал в создании Пальмах, тесно связанной с прокоммунистической МАПАМ. 15 мая 1941 года, в дни успешного наступления Роммеля в Северной Африке, генеральный штаб Хаганы по согласованию с мандатными властями принял решение о создании девяти ударных рот, которые в случае прихода немецких войск в Палестину начали бы партизанско-диверсионную войну. Командиром первой роты Снэ назначил Игаля Алона, второй — Моше Даяна.
Вернемся к октябрьским переговорам Бегина и Снэ. Как рассказывал впоследствии Снэ, во время дискуссии Бегин одобрительно отзывался о Бен-Гурионе и несколько раз повторил, что «после смерти Жаботинского мы видим в лице Бен-Гуриона единственного человека, способного руководить политической борьбой сионизма. Мы готовы поступить в его распоряжение», — убеждал он Снэ, выдвинув, однако, условие: «Это произойдет после того, как Бен-Гурион, начав борьбу против британского правительства, станет во главе комитета национального освобождения или возглавит еврейское временное правительство».
Несмотря на принятие Билтморской программы, к таким радикальным поступкам осенью 1944-го Бен-Гурион не был готов. Они шли вразрез с его убеждениями, что в настоящее время на первом месте — война с Германией, а применение оружия против англичан допустимо лишь после войны, при условии, что те продолжат препятствовать осуществлению прав евреев, оговоренных мандатом на Палестину. Во время войны атаки на полицию, мандатную администрацию и объекты инфраструктуры он считал ударом союзникам в спину.
Переговоры Бегина и Снэ прервались 6 ноября после убийства боевиками ЛЕХИ британского министра барона Мойна> яростного сторонника ограничения еврейской иммиграции в Палестину. Это взорвало ситуацию — англичане ответили решительными действиями, повальными обысками и арестами членов радикальных организаций. Бен-Гурион поддержал англичан и убедил Исполнительный комитет опубликовать обращение к ишуву, направленное против раскольников:
«Мы обращаемся к ишуву с призывом отвергнуть всех членов этой зловредной и разрушительной группировки, отказать им в пристанище и крове, не поддаваться их угрозам и оказывать властям любую помощь, необходимую для предотвращения актов террора и уничтожения террористической организации, что является вопросом жизни или смерти».
Резкий и непримиримый тон обращения вызвал недовольство даже среди ряда сторонников Бен-Гуриона, но он, несговорчивый и склонный к импульсивным поступкам, привыкший действовать решительно и непреклонно, не считаясь ни с чьим мнением, объявил о сотрудничестве с англичанами в борьбе против Эцель и ЛЕХИ: «Мы столкнулись с альтернативой: или терроризм — или политическая борьба; или террористические организации — или организованная еврейская община. <…> мы должны принять соответствующие меры против терроризма и осуществляющих его организаций. Пора перейти от слов к делу».
ЛЕХИ на требование Еврейского агентства прекратить вооруженные действия против англичан объявил о приостановке своей деятельности, и репрессии со стороны Хаганы его не коснулись. А Бегин ответил отказом. Ультиматум Бен-Гуриона стал сигналом к началу операции «Сезон», о которой в будущем он сам и его сторонники старались забыть. Бегин назвал ее «сезоном охоты на людей». Ударной силой Хаганы, получившей приказ Исполнительного комитета, были отряды Пальмах, придерживавшиеся просталинской и коммунистической идеологии. Их лидеры горели желанием расправиться с правой оппозицией в сионистском движении. Сотни членов Эцель были арестованы и после допросов, сопровождавшихся иногда избиениями, шантажом и отъемом денег, были выданы для судебного преследования британской полиции.