Некий муж, в то время еще мирянин, встретил Франциска, проповедовавшего перед церковью Святого Северина. В ниспосланном от Бога видении тот муж увидел святого, как бы осененного двумя сверкающими мечами, скрещенными наподобие креста. Один из мечей осенял его тело от головы до ног, другой шел через грудь от длани к длани. Тот человек никогда раньше не видел святого Франциска, но узнал его благодаря этому знамению. Он покаялся, вступил в Орден и счастливо завершил свой жизненный путь.
Глаза святого болели от постоянных слез, но Франциск отвечал тем, кто просил его не плакать: «Из любви к свету, которой обладают и мухи, не следует отвергать вечный свет». Когда же братья настаивали, что ему необходимо лечиться, поскольку болезнь угрожала зрению, муж Божий взял в руку раскаленный на огне хирургический инструмент и сказал: «Брат мой огонь, будь благосклонен ко мне в этот час и стань моим целителем. Молю Господа, Который сотворил тебя, чтобы Он смягчил для меня твой жар». Произнеся это, Франциск осенил инструмент крестным знамением и провел им по нежной плоти. Несмотря на то что надрез был сделан от уха до брови, святой, как говорил он сам, не испытал никакой боли.
Находясь в обители Святого Урбана, раб Божий тяжело заболел. Почувствовав глубокую слабость, он попросил подать ему чашу вина, но, поскольку вина в доме не оказалось, ему принесли воды. Франциск осенил чашу крестным знамением, благословив воду, и она тот час превратилась в превосходное вино. Так благочестие святого мужа испросило то, что не могла дать скудость пустынного места. Выпив немного вина, Франциск сразу исцелился.
Святой Франциск предпочитал слушать, как его бранят, а не хвалят. Когда народ превозносил заслуги его святости, он приказывал одному брату громко ругать его и порицать. Когда тот брат, сам того не желая, называл Франциска деревенщиной, поденщиком и бездарным неучем, святой радовался и говорил: «Господь да благословит тебя, ты говоришь истинную правду: именно такие речи мне следует слушать!».
Раб Божий хотел не предводительствовать, но подчиняться, не приказывать, но исполнять приказания. Он сложил с себя полномочия генерала Ордена и попросил поставить над собой настоятеля, воле которого полностью повиновался. Также и брату, с которым Франциск обыкновенно странствовал, он обещал неизменно подчиняться и прислуживал ему. Когда некий брат вопреки правилу послушания совершил проступок, но затем раскаялся, для устрашения других братьев муж Божий приказал бросить в огонь его монашеский капюшон. После того как капюшон некоторое время пролежал в пламени костра, Франциск велел достать его и вернуть брату. Капюшон достали из самой середины костра, но не нашли на нем и следов огня.
Однажды, проходя через низменности, окружавшие Венецию, Франциск увидел великое множество птиц, поющих на болоте, и сказал спутникам: «Сестры птицы славят своего Творца — так встанем среди них и начнем петь молитвы этого часа!». Когда братья оказались среди стаи птиц, те не испугались и не улетели, но из-за громкого птичьего гомона братьям невозможно было услышать друг друга. Тогда Франциск попросил птиц: «Сестры птицы, прервите свое пение, пока мы не закончим славить Господа». Птицы тотчас смолкли. По окончании молитвы Франциск снова позволил им запеть, и птицы вновь принялись петь, как обычно.
Некий рыцарь благочестиво пригласил его на ночлег, но Франциск сказал ему: «Брат хозяин, прими мой совет и покайся в грехах, ведь скоро ты будешь трапезничать в другом месте». Рыцарь послушался святого, привел в порядок свои дела и получил спасительное отпущение грехов. Когда стали садиться за стол, хозяин внезапно умер.
Однажды святой Франциск нашел множество птиц и приветствовал их, как если бы те были разумными существами. Он сказал: «Братья мои птицы, вы должны радостно славить вашего Творца, Который одел вас перьями, даровал вам крылья для полета, придал чистоту небесам и правит вами, живущими беззаботно». Птицы стали вытягивать шеи навстречу Франциску, расправлять крылья, открывать клювы и внимательно смотреть на него. Он же прошел среди стаи, так что его ряса касалась птиц, но ни одна из них не улетела до тех пор, пока он не дал на то позволение И тогда вся стая разом взмыла в воздух.
Когда Франциск проповедовал у стен города Альвиано, его голос не был слышен из-за щебета ласточек, вьющих гнезда. Святой обратился к ним: «Сестры мои ласточки, сейчас мой черед говорить. Вы сказали достаточно, помолчите немного, пока не завершится слово Божие». Ласточки послушались его и тотчас затихли.