Монастырь был закрыт в 1918 г. одним из первых в Москве, и на части его территории был организован концентрационный лагерь. Собор тогда еще продолжал действовать вместе с Елизаветинской церковью до 1926 г., когда они были окончательно закрыты. Сестры монастыря были арестованы, а священник монастыря Алексий (Скворцов) в 1938 г. был расстрелян на Бутовском полигоне НКВД. Община верующих, вместе с некоторым церковным имуществом, не реквизированным властями, перебралась в храм Святой Троицы в Серебряниках. Здесь же были и монастырские святыни: древний чудотворный образ Иоанна Предтечи и икона преподобной Елизаветы, написанная когда-то для нового монастырского храма и помещавшаяся в его главном алтаре. Когда и этот храм был упразднен, имущество со святынями перешло в храм Святых апостолов Петра и Павла, не закрывавшегося в годы советской власти. Промыслом Божиим этот храм стал хранителем этих реликвий на многие годы. В 1980-х гг. в соборе Иоаннова монастыря находился Центральный государственный архив Московской области, а в его корпусах — жилые квартиры и швейная фабрика.
В 1992 г. сохранившийся чудом грандиозный монастырский комплекс был передан РПЦ, а в 1995 г. здесь возобновились богослужения. Скоро Священный синод РПЦ принял решение об открытии Иоанно-Предтеченского женского монастыря. В 2002 г. в древнюю обитель вновь возвратились чтимые ее святыни: иконы святого Иоанна Предтечи с обручем и преподобной Елизаветы Чудотворицы.
Сретенский монастырь и Владимирская икона Божией Матери
Монастырь был основан в 1397 г. великим князем Московским Василием I, сыном Дмитрия Донского, в честь памятного Сретения (встречи) главной чудотворной святыни земли Русской — Владимирской иконы Божией Матери и ее милостивого заступничества от страшного нашествия Тамерлана. Приближение его многотысячного войска, разграбившего тогда Елец, не было неожиданностью для Москвы, и восемнадцатилетний князь Василий Дмитриевич успевает собрать воинскую рать и выступить под Коломну. Там, на берегу Оки, он твердо встал с войсками в ожидании грозного неприятеля. Дабы придать уверенности народу в победе, он повелел митрополиту Киприану перенести родовую святыню Рюриковичей в Москву. Две недели чудотворный образ в сопровождении княжеских ратников несли на руках из града Владимира. Согласно летописи, 26 августа 1395 г. серпуховской князь Владимир Андреевич, дядя Василия, в сопровождении бояр и духовенства встретил его на Кучковом поле, у деревянной церкви Марии Египетской. Поставив драгоценную святыню в церкви, они отслужили благодарственный молебен по случаю прибытия иконы на московскую землю, а потом, подняв ее на руки под возгласы ликующей толпы «Мати Божия! Спаси землю Русскую!», перенесли в Успенский собор Кремля. На следующий день Тамерлан, неожиданно для всех, «убояся и устрашися»: повернул все свое многоязычное войско от русских пределов на юг. Москва была спасена, и это чудо спасения было справедливо приписано милостивому заступничеству Владимирской иконы Божией Матери. В память избавления от иноплеменного нашествия на месте встречи чудотворного образа Богородицы был заложен храм, а в 1397 г. основан монастырь, получивший от горожан наименование Сретенского. Ежегодно сюда (26 августа) переносится драгоценная икона крестным ходом из Кремля, установив в Москве празднование Сретения Владимирской иконы, ставшего главным местным праздником столицы. Монастырь до революции имел статус заштатного, но сама чудотворная святыня и место ее встречи стали великими страницами русской истории.
Согласно церковному преданию, чудотворная икона Божией Матери была написана евангелистом Лукой и около 1131 г. преподнесена Юрию Долгорукому Константинопольским патриархом Лукой Хризоверхом. Первоначально драгоценный образ находился в женском Богородичном монастыре Вышгорода, недалеко от Киева, откуда его вывез князь Андрей Боголюбский, сбежавший в северную Русь. В 1161 г. икона устанавливается в Успенском соборе Владимира, по которому она и получила свое наименование (историю образа см. статью «Успенский собор во Владимире»).
Привезенная в Москву Владимирская икона Божией Матери не раз помогла Московскому царству в чудесных избавлениях от захватчиков, как, например, от набегов хана Едигея в 1408 г., ногайского царевича Мазовши в 1451 г., ордынского хана Ахмата в 1480 г. (стояние на Угре). Милость ее была также явлена в 1521 г. в заступничестве от крымского хана Махмет-Гирея, а также известно много других примеров благодатной ее помощи граду и горожанам. Было установлено празднование Владимирской иконы в память спасения Москвы: от нашествия Махмет-Гирея — 21 мая; от нашествия Ахмата — 23 июня; и от нашествия Тамерлана — 26 августа.