Следствие тянулось более года. Хотя были исписаны десятки томов этого дела, но обосновать обвинение в «государственном перевороте» было невозможно. Юридической основы обвинений найти не удалось. В каком «перевороте» против СССР, «сговоре с целью свержения власти» можно было обвинять «путчистов», когда «перевернула» и развалила Советский Союз именно та нынешняя власть, которая теперь требовала от суда «наказать преступников». Ситуация была тупиковая, она, скорее всего, требовала прекращения дела. Но обвинители настояли на суде, хотя три раза меняли версию привлечения к ответственности.
К январю 1993 г., после окончания следствия и ознакомления с уголовным делом, спустя почти полтора года после ареста, все узники Матросской тишины были освобождены под подписку о невыезде.
Стало известно, что будут допрошены: О.Д. Бакланов, В.И. Варенников, В.А. Крючков, А.И. Лукьянов, Г.И. Янаев, О.Г. Шенин, В.Д. Стародубцев, А.И. Тизяков, Ю.С. Плеханов, В.С. Павлов, Д.Т. Язов и другие.
В середине мая 1993 г. суд принял решение, согласившись с настоятельным требованием подсудимых об отводе представителей обвинения, подчиненных Генеральному прокурору Степанкову (выпустившему накануне вместе с Лисовым книгу «Кремлевский заговор», где раскрыли тайну следствия), и обратился к парламенту с просьбой назначить независимых прокуроров.
23 февраля 1994 г. Госдума приняла постановление «Об объявлении политической и экономической амнистии». Военная коллегия Верховного Суда решила прекратить производство по делу ГКЧП. Но вышестоящая инстанция отменила это решение.
Наконец, 6 мая 1994 г. процесс над гэкачепистами завершился. На всех подсудимых была распространена амнистия. А.И. Лукьянов так резюмирует итог: «Попытка убрать с политической арены защитников советской Конституции и единства Союза ССР российским властям не удалась. А для тех же, кто нарушил Конституцию и развалил Союз, суд нашего народа еще впереди».
25 апреля 1993 г. подведены итоги референдума.
За доверие Президенту – 58 % голосовавших.
Одобрение политики Президента и правительства – 53 %.
За досрочные выборы Президента – 33 %.
За досрочные перевыборы народных депутатов – 41 %.
Президент Б.Н. Ельцин мог праздновать победу. Не внакладе вроде оказались и депутаты, однако их наступательная активность была поколеблена. Все знали, что Президент не забывает обид.
Ушел в отставку мэр Москвы Гавриил Попов. До этого он дважды устраивал шумный спектакль с отставкой, но… оставался. А сейчас ушел тихо. Правда, депутаты Моссовета возмутились, потребовали отчета, но поезд ушел. В чем причина? Сложно дилетанту вести хозяйство столицы, легче провозглашать демократические лозунги и произносить демагогические речи. Да, видимо, Г. Попов выполнил и личную задачу – прихватил в свое ведение великолепную учебную базу, на которой разместил новый Университет Америки, став его ректором. Б.Н. Ельцин назначил исполняющим обязанности мэра Ю.М. Лужкова – заместителя Попова.
1 мая в Москве произошли драматические события.
Накануне, 28 апреля, Ельцин под надуманным предлогом запретил проведение традиционного митинга трудящихся на Красной площади. Под митинг отвели Октябрьскую площадь и разрешили небольшое шествие демонстрантов от площади в сторону Крымского моста.
На митинг собралась 50-тысячная масса народа. Путь к центру им был закрыт. Тогда организаторы призвали манифестацию идти по Ленинскому проспекту к Воробьевым горам. Но власти быстро среагировали и перекрыли проспект у площади Гагарина, поставив там заслон из ОМОНа и грузовых машин. Из колонны группа демонстрантов, подойдя к заслону, попыталась раздвинуть машины, но на них накинулись омоновцы и начали избивать. На помощь группе пришла основная часть демонстрантов. Завязалось настоящее сражение. В ход пошли все подручные средства. Но и ОМОН получил подкрепление. Манифестация была разогнана. В результате пострадали около 500 человек, из них 40 госпитализированы. Вся ответственность за кровопролитие легла на московские власти.
5 июня в Кремле под эгидой Президента прошло Конституционное совещание. Обсуждали проект новой Конституции, опубликованный в «Известиях» лишь 30 апреля. По мнению основных разработчиков проекта – С. Алексева и С. Шахрая, Конституцию должен принять не съезд народных депутатов, а некая Конституционная ассамблея.
На совещание были приглашены: «заслуженные демократы», представители исполнительной и законодательной власти, бизнеса, творческой интеллигенции. В общем, был свой бомонд.
Выступили Б. Ельцин, затем «известный юрист» С. Алексеев и глава администрации С. Филатов. Речь Р. Хасбулатова была сорвана, так как ему не дали требуемого времени. В знак протеста Р. Хасбулатов, В. Зорькин, всего более ста человек покинули зал. В сущности, это был провокационный сбор, он только подбросил дров в костер разногласий.
Развивая политическое наступление, Президент и «демократы» добились восстановления Гайдара в правительстве Черномырдина.
Егор Гайдар стал к тому времени символом реформ и, главное, получил полное доверие Запада.