В 30 м к востоку был раскопан фундамент еще одного прямоугольного дома Геометрического периода. Открытый в 50-х годах памятник после затопления в 1961 г. почти полностью был разрушен. Рядом со "Священным домом" находилось небольшое абсидальное строение, названное
От гимнасия 1 в. до н.э. – I в. н.э. (В1) сохранилась часть палестры (внутреннего прямоугольного двора) и окружающих ее узких помещений. С северной стороны к нему примыкает резервуар для воды – возможно, использованный для римских дань. Также сохранилась часть гимнасия неизвестного назначения (В2). Среди находок Римского периода, найденных в различных участках Академии, несколько рельефов, среди которых выделяется архаический рельеф с изображением Гермеса и нимф, саркофаг III в. н.э., мраморная голова, императора (возможно, Галлиена), жертвенник II в. н.э. с надписью, фрагменты других надписей.
Неизвестны функции большого квадратного здания Г 4 в. до н.э. (40х40 м) К северо-востоку от него обнаружены фрагменты керамических метоп с рисунками и антефиксы второй половины 6 в. до н.э. – возможно, остатки более раннего общественного здания.
Римская Агора и Библиотека Адриана
Если после 86 г. до н.э., когда римский полководец Луций Корнелий Сулла осадил и захватил восставшие Афины, город начал приходить в упадок, то уже с 80 г. до н.э. его роль в торговле быстро восстановилась, поскольку во время второй Митридатовой войны (83-81 гг. до н.э.) понтийский полководец Ментофан разрушил большой рынок на острове Делос. В то же самое время происходила застройка греческой Агоры в Афинах – на открытые пространства, где раньше велась торговля, переносили памятники из других городов, например, храм Ареса перенесли сюда из Паллини, а алтарь Зевса – с холма Пникс. Кроме того, здесь основали большой одеон в честь Марка Випсания Агриппы, который был мужем единственной дочери Октавиана Августа. Постепенно торговля начала перемещаться со старой Агоры на площадь в 80 м к востоку от нее. Она и раньше использовалась для продажи товаров, как и многие другие площади вокруг греческой Агоры, однако на ней не было зданий, и она была всего лишь открытым рынком. Очевидно, что власти города хотели перенести всю торговлю на эту площадь, а старую Агору оставить для административных и представительских целей – в конце 1 в. до н.э. даже оставшиеся небольшие магазины и частные дома стали сноситься.
Новая агора была, без сомнения, нужна афинянам, поскольку они даже послали своего представителя Герода Аттика к Юлию Цезарю. В 51 г. до н.э. он пожертвовал на агору деньги, желая получить поддержку афинян, склонявшихся на сторону Помпея Великого, также финансировавшего строительство нового рынка. В 47 г. до н.э., когда Цезарь лично приехал в Афины, проект Агоры был завершен и даже началось возведение здания, однако гражданская война 49-45 гг. до н.э. и последовавший за ней экономический кризис, остановили строительные работы.
После морского сражения вблизи мыса Акций (31 г. до н.э.), в котором Октавиан Август одержал победу над Марком Антонием, Афины вновь расцвели, и работы над новой агорой через какое-то время продолжились. Поскольку, не смотря на все привилегии, афинянам никогда не нравилось римское господство, Августу во время визита в город в 19 г. до н.э. пришлось пообещать деньги на новый рынок, который с тех пор носит название "агора Цезаря и Августа" или просто "Римская агора". Ее строительство было закончено, вероятно, в 11-10 гг. до н. э.
В 267 г., во время вторжения в Афины герулов, вокруг города была в срочном порядке построена стена, для которой материалы брались из всех ближайших монументов. При этом сильно пострадала греческая Агора, тогда как Римская агора и библиотека Адриана, хотя и понесли потери, но превратились в административный и коммерческий центр Афин.
В византийский и поствизантийский период Аимская агора застраивалась зданиями, магазинами и церквями. Например, здесь была построена церковь Григоруса, церковь Ильи Пророка (XII в., разобрана в XIX в. во время археологических раскопок), церковь Спасителя Пазаропорта (не сохранилась) и мечеть Завоевателя (1456 г.).
Из-за плотной застройки обнаружить Римскую агору не удавалось вплоть до XVIII в.