Первыми прототипами двухместной версии должны были стать самолеты Ar-234 V30, V31, V33 и V34. Два первых, кроме новой кабины, должны были оснащаться увеличенными колесами шасси. Их планировалось использовать для аэродинамических испытаний. Ar-234 V32 и V33 должны были быть эталонами для серийных Ar-234 С-5, с тем, что второй из них, позднее будет передан в программу ночного истребителя – «Projekt I». Ar-234 V34 должен был оснащаться двумя двигателями HeS 011. Двухместную кабину должны были иметь и последующие прототипы (с V35 до V40, предназначавшихся для испытаний новых крыльев).
Версия Ar-234 С-6, вероятнее всего, в основном не отличалась от Ar-234 С-5, за исключением того, что вместо задней пары пушек в фюзеляже монтировались фотокамеры. К тому же под фюзеляжем можно было подвесить контейнер с двумя пушками MG 151/20, стреляющими назад. Ar-234 С-7 был проектом ночного истребителя с полностью перекомпонованной кабиной, и оснащенным радаром. Последней разновидностью версии «С» должен был стать «кризисный» Ar-234 С-8. Проект этого самолета возник в связи с проблемами поддержания производства двигателей BMW 003 хотя бы на минимальном уровне, а также из-за нехватки топлива для них. Новая версия «Блица» должна была оснащаться двумя двигателями Jumo 004D с тягой по 1050 кг и вооружаться только двумя (или одной) пушками MG 151/20. При этом сохранялся неизменным фюзеляж от варианта С-3. Это был бомбардировочный самолет, несущий до 1500 кг бомб. Предполагалось, что из-за использования новых двигателей скорость упадет на 90 км/час.
На базе одноместного Ar-234 С-3 с четырьмя двигателями BMW 003 должны были появиться две очередные версии, представленные уже в мае 1944 года. Это были: высотный истребитель, тактический бомбардировщик и штурмовик. Первый проект, «Hohenjager» (от 20 мая) был повторением классического планера одноместной версии. Вооружение состояло из четырех пушек MG 151/20 (двух в нижней части кабины и двух в «ванне» под фюзеляжем). Предусматривалась возможность подвески под гондолами двигателей контейнеров с одиночными пушками или дополнительных топливных баков. Место пилота было хорошо забронировано. Высокие расчетные характеристики «Hohenjager» должны были позволить ему перехватывать самолеты союзников на высотах до 12000 м.
Другим проектируемым вариантом, который как предполагалось должен будет оказывать непосредственную поддержку наземным войскам был «Heeresflugzeug» – хорошо бронированный самолет, переносящий разнообразные виды вооружения для атаки наземных целей. Это могли быть, например три блока направляющих ракетных снарядов Flak 42 (по три в пакете), ракето-бомбы SC- 500RS, три контейнера с противопехотными бомбами SD-4 (в каждом контейнере размещалось по 74 маленьких бомб) или иные средства борьбы с наземными войсками.
Кроме проектирования новых вариантов самолета, конструкторы работали также над полевыми модернизационными наборами «Rustsatz», позволявших быстро приспособить планер Ar-234С для различных заданий. Некоторые из них нашли практическое применение, но большинство осталось только в проектах. Часть этих модификаций возникла как реакция на приказ Гитлера от 10 января 1945 года, об усилении вооружения Ar-234 и Ме-262. Ниже приводится список всех известных на сегодняшний день наборов, идентифицированных на основании немецких документов.
R1 – подфюзеляжный контейнер с двумя стреляющими вперед пушками MG 151/20 с боезапасом 250 снарядов на ствол. Масса контейнера вместе с боеприпасами составляла 265 кг;
R2 – подобный контейнер, но с пушками стреляющими назад;
R3 – подфюзеляжный контейнер с двумя стреляющими вперед пушками МК 108, калибра 30 мм, с боезапасом по 100 снарядов на ствол. Масса контейнера вместе с боеприпасами составляла 300 кг. Этот «Riistsatz» предназначался в основном для модификации Ar-234P;
? – одна или две пушки МК 103 калибра 30 мм, смонтированные в подфюзеляжном контейнере;