14 сентября гидросамолёты соединения «R» участвовали в поддержке с воздуха очередной попытки японских войск захватить удерживаемый американцами плацдарм на Гуадалканале. В предвечерние часы на бомбёжку отправились 19 F1M2 с парой 60-кг бомб каждый, которых прикрывала пара А6М2- N. В 17:30 гидроистребители были атакованы истребителями F4F «Уайлдкэт», сбившими одну машину. Пилот второго гидроистребителя смог отбиться и даже доложил о двух победах, но на самом деле ни один американский истребитель не был сбит. Всего в тот день истребительный отряд с «Камикава-мару» потерял трёх лётчиков, среди которых был младший лейтенант Кавасима Масаси, а также мичман Кавамура Макио, за день до того сбивший «Донтлес» над аэродромом Хендерсон- Филд.
После того как провал японского наступления стал очевиден, «Камикава-мару» сдал на гидроаэродром Шортленд остатки своей авиагруппы и 19 сентября отправился в Рабаул. Прибыв на место 21 сентября, уже через два дня гидроавианосец вышел в путь к базе Йокосука, куда прибыл 1 октября. В Йокосука корабль получил нового командира (им стал капитан 1 ранга Мацуда Такатомо).
Тем временем авиагруппа гидроавианосца не сидела без дела. Кроме обычных вылетов на разведку и бомбёжку, её пилотам пришлось отбивать, например, атаку Шортленда, произведённую утром 5 октября самолётами с авианосца «Хорнет» (15 бомбардировщиков-торпедоносцев TBF (из которых только 14 несли бомбы) под прикрытием 8 истребителей F4F). В этом бою японская авиация действовала не очень успешно (японцы потеряли один корректировщик с «Камикава-мару»,[* Была сбит на взлёте истребителями, но смог уйти на вынужденную посадку. При этом пилот (старшина 2-й статьи Танака Такэси) уцелел, а стрелок- радист (матрос 1-й статьи Накагава) погиб.] а американцы смогли отбомбиться по японским кораблям и потерь не понесли), но два A6M2-N под командованием старшины 1-й статьи Каваи Дзиро смогли на время отогнать один из бомбардировщиков. Следует отметить, что гидросамолёты оказались единственной защитой Шортленда с воздуха, поскольку размокшие из-за дождей взлётно-посадочные полосы помешали перебросить сухопутные истребители А6М3 из состава 2-й авиагруппы на расположенный на Бугенвиле аэродром Буин.
Также лётчики с «Камикава-мару» участвовали в защите конвоев, перевозивших подкрепления на Гуадалканал. Во время атаки одного из них, 4 октября, американскими истребителями из VF-72 (с авианосца «Хорнет») один из корректировщиков с «Камикава-мару» был подбит, но смог сесть на вынужденную к югу от Бугенвиля. Ещё один F1M2 был сбит американскими истребителями 7 ноября при защите конвоя из одиннадцати эсминцев под командованием капитана 1 ранга Сато Торадзиро. Несмотря на эту потерю, бой можно считать успехом японцев, поскольку их достаточно слабое воздушное прикрытие из 6 гидроистребителей (из 802-й авиагруппы) и 4 корректировщиков (из состава авиагруппы «Камикава-мару») смогло не только отразить атаки 29 американских истребителей, но и не дать 7 SBD и 3 TBF помешать доставке на Гуадалканал 1300 человек подкреплений.
Сам «Камикава-мару» покинул Йокосука 12 октября и уже 18- го числа был у Шортленда (с заходом в Рабаул). На следующий день он перешёл в Буин, где находился до 3 ноября. За время нахождения в Буине гидроавианосец 5 раз подвергался бомбёжкам тяжёлых бомбардировщиков В-17, во время последней из которых (1 ноября) получил небольшие повреждения.
Вернувшись на стоянку Шортленд, корабль уже 11 ноября снова отправился в Йокосука (прибыл 20 ноября). 28-го числа корабль вышел в обратный путь, 4 декабря прибыл на Трук, а уже 7 декабря бросил якорь у Шортленда. 11 декабря корабль занимался буксировкой торпедированного гидроавианосца «Санъё-мару» на новую стоянку, а также пополнением его запасов.
15 декабря гидроавианосец снова покинул Шортленд и через Трук отправился в Сасэбо (прибыл 25 декабря), где с 27 декабря 1942 г. по 15 января 1943 г. прошёл докование. 21 января корабль покинул Сасэбо и снова отправился к Шортленду (прибыл 29 января), заходя по дороге в Йокосука, на Трук и в Рабаул. К тому времени якорная стоянка у Шортленда давно стала небезопасным местом, и вскоре по приходе (1 февраля) находящийся там «Камикава-мару» был повреждён бомбами американских бомбардировщиков В-17 из состава 13- й воздушной армии. Пришлось гидроавианосцу идти на ремонт: сначала в Рабаул, потом на Трук (где корабль «подлатали» с помощью плавмастерской «Акаси»), а там и в Йокосука. Прибыв туда 11 февраля, через 5 дней корабль был переведён в Йокогама, где прошёл докование (18 февраля — 15 марта) и окончательный ремонт.