Первый образец J 35F, собранный на основе планера J 35А (номер 35082), взлетел 22 декабря 1961 года. Учитывая необходимость проведения большого объема работ при доводке нового электронного оборудования и ракетного вооружения, в программе испытаний одновременно принимали участие несколько самолетов (прототипы 35- 6, 35-7, 35-8, 35-9, 35–11, 35–12). Первый серийный J 35F взлетел 26 июня 1964 года. До середины 70-х ВВС получили 100 самолетов J 35F (серийные номера 35401-35500). Параллельно серийному производству проводились работы по улучшению электронного оборудования. В результате, все самолеты F версии, начиная с номера 35501, оснащались ИК станцией обнаружения целей S-71N (Hughes AN/AAR-4), установленной в носовой части за обтекателем РЛС.
Новый вариант, получивший обозначение J 35F2, выпускался в период с 1967 года по июнь 1972 (130 самолетов — серийные номера 35501-35630), общее количество самолетов этого типа было доведено до 230. Это были последние новые "Дракены", поставленные в Flygvapnet. В дальнейшем самолеты версии F проходили модернизацию и оставались в строю до 1989 года.
Даже после окончания серийного производства продолжались работы по повышению боевой эффективности истребителя. В середине 80-х было принято решение модернизировать вооружение и оборудование ранее выпущенных самолетов J 35F2.
Программу модернизации прошли 67 самолетов с наибольшим остаточным ресурсом (налет около 2300–2600 часов). Окончательный вариант "Дракена" получил обозначение J 35J (Johan). Вполне логично было бы присвоить самолету индекс G, но руководство ВВС решило иначе. Модернизированными самолетами предполагалось оснастить десятую флотилию F10 Angelholm-Barkakra, и для обозначения самолета решили использовали десятую букву алфавита — "J". J 35 J прослужили до начала поставки Saab JAS 39 Gripen и в конце 90-х годов завершили 29-летний период службы "Дракенов" в шведских ВВС. J 35J получил новое РЭО, включающее улучшенный радиолокатор, систему управления оружием, ИК сенсор, навигационную систему, систему опознавания "свой-чужой". Усиление конструкции крыла позволило довести максимальную нагрузку до 4 082 кг. В корневой части крыла был установлен дополнительный узел подвески вооружения. Несмотря на увеличение взлетной массы, выросшая до 7 830 кг тяга модернизированного двигателя RM6C позволила сохранить летные характеристики самолета на прежнем уровне.
Поскольку Швеция имеет относительно небольшую территорию, многие из ее основных авиабаз могут быть выведены из строя в течение первого получаса военного конфликта. Ключевым элементом оперативного применения военно-воздушных сил Швеции в годы "Холодной войны" была возможность использования рассредоточенных по территории страны авиабаз и сети полевых аэродромов. Это делало военно-воздушные силы менее уязвимыми в случае внезапной атаки противника. При возникновении угрозы нападения самолеты могли быть рассредоточены, и эффективно использоваться небольшими группами с нескольких десятков полевых аэродромов.
В соответствии с разработанной концепцией полевого базирования, все типы самолетов военно-воздушных сил Швеции от истребителей до транспортных самолетов имели возможность осуществлять посадку на ВПП длиной не более 800 метров и шириной около 16 метров. В качестве полевых аэродромов использовались специально подготовленные участки общественных автодорог с площадками технического обслуживания и средствами обеспечения полетов. На пунктах технического обслуживания полевых аэродромов осуществлялось послеполетное обслуживание, подготовка к следующему вылету, регламентные работы и устранение неисправностей. Время подготовки самолета к повторному вылету с нормальной боевой нагрузкой включающей 4 УР класса "воздух-воздух" не превышало десяти минут. Все необходимое для технического обслуживания доставлялось при помощи четырех автомобилей:
— "буксировщик" с прицепным агрегатом питания;
— топливная автоцистерна;
— "дозаправщик", оснащенный насосной станцией для дозаправки топливом, маслом и гидрожидкостью и кислородом;
— автомобиль для транспортировки ракет, боеприпасов и запасных частей.