В 1975 г. группа ученых под руководством британского биохимика Фредерика Сенгера занималась поисками конкретного вируса, который атаковал бактерии, и впервые определила нуклеотидную последовательность ДНК – провела секвенирование ДНК. За свою работу Сенгер в 1980 г. получил Нобелевскую премию по химии. Ученые поняли, что секвенирование ДНК, которое связано с определением структуры молекулы и всех ее вариантов, является задачей невероятных масштабов. В 1990 г. под руководством Джеймса Уотсона, определившего пространственную структуру ДНК, был запущен международный проект «Геном человека», целью которого стало определение последовательности нуклеотидов всего генома человека[333]
. Ученые завершили картирование генома в 2003 г. Его назвали книгой по истории видов гоминин, уходящей в глубину веков, и дорожной картой будущего, позволяющей раскрыть возможности генной терапии заболеваний, поскольку она указывает, где находятся конкретные гены и за что они отвечают.Так какое отношение генетика и ДНК имеют к палеонтологической летописи? С одной стороны, сначала казалось, что результаты изучения окаменелостей и данные, полученные в ходе анализа ДНК ныне живущих организмов, не соответствуют друг другу. Некоторые виды и роды плохо сохранились в горных породах из-за особенностей их строения или условий обитания, смерти и захоронения. Обратный расчет относительной численности видов на основе анализа их ДНК показывает, что определенные виды должны были со временем породить большее разнообразие, не учитывая вымирания и исчезновения. Тем не менее история жизни не подтверждает такой вывод: большинство типов организмов многократно вымирали и переживали времена расцвета и упадка.
Лишь в 2011 г. ученые обнаружили, что можно сопоставить палеонтологическую летопись и современные данные секвенирования ДНК для предков китообразных (таких морских животных, как киты, дельфины и морские свиньи) за счет внесения небольшого, но важного изменения в математические методы, применявшиеся ранее[334]
. В настоящее время существует 90 видов китообразных. Палеонтологическая летопись этих животных хорошо известна, поскольку они превосходно сохранились на морском дне. Киты и их китообразные родственники появились примерно 50 млн лет назад, и уже 10 млн лет назад подотряд зубатых китов насчитывал 150 видов, в два раза больше числа современных видов – 75. Зная это и изменив фиксированное значение смоделированной скорости расхождения на более реалистичное, ученым действительно удалось согласовать данные анализа ДНК и палеонтологической летописи.ДНК, сохранившаяся в летописи горных пород возрастом 700 тыс. лет и моложе и в последовательности аминокислот, относится к новой выделенной группе ископаемых – молекулярным ископаемым, которые представляют собой органические молекулы биологического происхождения, следы жизни в прошлом. Наряду с ДНК эти редкие находки включают белки, липиды и углеводы. Липиды наиболее устойчивы к распаду. Наиболее распространенной средой для консервации молекулярных ископаемых служат месторождения с керогенами (осадочные породы с высоким содержанием органического материала, который со временем превращается в нефть или уголь), состоящие из богатых органикой илов и сланцев, раковин и костей. Большинство молекулярных ископаемых – 80 % – находится в месторождениях такого типа. Керогены формируются в основном из океанского планктона, отмирающего и оседающего на дно, где происходит их захоронение. Со временем и под действием давления происходит процесс разрушения химических связей, материал становится текучим и превращается в углеводороды, например, в некоторых случаях в нефть. Изучение молекулярных ископаемых может дать ключ к идентификации самых ранних форм жизни в период «кислородной революции» 2,4 млрд лет назад за счет исследования эволюции метаболических путей[335]
. Исследователи стараются разделить историю развития трех доменов живых организмов на основе молекулярной информации и выяснить, как появился домен, имеющий первостепенное значение – эукариоты.На пути к единой синтетической теории эволюции