Относительно спокойно евреи жили в Нидерландах. Местные жители массово принимали кальвинизм, и Библия для них стала настольной книгой, которую они читали каждый день и даже делали в ней записи о важнейших событиях в своей жизни. За это их даже обвиняли в «реиудаизации» христианства. Свою борьбу за независимость они трактовали в библейских терминах: «Господь дал нам овладеть этой землёй и этим городом Амстердамом в тяжёлых битвах – подобно тому, как евреи овладели Кнааном». Испанский король Филипп II сравнивался с фараоном: «Один угнетал дом Йаакова рабством, а другой – Нидерланды – тиранией». Вестфальский мир 1648 г. подавался, как победа Давида над Голиафом. Они верили, что «тысячелетнее царство Христа» предполагает обращение евреев в христианство. Кафедра древнееврейского языка Лейденского Университета в это время официально именовалась кафедрой «по опровержению иудаизма».
Мараны, или «сфарадим», т. е. испанцы, как они себя называли, прибыли Испании и Португалии в Нидерланды после завоевания ими независимости в войне с Испанией (1566-1609). Главным местом обитания евреев в Нидерландах был Амстердам. Сначала еврейская община Амстердама существовала тайно (с 1590 по 1603 гг.), проживание евреев было разрешено официально только в 1615 г., однако, «каждому городу предоставлялось право проводить свою политику по отношению к евреям».
Голландские евреи в основу своей новой жизни заложили два принципа – «консервации святой общины» и чистоты крови. Даже уже обращённые в иудаизм не становились полноправными членами общины, их никогда не назначали на руководящие должности в общине. В 1644 г. было принято постановление о том, что евреи негритянского происхождения не должны вызываться к Торе и выполнять какие бы то ни было почётные обязанности в синагоге, «ибо это не способствует доброй репутации общины и её правления». В 1647 г. на еврейском кладбище отвели специальную секцию для погребения евреев-негров и евреев-мулатов.
Важное значение имело и духовное брожение в еврейской общине Амстердама. Многие испытали разочарование при столкновении еврейских норм и обычаев, строго регламентированной организации и сравнительно свободной духовной атмосферы в Нидерландах. Этот конфликт породил трагедию Уриэля Акосты и Баруха Спинозы.
В целом можно сказать, что в Нидерландах впервые в Европе евреи получили экономическое и персональное, хотя и не политическое, равноправие. Отсюда выходили поселенцы, создавшие новые общины на побережье Атлантического океана и Северного моря: в Антверпене, Лондоне, Гамбурге, в голландских колониях на островах Вест-Индии и в Северной Америке.