1 июля 58-я армия получила приказ в очередной раз усилить оборону побережья и не допустить высадки десанта. Эту задачу выполняло 6 стрелковых дивизий, 3 артиллерийских полка и 3 дивизиона БЕПО (всего в их составе было 9 бронепоездов). В резерве у армии находились 4-й Гвардейский кавалерийский корпус и 2 истребительно-противотанковых бригады. Во всех прибрежных городах были созданы крупные гарнизоны, а в тыловой полосе – сеть опорных пунктов (Маргаритовка, Шабельск, Должанская, Камышевская и др.) Соответствующие задачи были поставлены и авиации.
Между тем в начале июля немецкие катера провели еще один рейд к побережью, обстреляв позиции советских войск в устье р. Протока (выпущено 300 снарядов), что еще раз убедило наше командование в подготовке десанта.
Кроме того, советское командование по-прежнему считало весьма вероятным применение вермахтом химического оружия, в том числе новейших отравляющих веществ, о создании которых докладывала разведка. Еще в середине июня весь летный состав полков 4-й воздушной армии был ознакомлен с указанием Ставки ВГК «Об изжитии химического невежества, недооценки химопасности и поднятия дела химподготовки на должную высоту». Судя по стилю названия, оно было составлено лично вождем. В рамках указанного «изжития» в авиационных полках стали проводиться т. н. химические дни, во время которых летчики, по заранее составленному графику, часть времени (в том числе дежурства на аэродромах) проводили в противогазах. При этом продолжительность тренировок постепенно повышалась. Так, в 298-м ИАП начали с 30 минут, а уже к началу июля личный состав натренировался жить в противогазе до 6 часов.
Что касается немцев, то они использовали временную передышку на Кубанском фронте для кадровых перестановок. 25 июня командующий 17-й армией генерал-оберст Рихард Руофф был снят с занимаемой должности и переведен в резерв фюрера. С чем было связано это решение, не совсем понятно, точнее, совершенно непонятно. Казалось бы, Руофф, в отличие от многих командиров вермахта, смог буквально выполнить категоричный приказ Гитлера – удержаться любой ценой. Причем, в отличие от других, не получал почти никаких резервов и действовал в духе идей чучхе – «с опорой на собственные силы», отразив все мощные советские атаки несколькими имевшимися дивизиями. Напомним, оказавшийся в аналогичной ситуации Вальтер Модель, который в течение 1942 г. отразил все атаки на Ржевский выступ, был награжден дубовыми листьями к Рыцарскому кресту, получил славу великого спеца по обороне, а позднее – звание генерал-фельдмаршала и прозвище «пожарник фюрера». Но у Руоффа был серьезный «недостаток», он слишком часто предлагал вышестоящему командованию отойти с занимаемых позиций, многие решения принимал без санкции начальства и вообще был неприятен фюреру.