В 18.30, немного приведя себя в порядок, советские войска снова предприняли наступление, но опять увязли в немецкой обороне. ВВС СКФ в этот день выполнили 537 самолето-вылетов, из которых 408 пришлось на 4-ю воздушную армию и 129 – на ВВС ЧФ. Основными целями были немецкие транспорты в Керченском проливе и порты. Летчики донесли о потоплении 8 барж и транспорта водоизмещением 2000 тонн. В воздушных боях, по советским данным, было сбито 12 самолетов при 6 потерянных. 230-я ШАД выполнила 100 вылетов, половина из которых пришлась на штурмовики. Экипажи последних доложили о 13 уничтоженных автомашинах и 2 потопленных баржах. Еще о 6 потопленных судах доложили экипажи 622-го ШАП. Летчики 863-го и 979-го ИАП заявили о 6 сбитых «мессершмиттах», еще один был на счету 805-го ИАП. Собственные потери дивизии Гетьмана составили четыре ЛаГГ-3 и два Ил-2; 214-я ШАД, выполнившая 49 вылетов, отделалась одним поврежденным штурмовиком, совершившим аварийную посадку на фюзеляж. Немцы действительно понесли в этом фактически последнем воздушном бою за время битвы за Кубань серьезные потери. Над морем были сбиты Bf-109G-4 W. Nr. 20658 из 3./JG52 и Bf-109G-6 W. Nr. 20758 из 7./JG52. Пилоты фельдфебель Петер Шухбауэр и унтерофицер Хайнц Мартин пропали без вести. Еще один Bf-109G-4 W. Nr. 16122 фельдфебеля Антона Гасснера из 1-й эскадрильи JG52 разбился во время аварийной посадки. Летчик получил тяжелые травмы. Отметим, в этот день стояла ясная погода, видимость в районе Керченского пролива составляла 10–15 км.
Тем временем в 17.00 по берлинскому времени (19.00 по Москве) началась погрузка на транспорты последних арьергардов 17-й армии. Через полтора часа процесс был завершен, а в 22.30, когда паромы находились далеко от темного берега, были дистанционно подорваны заряды, заложенные под пятнадцатью причалами в Ильиче, которые ранее были специально построены для операции «Брунхилд». Эти взрывы, пламя от которых было хорошо видно из Крыма, стали как бы финальной точкой всей битвы за Кубань, длившейся в течение 8 месяцев. Немного позднее завершилась и эвакуация немцев с косы Тузла.
В 04.00 9 октября последнее судно достигло крымского побережья. Эвакуация Кубанского плацдарма (флотская операция «Викинг», которая заслуживает отдельного описания) была завершена. К этому моменту в Крым было эвакуировано 177 355 немецких солдат и офицеров, 50 139 солдат и офицеров союзников (румын и словаков), 28 436 т. н. «Хиви», 16 311 раненых, 27 456 гражданских лиц (всего, начиная с февраля 1943 г., с Кубани было вывезено более 60 тысяч гражданского населения), 115 477 военных грузов (27 670 тонн боеприпасов, 29 500 тонн продовольствия, 13 940 тонн фуража), 21 230 автомобилей, 74 танка и штурмовых орудия, 1815 орудий и 74 657 лошадей. Кроме того, транспортные самолеты люфтваффе вывезли с полевого аэродрома Славянская еще 15 661 человек и 1153 тонны военного имущества. При эвакуации было уничтожено 82 300 тонн (53 200 тонн рельсов и шпал, 10 150 тонн угля, 16 500 тонн фуража), 109 паровозов и 1150 вагонов. Таким образом, отступление с северо-западного Кавказа в 1943 г. стало одной из немногих немецких операций по эвакуации войск с плацдарма, в ходе которой не была брошена масса тяжелой техники. Недостроенный Крымский мост и канатная дорога были взорваны незадолго до того, как последние части уплыли в Керчь.
Согласно журналу боевых действий СКФ, Таманский полуостров был полностью «очищен» к 11.00 9 октября. При этом, чтобы скрыть свой очередной провал, последнюю фазу эвакуации штаб Петрова описал вышестоящему начальству как паническое бегство: