2.01.1942 г. КР прибыл в Давао, где вошел в состав Восточных сил вторжения на о. Ява. С 9-го по 16.01.1942 г. он обеспечивал оккупацию Менадо и Кема (о. Целебес). 19 (по другим данным, 21 ).01.1942 г. Нагара вышел в море и направился в район Кендари, где ожидал приказа о начале высадки на юго-восточное побережье о. Целебес. 22.01.1942 г. во время налета авиации противника, выполняя маневр уклонения, КР на большой скорости (около 23 уз.) столкнулся с ЭМ Хацухару и получил тяжелые повреждения корпуса с правого борта в районе КО. 24.01.1942 г. корабль возвратился в Давао, где была восстановлена боеспособность. 4.02.1942 г. Нагара пришел в Кендари и вновь возглавил соединение контр-адмирала Кубо. 6.02.1942 г. он направился к южному побережью о. Целебес и с 8-го по 12.02.1942 г. обеспечивал оккупацию Макассара. 17.02.1942 г. КР вышел в море из Макассара идо 19.02.1942 г. крейсировал к северу от о. Бали (у восточного побережья Явы), а затем участвовал в операции по его захвату (в ночь с 19-го на 20.02.1942 г.). С 23-го по 26.02.1942 г. корабль эскортировал КОН из Макассара в Бали и 8.03.1942 г. прибыл в Батавию. До апреля 1942 г. Нагара входил в состав Второго Южного Экспедиционного флота.
10.04.1942 г. он возглавил вновь сформированную 10ю флотилию ЭМ Третьего флота (флаг контр-адмирала Сусуми) и пришел в Майдзуру, где с 12.04 по 4.05.1942 г. на верфи флота провели текущий ремонт корпуса и механизмов (в доке с 12-го по 24.04.1942 г.), счетверенную установку 13,2-мм пулеметов на платформе перед носовой надстройкой заменили на две спаренные того же калибра. В конце мая 1942 г. КР вошел в состав Ударного авианосного соединения вице-адмирала Нагумо и стал флагманом Эскортного отряда ЭМ контр-адмирала Кимура. С 26.05 по 13.06.1942 г. корабль участвовал в операции по захвату о. Мидуэй. После ее завершения он пришел в Хасирадзиму и до 25.06.1942 г. оперировал между Йокосукой и Имараби. С 26.06 по август 1942 г. вместе с 10-й флотилией ЭМ Нагара занимался боевой подготовкой во Внутреннем японском море. 10.08.1942 г. в охранении АВ вице-адмирала Нагумо он пришел на атолл Трук. С 16.08 по 5.09.1942 г., с 9-го по 23.09.1942 г. и с 1-го по 30.10.1942 г. он в составе Авангардной группы контр-адмирала Абе Ударного Авианосного Соединения вице-адмирала Нагумо выходил в район к северу от Соломоновых о-вов для обеспечения доставки на Гуадалканал подкреплений и возможного боя с американскими АВ. В ходе этих операций, корабль контактов с противником не имел и занимался в основном эскортированием тяжелых кораблей. 1.11.1942 г. Нагара передали в распоряжение командующего Восьмым флотом (в соответствии с желанием экипажа) и с 3.11.1942 г. он базировался на Рабаул. 6.11.1942 г. КР в составе Передового (добровольческого) соединения контр-адмирала Абе направился к Шортленду для обеспечения перехода к Гуадалканалу транспортных отрядов ЭМ и большого КОН из Буин-Фаиси. С 7-го по 12.11.1942 г. он крейсировал в районе к юго-западу от о. Гуадалканал. Во время второй попытки прорыва к острову КОН из Буин-Фаиси в ночь на 13.11.1942 г. Нагара принял участие в бою у мыса Тассафаронг с американской тактической группой контр-адмирала Кэллегхена. Днем он отошел к рифам Онтонг-Ява, где соединение Абе передали в подчинение вице-адмиралу Кондо. В ночь на 14.11.1942 г. КР у о. Саво первым обнаружил и осветил прожектором американские ЛК Washington и South Dakota. В ходе последовавшего боя в корпус корабля попал снаряд с КР San Francisco (вышло из строя 140-мм орудие № 5, и возникла небольшая течь), но он сохранил боеспособность и вышел из-под обстрела, потопив при этом артиллерийским огнем ЭМ Preston. 15.11.1942 г. Нагара возвратился на Шортленд. 20.1 1.1942 г. КР прибыл в Кавиенг, где возглавил 4-ю флотилию ЭМ. С 20-го по 27.1 2.1942 г. он перешел в Майдзуру, где до 14.01.1943 г. провели восстановительный ремонт корпуса и демонтировали 140-мм орудия № 5.
20.01.1943 г. корабль в охранении крупного КОН вышел из Токуяма и направился к атоллу Трук.