Все вышеперечисленные некатолические Ордены в 1961 г. объединились в «Международный альянс Орденов Святого Иоанна».
Имущество и владения Державного Ордена Святого Иоанна Иерусалимского, конфискованные в разное время во многих государствах, так и не были ему возвращены. Жадность монархов сделала свое дело. И Россия не была исключением. В то же время продолжался прием в Орден новых членов из числа православных христиан.
Последнее утверждение кандидатов в «рыцари юстиции» (справедливости) имело место на собрании («конвенте») Баварско-Русского «языка» 2 июля 1810 г. в Катанье. Во всяком случае, это было последнее собрание данного языка, для которого уничтожение Российских Приорств означало, что его существованию пришел конец. Последний российский подданный не-католик был принят в Мальтийский Орден 31 мая 1819 г. Им стал православный князь Александр Голицын. В то же время подданные Российской Империи католического вероисповедания по-прежнему продолжали приниматься в категорию Рыцарей Почета (почетных рыцарей) Мальтийского Ордена, известных также, как Рыцари Почета и Чести, вплоть до самого конца существования Российской Империи. На вступление российских подданных в Орден Святого Иоанна Иерусалимского, как в категорию рыцарей юстиции, так и рыцарей чести, требовалась особая Императорская лицензия, что специально оговорено в «Правилах, определяющих процедуру приема в Орден знати Российской Империи», составленных еще Павлом I 15/26 февраля 1799 г., утвердившим право полутора тысяч представителей российской знати быть принятыми в Российское Великое Приорство Державного Ордена Святого Иоанна.
Связи между Мальтийским Орденом и Российским Императорским Домом, однако, не прекращались и после 1817 г. Так, в 1818 году граф Каподистрия написал Лейтенанту Великого Магистра, что со стороны Александра I Ордену всегда будет оказана протекция. В январе 1827 г. такое же заверение Мальтийский Орден получил и от Императора Николая I, через графа Нессельроде. За исключением Александра II, все русские Императоры после Павла I имели звание бальи Большого Креста Ордена Святого Иоанна Иерусалимского. Зато Александр II был почетным бальи Прусского королевского Ордена иоаннитов (на многих из сохранившихся портретов этого императора он изображен с этим прусским иоаннитским крестом).
Как мы помним, Павел I и его сыновья Александр I и Николай I получили звания бальи Большого Креста еще от Великого Магистра фон Гомпеша. Александр III получил звание бальи Большого Креста Суверенного Мальтийского Ордена 29 декабря 1875 г., еще в бытность свою Цесаревичем, от Лейтенанта Великого Магистра фра Джованни Батиста Чечи а Санта Кроче. В ответном письме Цесаревич писал:
“Господин Барон! Я получил письмо, которое Вы любезно адресовали мне, передав мне Знаки Большого Креста Мальтийского Ордена, а также Буллу о моем назначении в звании Бальи этого Ордена. На что мой Августейший отец Император дал мне позволение, и я принял их с удовольствием. Цельность Христианского мира была положена в основу создания Мальтийского Ордена, что обеспечивает ему все наши симпатии. Пожалуйста, заверьте в этом Совет Ордена и примите изъявление моей благодарности за те чувства, которые Вы выразили от себя лично и от имени Ордена”.
В феврале 1881 г. тот же Лейтенант, ставший Великим Магистром, возвел в звание бальи Мальтийского Ордена русских Великих Князей Сергея и Павла Александровичей. В феврале 1891 г. в звание бальи Большого Креста Ордена Святого Иоанна Иерусалимского был возведен будущий Император Николай II, а 7 апреля 1896 г. оно было даровано и Его супруге, Императрице Александре Феодоровне.
Известно, что Император Николай I (1825-1855) на свои собственные средства реставрировал две церкви Мальтийского Ордена при Пажеском корпусе в Санкт-Петербурге. Речь идет о православном храме и о католической капелле (часовне) мальтийских рыцарей, известных как "Русское Приорство" Ордена Святого Иоанна Иерусалимского. Оба храма были сооружены в 1798-1802 гг. на территории бывшего Воронцовского дворца (где тогда размещался Капитул Державного Ордена Святого Иоанна Иерусалимского, а с 1810 г. – Пажеский корпус) по приказу Императора Павла и по проекту архитектора Джакомо Кваренги.