Приведенное выше упоминание о возможных подозрениях вдовствующей королевы Юлианы-Марии в нечистой игре, как показали дальнейшие события, имело под собой более чем веские основания. Если ранее она не участвовала в политической жизни, теперь настало время проявить себя. Ее сын Фредерик, неглупый и амбициозный юноша, достиг возраста восемнадцати лет и жаждал попробовать себя в роли правителя королевства, что при таком умственно нездоровом сводном брате и монархе естественно вытекало из всех понятий здравой логики. Поддерживаемый своими воспитателями, Шнеедорфом и Гульдбергом, членами датского патриотического движения, а также своевременно переметнувшимся на сторону вдовствующей королевы Шаком фон Рантцау, он убедил мать составить заговор против Штруэнзее. Если у нее еще и оставались какие-то сомнения, их полностью развеял секретный документ, выкраденный из личных бумаг Штруэнзее и переданный ей придворным Петером Зумом, имевшим ранг докладчика. Содержание его якобы свидетельствовало о том, что Штруэнзее совместно с Каролиной-Матильдой планируют государственный переворот с целью заставить короля отречься от престола. Особый гнев матери и сына вызвали слухи о том, что Штруэнзее работает над новой конституцией, которая должна превратить Данию в конституционную монархию. Такое покушение на абсолютную власть короля никак нельзя было допустить.
Вокруг Юлианы-Марии и ее сына быстро сплотилось недовольное дворянство и офицеры. Подход, однако, был тонким: для привлечения на свою сторону общественного мнения был пущен слух, что Каролина-Матильда и Штруэнзее задумали отправить короля в заключение и объявить королеву регентом. Само по себе это было абсурдным, ибо наличие действующего, хотя и безумного короля, служило любовникам надежным защитным прикрытием. Быстро распространившись в народе, эти измышления, тем не менее, упали на благодатную почву. Вскоре среди населения стали усиливаться настроения как против «бесстыжей» англичанки, так и против ее фаворита, прячущего от народа помазанника Божьего. Многим обывателям не нравились нововведения, совершенно перевернувшие привычную жизнь: праздничные развлечения и исполнение светской музыки по воскресеньям, ранее предназначенным для молитвы и богоугодных размышлений, казались им святотатством.
Нельзя сказать, что любовники оставались в полном неведении о грозившей им опасности. В конце августа фрейлина королевы Анна-Софи фон Бюлов нашла на лестнице во дворце письмо, адресованное какой-то даме, в котором говорилось о заговоре. Якобы на общественном празднике, намеченном на конец сентября, заговорщики должны были выступить в качестве защитников короля и арестовать Каролину-Матильду и Штруэнзее. Это обеспокоило любовников, праздник отменили под предлогом нездоровья короля, а охрану резиденции усилили. По-видимому, реформатор начал осознавать, чем могут обернуться его поспешные нововведения и какой опасностью чревато его положение. По легенде, он упал к ногам королевы, умоляя ее позволить ему ради их же спасения покинуть страну, но ослепленная страстью Каролина-Матильда не могла отказаться от самого дорогого для нее человека. Штруэнзее тогда же признался одному из своих друзей, что сохраняет свой пост только вследствие поддержки королевы. Ходили слухи, что британский дипломат предлагал лейб-медику большую сумму денег, дабы тот покинул страну, однако документальных свидетельств этому не сохранилось. В конце ноября двор переехал во дворец Фредериксборг, причем по приказу Штруэнзее охрана его была усилена.
8 января 1772 года двор переместился во дворец Кристианборг, и заговорщики решили, что приспела пора действовать. 15 января в резиденции вдовствующей королевы были тщательно обсуждены все детали переворота. 16 января в придворном театре дворца Кристианборг должен был состояться традиционный бал-маскарад, который участники заговора сочли наиболее удобным отправным моментом для осуществления своих планов.
В 4 часа утра 17 января были арестованы Каролина-Матильда, Йоганн-Фридрих Штруэнзее и Эневольд фон Брандт. Рантцау лично отвез королеву вместе с маленькой дочерью в замок Кронборг в Эльсиноре, где ее поместили под строжайший надзор тюремщиков. Сопровождать ее разрешили только фрейлине Мёстинг, которая была настроена весьма скверно по отношению к своей повелительнице. Позднее для прислуживания к королеве было приставлено еще несколько придворных из числа тех, кто откровенно ненавидел ее. Хотя Штруэнзее приобрел свою неограниченную власть исключительно манипулированием слабовольным и психически нездоровым королем, Каролина-Матильда представляла собой его мощного союзника. С ней нельзя было не считаться, а потому надо было изолировать и ее.