Руководящим принципом политики Восемнадцатой династии было обеспечение безопасности страны от вторжения других азиатских племен. Аменхотеп III (1557–1501 до н. э.) завоевал Сирию и установил контроль над ней. Он использовал регулярный флот, находившийся уже на следующей ступени развития египетского мореплавания. Его преемник Тутмос I смог считать Евфрат восточной границей Египта. Но это вовсе не означало, что все внимание было сосредоточено на восточных берегах Средиземноморья, а Красное море игнорировалось. Правительница той же династии Хатшепсут в самом начале XV в. до н. э. отправила экспедицию по Красному морю в Пунт, землю на юге Египта, которая, вероятно, включала Нубию, Сомали и др. Описание ее флота, опыт в Пунте и сокровища, доставленные оттуда, изображены на стенах ее храма в Дер-эль-Бахри. Царица подготовила свой флот на Ниле и отправила его на Красное море по каналу, соединявшему Пелузийский рукав Нила с Суэцким заливом. Геродот утверждает, что этот канал был начат при Нехо из Двадцать шестой династии, однако, несомненно, он имеет в виду его восстановление и очистку после того, как тот был заброшен при Двадцатой и последующих династиях. Согласно Геродоту, «вода в него проведена из Нила немного выше города Бубастиса. Затем канал проходит мимо аравийского города Патума и впадает в Красное море. Сначала канал пересекает часть египетской равнины, примыкающую к Аравии. Южнее этой низменной полосы возвышается гора, которая тянется до Мемфиса, где находятся каменоломни. У подножия этой горы канал долго идет в направлении с запада на восток, затем поворачивает на юг в ущелье, ведущее через город, и, наконец, впадает в Аравийский залив» (Геродот, 2: 158). Судя по всему, он активно использовался в эпоху Среднего царства, но был заброшен при Двадцатой династии. Хотя Рамзее III и его преемники держали флот в Красном море, но, вероятно, предпочитали использовать порт рядом с Косейром и путь через Вади-Хаммамат. Плиний полагает, что он достиг Горьких озер, через которые сейчас пролегает Суэцкий канал, и не пошел дальше из-за разницы в уровнях между Красным морем и Нилом. Однако Диодор утверждает, что его устье было в районе Арсинои, то есть недалеко от современного Суэца. Канал несколько раз заносило песком, после чего он подвергался очистке. Он был восстановлен Птолемеями, снова открыт средневековыми халифами и поддерживался в рабочем состоянии до открытия пути в Индию вокруг мыса Доброй Надежды, после чего «наземный путь» оказался ненужным. Его местонахождение можно видеть и сейчас, и вдоль его берегов до сих пор сохранились насыпи.
При Восемнадцатой династии впервые упоминается Кефтиу. Это название, вероятно, обозначает землю и народ Крита. В период царствования Девятнадцатой и Двадцатой династий мореплаватели с севера впервые стали досаждать египтянам и у средиземноморского побережья Египта, и у берегов Сирии, которая тогда была египетской провинцией. Первые упоминания о них встречаются в Амарнском архиве, где их называют «шерданы». Более подробный рассказ – на стенах храма Мединет-Абу. В нем Рамзее III описывает, как прогнал этих морских разбойников, которые пытались обосноваться на побережье Египта. Их также называли
В храме Карнака есть праздничный зал Тутмоса III, того же монарха, который впервые упомянул Кефтиу, а на стенах – перечень цветов, растений, птиц и животных, которых можно увидеть в садах храма. Многие из них, вероятнее всего, привезены из Сирии. Завоевание Сирии последовало за изгнанием гиксосов и явилось мерой для предотвращения вторжения в Египет других азиатских племен. Ее удерживали до времени правления Эхнатона (1375–1358 до н. э.), и в Амарнском архиве есть много сведений о проблемах, связанных с волнениями в Сирии, итогом которых стала полная потеря провинции. Сети I из следующей династии (1313–1292 до н. э.) ее вернул, и провинция некоторое время удерживалась с помощью регулярного флота, находившегося на Средиземном море, но при Рамзесе Ш она была потеряна уже навсегда.
Упадок египетской власти в Сирии сопровождался появлением финикийцев, занявших место главных торговцев и мореплавателей Средиземноморья. Происхождение этого народа настолько неясно, что многие современные авторы предпочитают обходить этот вопрос молчанием. С уверенностью можно утверждать лишь то, что они были «морским народом» Сидона и его колоний и там с самого раннего периода у них были порты. Прежде чем они стали известны как купцы, их могли нанять или заменить семиты с востока. То была часть большого западного передвижения семитов, которое породило захват гиксосами Египта. Не исключено, что к ним добавились Pulesata, осевшие на берегах Ханаана. Их культура, как показывает обнаруженная керамика, подверглась эгейскому влиянию.