Схимонахиня Марфа (в миру — Мария Петровна Протасьева) происходила из Костромских дворян. Лишившись матери почти в младенчестве, она росла под надзором бабушки. Часто бывая с нею в монастырях, Мария слушала рассказы о подвижниках и подвижницах, сама постилась и много молилась.
Зная, что отец ни за что не отпустит её в монастырь, она решила по примеру некоторых древних святых тайнооставить родительский дом. Выбрав удобное время, накануне того дня, когда в доме отца готовился бал, она, написав письмо отцу, бежала, но была настигнута посланной погоней и возвратилась. Вскоре, однако, она умолила отца отпустить её в Костромской монастырь.
Там Мария Петровна взялась ухаживать за одной схимонахиней высокой духовной жизни: носила ей воду, дрова, топила печь, готовила пищу. От родных, часто посещавших Марию Петровну, она первое время тщательно скрывала свои монастырские труды.
Однажды Мария Петровна услышала от проезжавших чрез Кострому санаксарских монахов о преподобном старце Феодоре (Ушакове), который в то время томился в ссылке в монастыре на Соловецких островах, посреди Белого моря, и возымела твёрдое намерение отправиться к нему, чтобы просить его руководства к богоугодной жизни.
Несмотря на все неудобства и трудности далёкого пути, она добралась до Соловецкого монастыря, разыскала там отца Феодора и обратилась к нему за наставлениями. Старец посоветовал ей поступить в не имевшую тогда ещё статуса монастыря Арзамасскую Алексеевскую общину.
Послушно и со смирением приняла Мария Петровна этот совет и в 1782 году вступила в Алексеевскую общину, а чрез год имела утешение вместе с другими сёстрами встретить отца Феодора, возвращавшегося из Соловецкого монастыря в Санаксар.
Преподобный Феодор часто навещал Алексеевскую общину и пёкся о её благоустройстве. Заметив, что первая настоятельница, Евдокия Ивановна, достигнув преклонных лет, уже тяготится своими обязанностями, он благословил на настоятельство Марию Петровну, которой было тогда ещё только 26 лет. Вначале многие сестры смущались тем, что настоятельница их так молода, но потом, видя её подвижническую жизнь и мудрое управление, успокоились.
Мария Петровна отличалась кротостью и терпением, незлобиво переносила все болезни и неприятности. На подчинённых старалась действовать не строгостью, а убеждением и любовью. Усугубляя свои подвиги, она тайно приняла схиму и наречена была именем Марфа.
По смерти старца Феодора матушка Марфа обратилась за руководством к преподобному Паисию (Величковскому), и отец Паисий не отказал ей. В одном из писем к схимонахине Марфе он разъясняет важность послушания как основания монашеской жизни: «Огонь пришел Я низвести на землю и как желал бы, чтобы он уже возгорелся!» (Лк. 12, 49). Этот Божественный огонь восприняли в свои сердца святые апостолы и, возгоревшись к Господу пламенной любовью, оставили мир и всё, что в мире, и последовали за Христом. Они предали себя Ему и душой, и телом, отвергли и свою волю, и свое рассуждение, так что с великою радостью могли говорить: «Вот, мы оставили все и последовали за Тобою» (Мф. 19, 27). Это святое послушание Господу они сохранили в своих сердцах до конца жизни, запечатлели его перенесением бесчисленных искушений и многообразных смертей и излиянием своей крови до последней капли...
Этот же огонь Божественной благодати восприняли все святые истинные рабы Христовы, всякого чина и звания люди, тщательно соблюдавшие душеспасительные заповеди Евангельские, без исполнения которых при одной вере православной спастись невозможно... Божественное послушание столь необходимо для истинного богоугождения, что без него никак невозможно служить Богу».
В заключение письма преподобный Паисий убеждает схимонахиню Марфу подавать своею жизнью пример сёстрам, над которыми она поставлена начальницей. «Наставляй их, — пишет старец, — на путь спасения, показывая им пример всякого доброго дела при помощи Божией, прилежным исполнением заповедей Евангельских, любовью к Богу и ближнему, кротостью и смирением, глубочайшим всегда ко всем миром Христовым, материнским милосердием, терпением и долготерпением...
Прилежно, с великим вниманием и размышлением, прочитывай в отеческих книгах о молитве, умом в сердце совершаемой, которая есть самый истинный, наиболее приятный Богу, монашеский подвиг...
Понудь себя никого не осуждать, ибо один есть праведный Судия Христос Господь, который каждому воздаст по делам его, осуждай только себя и не будешь осуждена на Его втором и страшном пришествии. Всякому, согрешающему перед тобою, от всего сердца отпускай согрешения, да и Отец Небесный отпустит тебе согрешения твои». Этими наставлениями заканчивается письмо старца Паисия к схимонахине Марфе (Протасьевой).
Матушка переписывалась и с преемником преподобного Паисия (Величковского) по настоятельству в Нямецком монастыре архимандритом Софронием, который посылал для её обители иконы, портрет старца Паисия и рукописные экземпляры отеческих книг в переводе старца Паисия, чтобы испросить у митрополитов Платона и Гавриила помощи в их публикации.