Непосредственной причиной Войны за испанское наследство между Португалией и Кастилией была решимость кастильской знати не допустить на трон Хуану – дочь и наследницу Генриха IV и посадить на него Изабеллу Католичку. Хуана была племянницей Афонсу V; он женился на ней и стал претендовать на трон Кастилии. Следствием этого стали четыре года ожесточенной и разрушительной войны, которая быстро распространилась на Гвинею и острова. Португальская корона претендовала на монополию на торговлю с Гвинеей на основании того, что португальцы были ее первооткрывателями, а также на основании папских булл от 1454 и 1456 гг., согласно которым принц Энрике и орден Христа получали исключительное право и обязанность обращать в христиан местное население этого региона. Несмотря на притязания и папские буллы (обязывающая сила которых была спорной), корабли из андалусийских портов уже торговали в Верхней Гвинее еще до войны. Андалусийцы даже придумали собирать морские раковины в своих поселениях на Канарских островах и отправлять их на берег Африки, где их использовали в качестве денег. В 1475 г. Изабелла издала официальное разрешение своим подданным заниматься африканской торговлей, и в 1476 и 1477 гг. из Рио-Тинто стали выходить флотилии каперских кораблей с целью перехвата португальских кораблей, шедших домой с Золотого Берега. С португальской стороны в 1477 г. был послан флот Фернана Гомиша – как командующего офицера, а не как арендатора – с целью доставить продукцию Гвинеи в Португалию, который успешно проделал путь туда и обратно. Военные действия на протяжении всей войны отличались чрезвычайной жестокостью, пленных обычно вешали или выбрасывали за борт. Последняя крупная военная экспедиция испанцев, состоявшая из 35 парусников, вышла в море в 1478 г.; победы над ней португальцы добились благодаря искусному маневрированию и захватили много кораблей. В общем, в ходе военных действий на море и островах португальцы более чем не сдали своих позиций везде, кроме Канарских островов, где были испанские поселения. Как следствие, хотя на родине португальцы несли тяжелые поражения и отозвали все свои притязания на Кастилию, Алькасовасский договор, положивший конец войне в 1479 г., содержал статьи, регламентировавшие внешнюю торговлю и колонизацию, чрезвычайно благоприятные для Португалии. Кастилия сохранила за собой только Канарские острова. Кастильцы, согласно Пулгару, совершенно не хотели отходить от своих притязаний на торговлю с Золотым Берегом, но многие их корабли все еще находились в африканских водах и подвергались опасности перехвата. В конечном счете после очень упорных переговоров Кастилия согласилась на монополию Португалии на рыболовство, торговлю и плавание вдоль всего побережья Западной Африки, а португальцы дали гарантии безопасности испанским кораблям, возвращавшимся с Берега в конце войны. Алькасовасский договор был первым из длинного ряда европейских договоров, регулировавший колониальные сферы влияния, и в этом отношении был символом дипломатического триумфа португальцев.